基于中国地鼠线粒体DNA 16S rRNA基因分子进化的研究

摘要

目的:实验通过克隆分析中国地鼠16S基因的部分序列,对中国地鼠16S基因的结构和功能进行初步探索和揭示.方法:从GenBank中已报到的啮齿动物16S基因保守区设计一对引物,进行PCR扩增,测序.用Blastn与GenBank中7种啮齿类动物的16S基因进行序列比较,分析其碱基组成及变异情况,并用邻接法(NJ)、非加权组平均法(UPGMA)构建分子系统树,在分子水平上探讨中国地鼠和其它啮齿类动物的进化关系,对中国地鼠的种属地位进行了进一步验证.结果:获得了中国地鼠线粒体16S基因的部分序列,其碱基组成A、T、C、G分别为40.5％、24.5％、18.7％、16.3％,与其他7种啮齿类动物的碱基含量相比,各碱基含量基本相似.NJ和UPGMA进化树表明,中国地鼠、金黄地鼠与欧洲仓鼠先聚为一支,小鼠与大鼠先聚为一支,东方田鼠、台湾田鼠与东欧田鼠先聚为一支.结论:中国地鼠和金黄地鼠的亲缘关系最近,与传统的分类地位基本吻合.