声明
摘要
第一章 文献综述
一 分子标记概述
1 以杂交技术为核心的分子标记
2 以PCR技术为核心的分子标记
3 PCR与限制性酶切技术结合的分子标记
4 以测序和芯片技术为核心的分子标记
5 基于特定序列的分子标记
二 遗传图谱的构建与应用
1 遗传图谱的定义和理论基础
2 遗传图谱的构建过程
3 遗传图谱的应用前景
三 雌核发育研究进展
1 人工诱导雌核发育的原理
2 人工诱导雌核发育的方法
3 人工诱导雌核发育后代鉴定
4 雌核发育的意义和应用前景
四 文昌鱼概述
1 文昌鱼的科研价值和经济价值
2 文昌鱼分类学和遗传多样性研究
3 文昌鱼养殖和育种研究
五 选题意义和研究目的
参考文献
第二章 短刀侧殖文昌鱼的属名及线粒体基因组结构
一 材料和方法
1 样品采集、形态鉴定和基因组提取
2 线粒体基因组DNA扩增和序列测定
3 线粒体基因组序列分析
4 遗传距离和系统发生关系分析
二 结果
1 短刀侧殖文昌鱼形态特征
2 线粒体基因组结构
3 遗传距离
4 系统发生关系
三 讨论
1 短刀侧殖文昌鱼线粒体基因组
2 短刀侧殖文昌鱼属名及Asymmetron属的有效性
参考文献
第三章 基于COXⅠ基因的文昌鱼遗传多样性及地理种群分化研究
一 材料和方法
1 样本采集
2 基因组DNA提取和COXⅠ基因片段扩增
3 测序和序列分析
二 结果
1 太平洋西岸Branchiostoma属的文昌鱼种类
2 种间差异和地理种群的遗传分化
3 文昌鱼种群的遗传多样性
三 讨论
1 太平洋西岸文昌鱼的种类
2 太平洋西岸三种文昌鱼的分布和遗传多样性
参考文献
第四章 白氏文昌鱼微卫星标记开发
一 材料和方法
1 样品来源
2 引物和试剂
3 磁珠富集文库法筛选白氏文昌鱼微卫星标记
4 数据库筛查法筛选白氏文昌鱼微卫星标记
二 结果
1 白氏文昌鱼微卫星富集文库
2 白氏文昌鱼数据库筛查
三 讨论
1 开发微卫星位点的方法
2 文昌鱼微卫星位点的特征
参考文献
第五章 基于微卫星标记的白氏文昌鱼遗传多样性研究
一 材料和方法
1 样本采集和基因组提取
2 微卫星位点的PCR扩增
3 计算遗传多样性参数
二 结果
1 微卫星位点的多态性
2 微卫星位点的适用性
3 白氏文昌鱼遗传多样性
三 讨论
1 哈迪-温伯格平衡与无效等位基因现象
2 连锁不平衡与位点的适用性
3 文昌鱼群体遗传多样性水平及保护策略
参考文献
第六章 文昌鱼全同胞家系建立及早期生长发育
一 材料和方法
1 日本文昌鱼全同胞家系建立
2 白氏文昌鱼全同胞家系建立
二 结果
1 日本文昌鱼全同胞家系的存活与变态
2 日本文昌鱼不同家系间早期发育模式的比较及成因
3 日本文昌鱼家系畸形与死亡
4 白氏文昌鱼全同胞家系的存活与变态
三 讨论
1 文昌鱼全同胞家系建立的可行性
2 发育模式与仔鱼存活的关系
3 文昌鱼幼体主要死因的解决办法
参考文献
第七章 文昌鱼遗传连锁图谱初步构建
一 材料和方法
1 作图群体的构建和选择
2 作图标记的来源和筛选
3 微卫星分型结果统计
4 连锁图谱构建和整合
5 连锁图谱长度和覆盖率计算
二 结果
1 作图群体
2 微卫星分型结果
3 遗传连锁图谱
三 讨论
1 作图策略和作图群体
2 作图标记的选择
3 标记的偏分离现象
4 遗传图谱的评价
参考文献
第八章 人工诱导文昌鱼雌核发育的研究
一 材料和方法
1 亲本来源及精卵获取
2 紫外线灭活精子最佳剂量筛选
3 冷休克法诱导卵子加倍条件的探索
4 染色体倍性检测
5 胚胎孵育和幼体饲养
二 结果
1 文昌鱼单倍体综合症
2 紫外线照射对精子活力的影响
3 冷休克起始时间和持续时间对加倍率的影响
4 染色体倍性检测结果
5 文昌鱼雌核发育个体的生存能力
三 讨论
1 紫外线照射对文昌鱼精子活力和胚胎发育的影响
2 冷休克法诱导文昌鱼卵子加倍的条件
3 文昌鱼雌核发育二倍体的生存能力
4 文昌鱼性别决定方式
5 文昌鱼雌核发育成功的意义
参考文献
论文总结与创新点
附表1 用于图谱构建的白氏文昌鱼微卫星位点
博士期间发表论文
致谢