福州地区急性呼吸道感染患儿HCoV-HKU1、HCoV-OC43、RSV感染的检测及分析

摘要

目的: 探讨福州地区急性呼吸道感染患儿中新型人类冠状病毒HKUl(Human Coronavirus HKUl，HCoV-HKUl)、呼吸道合胞病毒(Respiratory Syncytial Virus，RSV)、人类冠状病毒OC43(Human Coronavirus OC43，HCoV-OC43)的感染情况，并探讨其临床意义。 方法: 收集2006～2007年冬春季福建省立医院门诊和住院急性呼吸道感染患儿咽拭子标本176例。其中上呼吸道感染115例，下呼吸道感染61例。分别利用单一逆转录-聚合酶链反应(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction，RT-PCR)和多重RT-PCR(multiplex RT-PCR，mRT-PCR)检测HCoV-HKUl pol基因、RSV N基因、HCoV-OC43 S基因片段。对RSV阳性的标本同样分别利用单一RT-PCR和mRT-PCR检测A、B亚型的G基因进行亚型分析。对部分阳性产物进行测序鉴定，并将HCoV-HKUl、HCoV-OC43所测序列进一步进行同源性分析以及系统进化树分析。 结果: 1、176例标本中，共检出HCoV-HKU1阳性1例(0.6％)，HCoV-OC43阳性9例(5.1％)，RSV阳性28例(15.9％)。 2、唯一1例HCoV-HKU1阳性患者同时合并感染RSV。 3、随机选取2例HCoV-OC43阳性扩增产物进行序列测定，结果分析显示核苷酸序列完全一致，与GenBank中HCoV-OC43部分代表株序列一致性达96％以上，氨基酸一致性达100％。 4、HCoV-HKU1阳性扩增产物核苷酸序列与GenBank中HCoV-HKU1代表株序列一致性达99％以上，氨基酸同源性达100％；系统进化树分析显示与HCoV-HKU1C基因型代表株(DQ415913)亲缘关系最近。 5、28例RSV阳性标本中，急性下呼吸道感染组阳性率为37.7％(23/61)，显著高于急性上呼吸道感染组的4.3％(5/115)(x2=33.15,P<0.05)。 6、RSV亚型检测显示，A亚型23例(82％)，B亚型4例(14％)，不明分型1例(4％)；上、下呼吸道感染组患者间RSV亚型分布差异无显著性(P>0.05)，都以A亚型为主。 7、RSV阳性患儿的年龄以3岁以下为主。 结论: 1、RSV和HCoV-OC43是福州地区2006～2007年冬春季急性呼吸道感染患儿的重要病毒病原。HCoV-HKU1感染可能与福州地区儿童下呼吸道感染存在相关性。 2、RSV与HCoV-HKU1合并感染可能是造成患儿呼吸道疾病加重的重要原因。 3、RSV主要引起急性下呼吸道感染，且以3岁以下婴幼儿易感。 4、2006～2007年度福州地区RSV两种亚型同时流行，以A亚型为主。 5、多重RT-PCR方法可代替单一RT-PCR进行HCoV-HKU1、HCoV-OC43、RSV的检测。

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新型人类冠状病毒HCoV-HKU1的研究进展