火加松EST分子标记遗传图谱构建

摘要

本研究利用华南农业大学林学院林木育种教研室自主选育的火炬松×加勒比松杂种(火加松)F1代群体中的117个单株,通过开发火炬松EST、EST-CAPS、EST-SNP等多种标记,结合前期已得到的分子标记,分别对亲本火炬松和加勒比松构建遗传图谱.并以作图群体为基础,对所得的标记进行QTL检测.并根据火加松的生长数据,分别对火炬松和加勒比松的重要生长和形质性状进行了QTL定位.论文研究的结果总结如下:rn 1.利用火炬松的EST数据库开发引物732对,其中501对引物能够成功扩增出产物,本身固有多态性的有53对,酶切多态性引物有14对,HRM检测EST-SNP共得到13对多态性引物.rn 2.群体检测得到74个EST多态性位点,结合前期所得到的标记,共计378个.其中父本杂合位点有227个,母本杂合位点269个.利用这些标记构建的父本加勒比松图谱包含103个标记,分成24个连锁群,总长度1043.7cM,标记平均间距10.13cM,基于火炬松的EST标记有17个上图.母本火炬松图谱包含115个标记,分成32个连锁群,总长度1256.6cM,标记平均间距10.9cM,基于火炬松的EST标记有26个上图.rn 3.通过QTL作图,在17个性状上一共检测到32个在Kruskal-Wallis检验和区间作图上都达到0.1的显著性水平的QTL位点,其中有多个位点与多个性状连锁.这些QTL位点解释表型方差的比例在3.3％到49.1％之间不等,这既表明了微效多基因效应存在,同时也说明有主效基因效应存在.其中,生长性状在Kruskal-Wallis检验和区间作图中都达到0.1显著性水平的QTL位点有16个,在干形形质性状上共定位到了5个QTL位点,在侧枝形质性状上,只在BRA07上定位到3个QTL位点,对于07年春梢平均针叶长度AVPNL,在Kruskal-Wallis检验和区间作图中都达到0.1显著性水平的位点有8个,在针叶性状上总共定位了12个QTL位点.