利用PCR-DGGE方法对森林有机凋落物层分解真菌动态分析

摘要

真菌在森林凋落物的降解过程中占有重要的地位。现今不依赖微生物培养的DNA方法去揭示真菌复杂群落结构已经越来越受到人们的关注。本研究首先分别提取樟子松人工林有机凋落物层中L层、F1层、F2层和H层的总基因组,通过巢式PCR扩增 18s rDNA序列中的V4-V8区域,将得到的约460bp的扩增产物利用变性梯度凝胶电泳(denatuning gradient gel electrophoresis,DGGE)进行分析,结果获得清晰且可重复的条带并对其进行测序鉴定。结果总体表明,一个OFU属于Basidiomycota,六个OTUs为Ascomycota,同时随着分解程度的加深,H层与其它分解层的真菌菌群结构相似性逐渐降低,但L层、F1层和F2层之间相比,真菌群落结构没有发生显著变化。