家蚕昼夜节律生物钟基因的克隆、进化分析和基因网络的整合

摘要

昼夜节律是生物生命活动中最普遍的节律，受遗传基因调控。本文电子克隆了家蚕的昼夜节律生物钟基因Vri，Cyc，Tim2，Pdp完整的ORF，以及Clk基因ORF片段。基因结构分析表明Bmpdp因具有7个外显子，6个内含子；Bmtm2基因具有21个外显子，20个内含子；Bmcyc基因具有lO外显子，9个内含子；Bmvri基因具有2个外显子，1个内含子。功能域和MOTIFS分析表明：BmVRI和BmPDP蛋白的DNA结合功能域氨基酸序列很相似，推测它们可以结合相同的DNA序列，即Clk基因的启动子。同纲目昆虫物种同源蛋白进化距离较近，符合它们的亲缘关系。家蚕基本具有所有果蝇昼夜节律生物钟基因的同源基因，这对建立家蚕的昼夜节律生物钟网络及研究其分子机制具有积极意义。