分子结构与基因序列数据综合可视化方法研究

摘要

随着系统生物学的兴起和迅速发展,为了探索不同生物层次信息之间的关联关系,对不同层次生物科学计算数据综合可视化的需求日益迫切.提出了一种分子结构与基因组序列数据综合集成可视化方法,该方法通过构建集成框架和定义关联数据描述方法,实现不同层次可视化工具统一管理以及统一用户交互界面,实现已有的分子结构与基因组序列数据的融合,有效支持分子结构数据与基因序列数据的综合可视化功能开发.应用该方法开发了一个分子结构数据与基因序列数据综合可视化原型系统,实现了分子结构数据与基因序列数据的同步显示、基因片段与相应分子局部空间结构蕴含关系显示、基因/氨基酸序列与蛋白质结构综合比对显示等综合可视化功能.初步应用与分析表明,所提出的综合集成可视化方法可扩展性好,所实现的综合可视化功能对研究分子结构及基因序列数据关联关系,具有良好的应用前景.