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贵州白山羊控制繁殖率性状的主效基因研究

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第一章 前 言

1 生长分化因子 9 (GDF9) 基因的研究进展

2 骨形态发生蛋白 l5(BMP15)基因的研究进展

3 分子标记在畜禽遗传育种中的应用

4 贵州白山羊的研究概况

5 论文研究的目的和意义

第二章 材料与方法

2.1 实验样品采集来源和方法

2.2 主要实验仪器和设备

2.3 主要试剂

2.4 有关试剂和溶液的配制

2.5 分析工具软件

2.6 实验方法

2.7 实验数据分析

第三章 结 果

3.1 基因组的提取结果

3.2 GDF9 基因外显子 2 编码区第 1007 位的多态性研究

3.3 BMP15 基因外显子 2 成熟肽的多态性研究

3.4 贵州白山羊 GDF9 基因 2 个多态性位点的不同基因型与产羔数的关联性分析

3.5 贵州白山羊 BMP15 基因 2 个多态性位点的基因型与产羔数的关联性分析

第四章 讨 论

4.1 实验材料的选择

4.2 实验方法的选择

4.3 GDF9 基因多态性与贵州白山羊的繁殖力关系

4.4 BMP15 基因多态性与贵州白山羊繁殖力的关系

第五章 小 结

致谢

参考文献

缩 略 语 表

附 录

声明

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摘要

生长分化因子9(growth differentiation factor9, GDF9)和骨形态发生蛋白15(bone morphogenetic protein15, BMP15)基因是转化生长分化因子β(transformi-ng growth factorβ, TGFβ)超家族的成员,对早期卵泡的生长和分化起到重要的调节作用。对贵州白山羊 GDF9和BMP15基因成熟肽序列的分析表明,GDF9基因外显子2编码区1007位、790位和BMP15基因外显子2编码区的571位、673位和796位出现了碱基替换,并导致编码的氨基酸发生了改变,为了进一步探索这5个多态性位点与贵州白山羊繁殖力之间的关系,采用等位基因特异 PCR(AS-PCR)的方法对5个位点氨基酸密码子所在的区域进行扩增,克隆、测序和基因型分析,获得的主要结果如下:
  1、GDF9基因外显子2编码区1007位(C→T)和790位(C→A)分别使成熟肽第18位氨基酸由丙氨酸替换为缬氨酸,成熟肽第78位氨基酸由脯氨酸转变谷氨酰胺,在贵州白山羊高产和低产羊群中进行多态性检测,结果表明:1007位点在高产羊群中90%为杂合型,低产羊群中全部为杂合型,没有检测到突变型,基因型频率在两种羊群之间的差异不显著(P>0.05),而C1007T氨基酸之间的替换为非极性氨基酸之间的替换,且该位点不处于GDF9蛋白的关键位置,所以碱基多态性变化对蛋白功能影响不大,因此1007位点的多态性与贵州白山羊的繁殖力没有直接的相关性。第790位点中共检测到 AA和AB两种基因型,频率分别为:高产羊群0.1和0.9;低产羊群0.17和0.83,A等位基因的频率高于B等位基因的频率,其产羔数为AB>AA基因型,两种基因型之间的差异性显著(0.010.05)。
  2、BMP15基因外显子2编码区571位(A→G)、673位(A→C)和796位(G→A)分别使编码的成熟肽32位氨基酸由丝氨酸转变为甘氨酸;成熟肽66位由天冬酰胺/组氨酸;成熟肽107位由甘氨酸/精氨酸。多态性检测结果表明:673位点在所检测的贵州白山羊中只检测到野生的AA基因型,没有发现多态性,该位点位于BMP15结构的手掌内侧,其变化不足以影响结构的稳定性,因此与贵州白山羊的繁殖力无关。571位点在高产羊群中检测到AA、AB和BB基因型,低产羊群中只检测到AA和AB基因型,796位点在高产羊群和低产羊中都检测到AA、AB和BB三种基因型,对其进行的各种基因型与产羔数的差异性分析发现,571位点和796位点的产羔数依次为AA

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