柑橘全爪螨热激蛋白HSP70基因片段克隆及序列分析

摘要

根据热激蛋白HSP70家族的保守序列设计1对简并引物,采用RT-PCR方法从柑橘全爪螨Panonychus citri(McGregor)体内扩增得到3个cDNA片段PCHSP70-1、PCHSP70-2以及PCHSP70-3(GenBank登录号分别为GQ95083、GQ495084及GQ495085).其核苷酸序列长度分别为767bp、767bp及764bp,分别编码255个、255个及254个氨基酸.其推导的氨基酸序列中含HSP70基因家族的2个典型的完整基序:HSP70-2 (PS00329)“I(V)FDIGGGTFDVSIL”和HSP70-3 (PS01036)“IVLVGGSTRIPK”.将其推导的氨基酸序列在NCBI站点进行BlastP比对,结果表明该氨基酸序列与HSP70家族具有较高的序列相似性,系统发育分析表明该序列与蜱螨类的HSP70家族的基因具有较高的同源性.因此,初步推测该序列为HSP70家族的新成员.