鸡补体分子C3d的基因克隆及序列分析

摘要

根据已发表的人、猩猩、鼠、野兔、猪、奶牛、绵羊动物的C3d基因同鸡的C3α链进行序列比较分析,发现在鸡的C3α链上有一段约897bp序列同上述动物有较高的同源性,在上下端保守区域设计一对引物788bp,应用RT-PCR扩增鸡C3d部分基因,并克隆到pMD18-T载体,测序正确后再在上下端分别设计一对引物,理论长度为378bp和336bp,最后用三种PCR产物延伸扩出C3d全长.结果成功获得鸡C3d基因重组质粒pMD18-C3d,序列分析表明所获的鸡C3dcDNA全长为993bp,编码331个氨基酸.分析鸡与上述动物C3d编码的氨基酸同源性分别在59.6﹪-67.7﹪和54.5﹪-61.9﹪之间,而哺乳动物核苷酸和氨基酸同源性则在74.2﹪-100﹪和72.2﹪-100﹪之间,由此表明补体因子C3d的基因具有种间多样性.进化树反映出鸡的补体因子C3d与其它哺乳动物的亲缘关系较远,在进化关系上为一单独分支.