实验动物贵州白香猪母系及父系遗传检测

摘要

为了研究实验用动物贵州白香猪的遗传结构和遗传背景，本研究采用PCR测序技术对贵州白香猪 I系和II系30个个体线粒体 DNA D-loop区全序列和10个雄性个体 Y染色体上的SRY基因编码区序列进行了序列测定，并结合GenBank上已发表的同源序列，进行了群体遗传结构及分子系统发育分析，得到如下结果：
　　1．贵州白香猪线粒体 D-loop区全长为1118、1128和1138bp三种不同长度。A、T、G、C碱基的平均含量分别为31.6％、24.7％、17.1％和26.6％，A＋T含量（56.3％）明显高于G＋C含量（43.7％）。D-loop区核苷酸多样性（Pi）为0.00119，平均核苷酸差异数（k）为1.333。
　　2．贵州白香猪两品系的30个个体共检测到3种线粒体单倍型，GZWXI8、GZWXI12和GZWXII230。I系15个被检测个体占有全部这三种单倍型，II系15个被检测个体只占有其中的一种单倍型 GZWXII230。在30个个体中，有4个个体共享单倍型 GZWXI12，10个个体共享单倍型 GZWXI8，16个个体共享单倍型GZWXII230，其中包含1个I系个体。
　　3．贵州白香猪 II系15个被检测个体当中只存在1种线粒体单倍型 GZWXII230。I系116号个体共享单倍型 GZWXII230，这与II系猪是从 I系猪当中选育出来的培育事实相符。I系猪中检测到较多单倍型，需进一步选育提纯。
　　4．I系、II系猪线粒体 D-loop序列与GenBank上收录的49个猪品种同源序列比对，检测到42个多态位点，界定了57种单倍型。贵州白香猪的两个品系与中国其它地方猪品种没有共享单倍型，说明贵州白香猪在母系遗传上具有独特的遗传结构。
　　5．通过进一步系统发生育分析，从构建的NJ系统树和UPGMA系统树来看，57种单倍型可分为A、B两大类型：以中国猪种单倍型为主的A类和以欧洲猪种单倍型为主的B类。贵州白香猪处于A类，并单独聚为一小类。
　　6．本研究还检测了国内外14个家猪品种（类群）及中国野猪，共计75个雄性个体的Y染色体 SRY基因，结果表明该基因编码区序列长为711bp，检测到6个多态位点，界定了6种单倍型。贵州白香猪 I系和II系的10个样本在SRY基因编码区未观察到核苷酸序列变异。与国内其它地方猪品种、5头中国野猪的SRY基因同源序列进行比对，除个别个体有差异外，绝大多数个体共享1种单倍型 GZWXI，表明中国家猪具有共同的父系起源。
　　7．约克夏（Yorkshire）、杜洛克（Duroc）、长白（Landrace）和汉普夏（Hampshire）4个欧洲猪种绝大多数个体共享1种单倍型 Yorkshire。单倍型 GZWXI与单倍型Yorkshire在136bp和638bp处有2个主要变异位点，分别为G/C颠换和C/G颠换。
　　8．根据检测到的SRY基因单倍型，利用MEGA软件构建分子系统树，结果显示：中国猪种（包括5头野猪）与欧洲猪种可聚为A、B两大支。

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封面

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中文摘要

英文摘要

前 言

第一章 文献综述

1. 小型猪在医学实验中的应用

2. 实验动物遗传检测意义及方法

3. 线粒体DNA分子遗传标记

4．Y 染色体遗传标记

5. 本研究的目的和意义

第二章 实验材料与方法

1. 实验材料

2．实验方法

第三章 结果与分析

1. 线粒体 D-loop 区结果与分析

2. SRY 基因实验结果与分析

第四章 讨 论

1. 贵州白香猪的母系遗传结构

2. 贵州白香猪的父系遗传结构

3. PCR 条件的优化

第五章 小 结

致谢

参考文献

附录 I

附录II 英文缩略词表

图版

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