数量性状标记辅助选择的计算机模拟研究

摘要

随着分子标记技术的发展,已定位出许多控制动植物重要经济性状的效应较大的数量性状基因座(QTL).然而,已提出的两种MAS方法都未能有效利用这些已知信息(包括QTL的位置和效应).为了有效利用这些信息,提高MAS的选择效率,该研究发展了三种新的MAS方法,即:基因型-标记值-表型值选择(GMPS).GPS是在每一代中,先用较大的群体在苗期依据双侧标记的基因型对已定位的QTL(简称已知QTL)进行选择,然后在由基因型中选个体组成的亚群体中,对中选个体的表征值进行校正(去除已知QTL的效应),再依据校正表型值进行选择.当已知QTL完全纯合后,则以后世代只进行PS.GMS与GPS相似,在每一代中先对已知QTL进行基因型选择,然后对中选个体用校正标记值,作为再次选择的依据.当已知QTL完全纯合后,则以后世代只进行MS.GMPS与GMS相似,在每一代中先对已知QTL进行基因型选择,然后依据校正标记值选择.当已知QTL完全纯合后,则以后世代只进行PS.用蒙特卡罗方法(Monte Carlo),通过计算机模拟,对新方法(GPS、GMS和GMPS)的有效性和稳定性与传统的选择方法PS和已有MAS方法MS和IS进行了系统的比较.

目录

缩写符号

1前言

2文献综述

2.1分子遗传标记

2.2标记辅助回交

2.3标记辅助基因型值选择：多元回归法

2.4标记辅助基因型值选择：BLUP法

2.5标记辅助基因型选择

3材料与方法

3.1材料

3.2选择方法

3.2.1表型值选择

3.2.2标记值选择

3.2.3指数选择

3.2.4基因型-表型值选择

3.2.5基因型-标记值选择

3.2.6基因型-标记值-表型值选择

3.3计算机模拟

3.3.1参数设置

3.3.2模拟方法

3.3.3程序设计

3.4选择效果评价

3.4.1遗传进度

3.4.2稳定性

4结果与分析

4.1遗传率对选择效果的影响

4.1.1累计遗传进度

4.1.2累计遗传进度方差

4.2连锁方式对选择效果的影响

4.2.1累计遗传进度

4.2.2已知QTL引起的遗传进度

4.2.3未知QTL引起的遗传进度

4.2.4累计遗传进度方差

4.3群体大小对选择效果的影响

4.2.1累计遗传进度

4.2.2累计遗传进度方差

4.4已知QTL数对选择效果的影响

4.4.1累计遗传进度

4.4.2已知QTL引起的遗传进度

4.4.3未知QTL引起的遗传进度

4.4.4累计遗传进度方差

4.5基因型选择所用群体的大小对选择效果的影响

4.2.1累计遗传进度

4.2.2已知QTL引起的遗传进度

4.2.3未知QTL引起的遗传进度

4.2.4累计遗传进度方差

5结论与讨论

参考文献

致谢