辣椒中PMMoV的检测及枣树病毒的鉴定

摘要

植物病毒病是作物上的一类重要病害，种类多，传播途径广,且缺少有效的防治药剂和措施。因此，植物病毒病一旦流行,就会给农业生产造成惨重损失。明确病毒种类及传播途径是防治病毒病的关键。鉴于此，本研究主要围绕辣椒中辣椒轻斑驳病毒(Pepper mild mottle virus, PMMoV)的检测和枣树病毒的鉴定展开，进一步明确了PMMoV的发生分布及传播途径，并初步鉴定出枣树中几种新病毒，为相关病毒病的防控奠定了理论基础。
　　PMMoV侵染辣椒后，使辣椒呈现叶片皱缩、果实变小等症状，对辣椒生产危害极大，而且是第一个已知的可能危及人类健康的植物病毒。本研究利用RT-PCR技术对我国部分地区鲜食辣椒和辣椒加工品中的PMMoV进行了检测。其中，鲜食辣椒样品中PMMoV检出率为75.5％，在各主要产区发生率均比较高且没有明显的地区差异性；147份辣椒加工品中有97份检测到PMMoV，且所采集的每一类别的辣椒制品中都有阳性样品。这表明 PMMoV不仅广泛分布于我国辣椒种植区，而且在多种辣椒加工品中的侵染率较高。PMMoV在辣椒深加工品（如酱菜、泡菜）中的存在验证了PMMoV粒子的稳定性。该研究进一步明确了PMMoV的发生分布及可能的传播途径，为该病毒的防控提供了理论依据。
　　枣树是具有民族特色的优势树种，是我国果树发展中的一个新热点。到目前为止，在枣树上没有任何关于病毒的报道。本研究对枣树中可能存在的病毒进行了鉴定，对采自新疆的有200年树龄的枣树样品进行了高通量测序，发现该枣树样品中含有多种杆状DNA病毒（Badnavirus），并获得其中一种的基因组序列，暂时将其命名为枣树杆状 DNA病毒1（Jujube badnavirus1， JBV-1）。JBV-1基因组为双链环状DNA，全长为6461 bp。基因组正链包含7个开放阅读框（Open reading frames, ORFs），包括3个杆状DNA病毒保守的ORFs，前两个ORFs编码2个不同的小的蛋白，第3个ORF编码一个大的多聚蛋白。基于病毒全长核酸序列构建的系统发育树结果显示，JBV-1与其他杆状DNA病毒处于同一分组中，与天竺葵镶脉病毒（Pelargonium vein banding virus, PVBV）的亲缘关系最近。
　　本研究首次对枣树上的病毒进行了鉴定，为研究枣树病毒的生物学特性奠定了基础，为进一步明确我国枣树病毒种类及防治病毒危害奠定了重要基础。

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第一章 引 言

1.1 植物病毒病及检测技术

1.2 辣椒轻斑驳病毒及研究进展

1.3 枣树病害

1.4 杆状DNA病毒

1.5 研究目的、意义及技术路线

第二章 我国部分地区鲜食辣椒及其加工品中PMMoV的检测

2.1 实验材料

2.2 实验方法

2.3 结果

2.3 讨论

第三章 枣树中病毒的检测与鉴定

3.1 实验材料

3.2 实验方法

3.3 结果

3.4 讨论

第四章 枣树杆状DNA病毒全基因组序列的扩增及分析

4.1 实验材料

4.2 实验方法

4.3 结果

4.4 讨论

第五章 全文结论

参考文献

附录

致谢

作者简历