两株鸭源禽流感病毒(H5N1)HA基因序列分析与同源性比较

摘要

为了解两株鸭源禽流感病毒(DKHNSN1.04和DKHNWLY1.05)的分子生物学特性,本研究对其HA基因进行了序列分析与同源性比较.结果表明,两毒株在其HA裂解位点附近有连续5个碱性氨基酸的插入,表明其存在有高致病力的分子基础.从GeneBank中挑选出15个参考毒株进行比较,发现这两株毒株与国外毒株同源性差,HA基因核苷酸和氨基酸同源率不超过96.5％和95.8％.与属于同-分支的HZJ16.06、Ah2.05、DFJ1734.05的HA基因核苷酸和氨基酸同源性最高,同源率分别大于97.2％和96.3％,且1个受体结合位点及裂解位点插入的碱性氨基酸序列完全一致,提示它们可能具有相似的生物学特性.