Advances in parallel supercomputing now make possible molecular-based engineering and science calculations that will soon revolutionize many technologies, such as those involving polymers and those involving aqueous electrolytes. We have developed a suite of message-passing codes for classical molecular simulation of such complex fluids and amorphous materials and have completed a number of demonstration calculations of problems of scientific and technological importance with each (described at the World Wide Web site http://flory.engr.utk.edu/ldrd). In this paper, we will focus on the molecular simulation of rheological properties, particularly viscosity, of simple and complex fluids using parallel implementations of non-equilibrium molecular dynamics. Such calculations represent significant challenges computationally because, in order to reduce the thermal noise in the calculated properties within acceptable limits, large systems and/or long simulated times are required.
并行超级计算的发展现在使基于分子的工程和科学计算成为可能,这将很快改变许多技术,例如涉及聚合物的技术和涉及水性电解质的技术。我们已经开发了一套用于这类复杂流体和无定形材料的经典分子模拟的消息传递代码,并且已经完成了对每种具有科学和技术重要性的问题的大量演示计算(在万维网站点上进行了描述,网址为http:// flory.engr.utk.edu/ldrd)。在本文中,我们将重点关注使用非平衡分子动力学的并行实现对简单和复杂流体的流变特性,特别是粘度进行分子模拟。这样的计算在计算上代表着巨大的挑战,因为为了将计算出的特性中的热噪声降低到可接受的范围内,需要大型系统和/或较长的仿真时间。 P>
机译:使用大规模并行超级计算机的复杂系统的分子模拟
机译:使用大规模并行超级计算机对土壤进行微机械模拟
机译:分子动力学模拟纳米金在平行金板中的流变性质
机译:使用大规模并行超级计算机的流变性质的分子模拟
机译:计算机中的生物分子组装:使用大规模并行模拟来探测蛋白质和RNA折叠动力学。
机译:Tinker-HP:大规模并行分子动力学软件包用于大型复杂系统的多尺度模拟具有先进的点偶极可极化力场
机译:使用大规模并行超级计算机的流变性质的分子模拟
机译:用大规模并行超级计算机进行流变特性的分子模拟