新城疫病毒F和HN基因分型及其相关性

摘要

本研究选取国内1999～2005年发生的24株NDV,经CEF蚀斑纯化和SPF鸡胚增殖,对其融合蛋白(F)和血凝素-神经氨酸酶(HN)基因分别进行克隆测序,结合在GenBank中发表的具有F和HN基因的34株NDV毒株,利用DNAStar软件,参照传统对F基因分型的方法,对上述毒株的F或HN基因进行基因分型,比较其差异.结果表明:F和HN的基因分型具有相似性,符合率79.3％.但新近分离的毒株,分型结果相差较大,符合率仅70.8％,而传统毒株符合率97％.利用统计学软件SPSS8.0对HN基因核甘酸全长与F基因全长、代表F基因分型的前374个核甘酸片段进行同源相关分析.结果:F基因全长和HN基因全长核甘酸的相关值为0.476;HN基因全长和F基因高变区前374bp的相关值为0.504.表明F基因和HN基因的遗传变异既具有联系性,又具有独立性.