基于相对熵的蛋白质折叠的研究

摘要

采用非格点模型，用相对熵作为优化函数，预测蛋白质主链走向的方法是可行有效的。在以前工作的基础上，提出了一种新的求接触势系综平均的方法。选取14个真实单链蛋白质作为测试蛋白，用三态HNP模型对该方法进行了测试，模拟结果表明比以前方法的预测精度有了提高，预测结构相对于天然结构的均方根偏差(RMSD)在O.40～0.60nm。