首页> 外文会议>The 2005 Symposium on Applications and the Internet, 2005. Proceedings >Ab-initio molecular dynamics calculations: a parallelimplementation of the Car-Parrinello method
【24h】

Ab-initio molecular dynamics calculations: a parallelimplementation of the Car-Parrinello method

机译:从头算分子动力学计算:并行Car-Parrinello方法的实现

获取原文

摘要

We present a parallel implementation of the Car-Parrinello method(1985) for first principles molecular dynamics simulations, in theParallel Virtual Machine (PVM, version 3.3.4) environment on theCRAY-T3D computer. Parallelism is achieved at the Single ProgramMultiple Data (SPMD) level, dividing among processors the calculationson different columns of a large matrix, containing the electronicwavefunctions of a condensed matter system object of the simulation,written in a plane-wave basis. Fast Fourier Transforms (FFTs) of theseelectronic states are the heaviest computations in the program.Communications are avoided an most of the code, except where the columnsmust be orthogonalized among each other. Even if it is not possible tomake parallel the whole code, we have reached a parallel implementationof the most time-consuming part. We get an excellent behaviour of thispart, and a satisfactory global behaviour
机译:我们提出了Car-Parrinello方法的并行实现 (1985年)的第一原理分子动力学模拟, 并行虚拟机(PVM,版本3.3.4)上的环境 CRAY-T3D计算机。并行是在单一程序中实现的 多数据(SPMD)级别,在处理器之间划分计算 在大型矩阵的不同列上,包含电子 模拟的凝聚态系统对象的波函数, 以平面波为基础编写。这些的快速傅立叶变换(FFT) 电子状态是程序中最重的计算。 大部分代码都避免了通信,除非在各列中 必须彼此正交。即使不可能 使整个代码并行化,我们已经达到并行执行 最耗时的部分。我们得到了一个很好的表现 部分,以及令人满意的全球行为

著录项

相似文献

  • 外文文献
  • 中文文献
  • 专利
获取原文

客服邮箱:kefu@zhangqiaokeyan.com

京公网安备:11010802029741号 ICP备案号:京ICP备15016152号-6 六维联合信息科技 (北京) 有限公司©版权所有
  • 客服微信

  • 服务号