波尔山羊和江苏本地山羊的AFLP和RAPD分析

摘要

实验山羊共105只,其中波尔山羊60只(公母羊各半,采血样20个,组织样40个),徐淮山羊30只(公母羊各半,每羊采血样1个),海门山羊15只(公羊7只,母羊8只,每羊采血样1个).分别提取DNA,按品种构建池DNA.应用36个选择性引物组合对波尔山羊、徐淮山羊和海门山羊种间AFLP多样性进行研究,其中29个引物组合共扩增出3253个标记,包括可变标记92个,平均每个引物组合扩增3.17个标记,多态频率达2.8﹪.可变标记数较多的引物组合为:E00+ACG/M00+CAC(13个)、E00+ACG/M00+CAG(10个)、E00+AAC/M00+CAC(8个)和E00+AAC/M00+ACT(7个).从93个随机引物中筛选出品种间多态性较强、重复性好的引物22个,对三个品种池DNA进行随机扩增,共扩增出183个标记,其中可变标记60个,平均每个引物扩增2.73个标记,多态频率为32.8﹪.两种方法得到一致结果,即徐淮山羊与海门山羊遗传距离最近,徐淮山羊与波尔山羊次之,海门山羊与波尔山羊遗传距离最远.按UPGMA法将海门山羊与徐淮山羊聚为一类,其次为波尔山羊.两种方法均能较好地反映三个山羊品种的遗传差异,但AFLP方法可变标记数更多,因而比RAPD方法效果更好.