卵巢癌细胞UACC-1598中双微体序列特征研究

摘要

目的：探讨人卵巢癌细胞UACC-1598中双微体(double minute chromosomes，DMs)分子组成及序列特征，以深入揭示双微体形成的详细机制及其在肿瘤发生发展中的生物学功能。方法：应用二代测序技术(454)对分离所得较高纯度的DMs DNA进行高通量测序分析，对所得序列信息进行比对、拼接等生物信息学分析。结果：Mapping结果表明卵巢癌细胞UACC-1598中双微体上含有4个主要的扩增子(1q21.2，2p24.3，3q26.2和6p22.3)，同时双微体上也含有非扩增的DNA序列。与正常基因组DNA序列的比对分析显示双微体上DNA中含有157个基因重组序列;这些重组既可发生于扩增子边界处及扩增子内部，同时还见于非扩增序列之间。结论：人卵巢癌细胞UACC-1598中双微体主要由4个扩增区域通过大量的基因重组以复杂的方式组成：非扩增区域可能作为双微体上扩增子间的连接序列参与了双微体的构成：测序分析所得的双微体序列特征提示双微体的组成尤为复杂。