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Ontologies for molecular biology

机译:分子生物学本体

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摘要

Molecular biology has a communication problem. There are many databases using their own labels and catagories for storing data objects and some using identical labels and catagories but with a different meaning. A prominent example is the concept "gene" which is used with different semantics by major international genomic databases. Ontologies are one means to provide a semantic repository to systematically order elevant concepts in molecular biology and to bridge the different notions in varous databases by explicitly specifying the maeaning of and relation between the fundamental conepts in an application domain. Here, the upper level and a database branch of a prospective ontology for molecular biology (OMB) is presented and compared to other ontologies with respect to suitability for molecular biology (htto://igd.rz-berlin.mpg.de/approxwww/oe/mbo.html).
机译:分子生物学有一个交流问题。有许多数据库使用其自己的标签和类别存储数据对象,有些数据库使用相同的标签和类别但含义不同。一个著名的例子是“基因”的概念,国际主要基因组数据库使用了不同的语义。本体是一种提供语义库的方法,通过在应用领域中明确指定基本概念的含义和相互关系,可以提供语义库以系统地对分子生物学中的概念进行排序,并桥接各种数据库中的不同概念。在这里,介绍了分子生物学(OMB)的前瞻性本体的高层和数据库分支,并就分子生物学的适用性与其他本体进行了比较(htto://igd.rz-berlin.mpg.de/approxwww/ oe / mbo.html)。

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