糖类及其衍生物代谢相关基因在大鼠肝再生中表达方式和作用分析

摘要

糖类是细胞的能源物质、结构成份和生物活性成份。为在基因转录水平了解糖类代谢相关基因在大鼠肝再生中的作用，本文用搜集网站资料和查阅相关论文等方法获得糖类代谢相关基因，用Rat Genome2302.0芯片检测它们在大鼠再生肝中表达情况，用比较真、假手术中基因表达的差异性确定肝再生相关基因。初步证实97个参与单糖代谢的基因与肝再生相关。肝再生启动(PH后0.5～4h)、G0/G1过渡(PH后4～6h)、细胞增殖(PH后6～66h)、细胞分化和组织结构功能重建(PH后72～168h)等四个阶段起始表达的基因数为31、12、63和3；基因的总表达次数为68、38、295和84。表明相关基因主要在肝再生启动阶段起始表达，在不同阶段发挥作用。它们表达的相似性分为均上调、上调占优势、均下调、下调占优势、上调和下调相近等5类，涉及37、7、35、10和8个基因，共上调238次，下调209次。表明肝再生中多数单糖代谢基因表达加强，少数基因表达降低。分为9种表达方式，表明肝再生中细胞生理生化活动多样和复杂。根据肝再生中基因表达的时间相关性将上述基因分为0.5和1h、2h、4和6h、8和12h、16h、18和24h、30和42h、36h、48h、54和60h、66和72h、96h、120h、144和168h等14组，根据上述结果推测，糖酵解在肝再生早期增强，前期和中期减弱，后期转为正常水平。糖异生在肝再生早期、中期和后期增强，在前期略有减弱。葡萄糖转运在肝再生的16-24h和54-66h减弱，其它时段增强。
　　 107个参与多糖代谢的基因与肝再生相关。肝再生启动、G0/G1过渡、细胞增殖、细胞分化和组织结构功能重建等四个阶段起始表达的基因数为43、10、61和3；基因的总表达次数为81、44、358和106。表明相关基因主要在肝再生启动阶段起始表达，在不同阶段发挥作用。它们表达的相似性分为均上调、上调占优势、均下调、下调占优势、上调和下调相近等5类，涉及32、14、35、14和12个基因，共上调266次，下调279次。表明肝再生中多糖代谢相关基因上调和下调表达情况相近。按功能不同可分为8种表达方式。表明肝再生中细胞生理生化活动多样和复杂。它们表达的时间相关性分为0.5和2h、1h、4和6h、8和12h、16h、18h、24h、30h、36和60h、42和96h、48和54h、66h、72和168h及120和144h等14组。依据相关基因的表达变化推测，肝再生中糖原和糖氨聚糖合成减少，糖蛋白和糖脂(主要为神经节苷脂)的合成增加。
　　 30个调节单糖代谢的转录因子基因及它们的16个下游基因与肝再生相关。肝再生启动、G0/G1过渡、细胞增殖、细胞分化和组织结构功能重建等四个阶段起始表达的基因数为22、7、22和2；基因的总表达次数为60、32、197和67。表明相关基因主要在肝再生启动阶段起始表达，在不同阶段发挥作用。它们表达的相似性分为均上调、上调占优势、均下调和下调占优势4种，涉及21、6、13和6个基因，共上调223次，下调101次，表明肝再生中多数单糖代谢基因表达加强，少数表达降低。分为9种表达方式。表明肝再生中细胞生理生化活动多样和复杂。它们表达的时间相关性分为0.5h、1和2h、4和6h、8和12h、16h、18和24h、30和42h、36h、48和60h、54h、66和72h、96h、120h、144和168h等14组。根据上述结果推测，再生肝中单糖分解与合成代谢增强，肝再生早期和前期单糖转运增强，中期和后期减弱。

目录

文摘

英文文摘

论文说明:缩略语表

声明

第一章文献综述

1.肝再生研究进展

1.1肝再生

1.2肝再生的动物模型

2.糖类代谢与肝再生

3.本论文的研究目的和意义

4.参考文献

第二章单糖及其衍生物代谢相关基因在大鼠肝再生中表达方式和作用分析

1.引言

2.材料与方法

2.1再生肝制备

2.2总RNA提取与纯化

2.3 cDNA、cRNA的合成和纯化

2.4 cRNA片断化和芯片检测

2.5芯片检测参数的获取

2.6芯片检测参数的校正

2.7肝再生相关基因的确认

3.结果

3.1单糖代谢相关基因在大鼠肝再生中表达动态

3.2单糖代谢相关基因在大鼠肝再生中起始表达与总表达情况

3.3单糖代谢相关基因在大鼠肝再生中表达的相似性和时间相关性

3.4单糖代谢相关基因在大鼠肝再生中的表达方式

4.讨论

5.参考文献

第三章多糖及其衍生物代谢相关基因在大鼠肝再生中表达方式和作用分析

1.引言

2.材料与方法

3.结果

3.1多糖代谢相关基因在大鼠肝再生中表达动态

3.2多糖代谢相关基因在大鼠肝再生中起始表达与总表达情况

3.3多糖代谢相关基因在大鼠肝再生中表达的相似性和时间相关性

3.4多糖代谢相关基因在大鼠肝再生中的表达方式

4.讨论

5.参考文献

第四章调节单糖代谢的转录因子基因在大鼠肝再生中表达方式和作用分析

1.引言

2.材料与方法

3.结果

3.1调节单糖代谢的转录因子基因在大鼠肝再生中表达动态

3.2调节单糖代谢的转录因子基因在大鼠肝再生中起始表达与总表达情况

3.3调节单糖代谢的转录因子基因在大鼠肝再生中表达的相似性和时间相关性

3.4调节单糖代谢的转录因子基因在大鼠肝再生中的表达方式

4.讨论

5.参考文献

总结与结论

1.总结

2.结论

攻读硕士学位期间参加的科研项目及已发表和待发表的论文

1.参加的科研项目

2.已发表及待发表的论文

致谢