人基因组中三核苷酸重复序列核小体定位的统计分析

摘要

核小体是构成真核生物染色质的基本结构.真核生物DNA复制和基因转录过程中,染色质结构及其动态变化过程会影响反式调控因子与DNA序列的结合及相关蛋白的招募.基因组中核小体定位主要受到DNA序列特性和一些诸如甲基化、组蛋白修饰、组蛋白变体、染色质重塑等外在因素的共同影响.研究发现,DNA序列特征是决定核小体定位关键因素之一.本工作从UCSC数据库中下载了人基因组DNA序列（hg18），利用公开发表的高通量测序得到的CD4+T细胞的核小体定位图谱数据，统计分析了人基因组中所有的三核苷酸重复序列核小体定位特征。本研究发现人基因组中一些三核苷酸重复序列可以导致重复序列位点的核小体占据缺乏，该结果可能对从染色质水平上理解由三核苷酸重复序列引起疾病的致病机理有一定的意义。