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同源重组与Gibson Assembly方法构建腺病毒载体对比

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综述:腺病毒载体疫苗的特点及研究进展

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摘要

目的:腺病毒广泛存在于自然中,能通过呼吸道、消化道、眼粘膜等途径感染动物和人,无论增殖和非增殖细胞也都可以被感染,对人类的致病性低,且与人类基因组同源,不会整合到人染色体中,不会导致染色体突变。如果用腺病毒作为特异性DNA序列呈递载体,将具有感染效率高、安全性好、多种给药途径、成本易控制、便于保存等优势。本研究用传统同源重组与近年来开发的Gibson Assembly及两者相结合三种构建腺病毒载体的方法进行构思、设计、制作和对比,并做出评价,为腺病毒载体构建提供依据和经验。
  方法:将E1区、E3区、蛋白IX缺损的AD4(4型腺病毒)感染入Hela229细胞,使其在细胞中感染、增殖72小时,并用超滤管提取AD4 DNA。分为三组进行实验:第一组用同源重组方法,经PCR将pBR322质粒中扩增左右两条同源臂,同源臂与AD4 DNA两端同源,将AD4 DNA镶嵌入pBR322质粒,构建出携带全长AD4 DNA的腺病毒载体。第二组用Gibson Assembly方法,将AD4 DNA分成4段(每段10kbp左右)和pBR322质粒,共5段DNA,两侧均设计30bp左右同源臂,用PCR分别扩增,再用Gibson Assembly方法将数段基因连接起来。第三组用Gibson Assembly和同源重组相结合方法,将DY330中含有kil和Red基因的一段基因组及第一组中的pBR322质粒及左右两条同源臂,共4段DNA,分别用PCR分别扩增,用Gibson Assembly方法将4段DNA连接,再与全长AD4 DNA进行同源重组。三组方法构建的腺病毒载体进行测序等鉴定,比较三种方法构建腺病毒载体的效价。
  结果:经鉴定,用同源重组方法构建腺病毒载体:培养平板中菌落数量大于1000个,对其中360个鉴定,阳性结果有1个。用Gibson Assembly方法构建腺病毒载体:培养平板中菌落数量有112个,对其中10个鉴定,阳性结果有3个。用Gibson Assembly和同源重组相结合方法构建腺病毒载体:培养平板中菌落数量有65个,鉴定所以菌落,无阳性结果。
  结论:比三种方法,Gibson Assembly方法比同源重组方法更加简单、高效、灵活多变。两者结合的方法败。

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