利用ISSR分子标记分析甘蔗及其近缘属植物的遗传相似性和关系

摘要

ISSR(Inter-simple sequence repeat polymorphic DNA)分子标记在11个甘蔗及其近缘属供试材料中,以简单重复序列为引物(来自UBC＃9),通过PE9600扩增仪扩增和1.5﹪凝胶电泳,从100个引物中得到32个引物的清晰特异图谱.这100个引物为以二核苷酸、三核苷酸、四五核苷酸、5′兼并序列为单位的重复序列.出现清晰特异条带的二核苷酸重复序列引物19个,三、四、五核苷酸和5′兼并基序引物分别有3、2、3和4个.引物(AC)<,n>产生的多态性条带最多,其次是5'兼并基序引物和(GT)<,n>.所有(AG)<,n>(6个)引物和6个(TC)<,n>引物中5个扩增出多态性条带,这暗示在甘蔗中存在大量的AG/TC二核苷酸重复.总的看,不同属间平均出现11.6条多态性条带,种间有9.5条,种内6.6条.对32个引物的特征图谱按Nei-Li方法进行聚类分析,得到的树状图与Irvine等(1998年)研究结果非常相似,一组包括热带种、中国种、印度种和大茎野生种;另一组只有割手密.

目录

1前言

1.1国内外外甘蔗育种成就

1.2甘蔗起源分类鉴定的不确定性

1.3分子标记的国内外发展现状

1.4微卫星标记及其特点

1.5本课题的研究意义

2材料和方法

2.1供试材料

2.1.1植物材料

2.1.2引物

2.2研究方法

2.2.1核基因组的DNA的提取

2.2.2反应体系

2.2.3反应程序

2.2.4结果显示

2.3分析方法和软件

3结果与分析

3.1 ISSR反应体系的建立

3.1.1 Mg离子浓度的确定

3.1.2 PCR程序的建立

3.2.甘蔗及其近缘属植物间多样性分析

3.2.1多态性引物的筛选

3.2.2甘蔗种属间多态性差异

3.2.3甘蔗种属间亲缘关系与分类

3.3不同来源割手密多态性分析

3.4甘蔗属与斑茅杂种的鉴定分析

4讨论

4.1甘蔗种属间的分子分类鉴定

4.2割手密的遗传多样性

4.3甘蔗杂交后代与父母本亲缘关系

4.4 ISSR标记在甘蔗分类进化上的应用

参考文献

致谢