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A New Approach to Flux Coupling Analysis of Metabolic Networks

机译:代谢网络通量耦合分析的新方法

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摘要

Flux coupling analysis is a method to identify blocked and coupled reactions in a metabolic network at steady state. We present a new approach to flux coupling analysis, which uses a minimum set of generators of the steady state flux cone. Our method does not require to reconfigure the network by splitting reversible reactions into forward and backward reactions. By distinguishing different types of reactions (irreversible, pseudo-irreversible, fully reversible), we show that reaction coupling relationships can only hold between certain reaction types. Based on this mathematical analysis, we propose a new algorithm for flux coupling analysis.
机译:通量耦合分析是一种在稳定状态下识别代谢网络中的阻塞和耦合反应的方法。我们提出了一种通量耦合分析的新方法,它使用稳态磁通锥的最小发电机组。我们的方法不需要通过将可逆反应分成向前和向后反应来重新配置网络。通过区分不同类型的反应(不可逆,伪不可逆,完全可逆),我们表明反应偶联关系只能在某些反应类型之间保持。基于该数学分析,我们提出了一种新的磁通耦合分析算法。

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