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Improving active contours for segmentation and tracking of motile cells in videomicroscopy

机译:在视频显微镜中改善活动轮廓以用于运动细胞的分割和跟踪

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摘要

We describe a method to segment and track motile biological cells in videomicroscopy data, based on parametric active contours. We propose improvements designed to overcome obstacles in applications to cellular imaging. To allow detection of low contrast pseudopodia, we use an edge map based on the local intensity deviation that better reflects cell/background boundaries. To allow correct segmentations of cells in contact, we introduce a repulsion effect between contours. The method performance is illustrated on real data.
机译:我们描述了一种基于参数活动轮廓在视频显微镜数据中分割和跟踪运动性生物细胞的方法。我们提出了旨在克服在细胞成像应用中遇到的障碍的改进措施。为了允许检测低对比度伪足,我们使用基于局部强度偏差的边缘图来更好地反映细胞/背景边界。为了正确分割接触的细胞,我们在轮廓之间引入了排斥作用。在实际数据上说明了方法的性能。

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