首页>中文会议>工业技术>第九届国际分子模拟与信息技术应用学术会议（ICMS&I2018）

第九届国际分子模拟与信息技术应用学术会议（ICMS&I2018）

召开年：2018
召开地：太原
出版时间： 2018-05

主办单位：中国化学会中科院北京创腾科技有限公司

会议文集：第九届国际分子模拟与信息技术应用学术会议（ICMS&I2018）论文集

会议论文

热门论文

全部论文

最新会议

更多>>

全选（0）

1.氢气及壬基蒽在铂团簇上吸附活化的电子作用机制初探
- WANG Chunlu;王春璐;REN Qiang;任强;ZHAO Yi;赵毅;DAI Zhenyu;代振宇;LONG Jun;龙军
- 《第九届国际分子模拟与信息技术应用学术会议（ICMSI2018）》
摘要：多环芳烃在石油的高沸点馏分中占据一定比重且较难转化,通过加氢裂化使稠环芳烃轻质化是目前较为有效的转化途径.作为催化反应的第一步,多环芳烃在催化材料表面的吸附对后续的反应历程具有重要意义.采用分子动力学与密度泛函理论理论(DFT)作为研究手段,选取纳米尺寸的Pt团簇作为吸附模型,首先从前线轨道角度分析了氢气在Pt团簇上吸附的作用方式,比较了氢气在Pt团簇上从物理吸附到化学吸附转化过程中电子分布的变化,并考察了9-壬基蒽在加氢团簇表面吸附加氢的内在电子作用机制,并基于该共吸附体系内电子传递的环路机制构建了带取代侧链的三环芳烃与加氢中心相互作用的电子传递模型.
2.表面活性剂与油水界面分子的作用机理
- REN Qiang;任强;HOU Yanbo;侯研博;DAI Zhenyu;代振宇;ZHOU Han;周涵
- 《第九届国际分子模拟与信息技术应用学术会议（ICMSI2018）》
摘要：用Materials studio软件中的DPD模块对两种类型的表面活性剂分子在油水界面的分布形态进行了模拟.发现与单链型表面活性剂相比,低聚型表面活性剂分子由于其空间结构上的分散性导致与其通过化学键相连的部分极性基团进入油分子内部,在油水界面处相对更靠近油相,使得低聚型表面活性剂分子在油水界面处极性基团的排列没有单链型表面活性剂那样排列有序;低聚型表面活性剂存在时,油水界面的接触面积相对较大,而表面活性剂在油水中的分布相对比较均匀;与单链型表面活性剂分子相比,低聚型表面活性剂分子可以更好地降低油水界面的表面张力.
3.Experimental and Molecular Dynamics Simulation of C5Petroleum Resin/Chlorobutyl Rubber Composites
- 尹超;赵秀英;祝静;杨瑞宁;吴丝竹
- 《第九届国际分子模拟与信息技术应用学术会议（ICMSI2018）》
4.Experimental and Molecular Simulation Studies on Alkylated Graphene Oxide/Soluble-polymerized Styrene Butadiene Rubber Composites
- 杨海龙;吴丝竹
- 《第九届国际分子模拟与信息技术应用学术会议（ICMSI2018）》
摘要：使用点击化学的方法成功地将不同链长的烷基硫醇接枝到GO表面，且烷基硫醇链越长，越有利于提高CxGO与橡胶基体间的界面相互作用和分散性。界面自由体积和体自由体积的竞争结果导致C7GO/SSBR复合材料的FFV和MSD最低，在C18GO/SSBR复合材料中Ebinding是最大的，填料分散是最好的。
5.Molecular Dynamics Study on the Surfactant of Phenol Derivative Aryl Sulfonate at Oil-Water Interface
- Zhihong Kang;Zhihong Kang;Simeng Gao;Simeng Gao
- 《第九届国际分子模拟与信息技术应用学术会议（ICMSI2018）》
摘要：本文以一种新合成的弱碱驱油用表面活性剂酚衍芳基烷基磺酸盐(NPAS)为研究对象，通过分子动力学模拟(MD)方法模拟了C12-NPAS在油水界面的聚集行为，从微观层面详细分析其对界面性质的改变。结果表明苯环的最佳取代位点为C3，即3-C12-NPAS界面活性最佳。 (1)通过对比界面张力值可以得出：3-C12-NPAS和4-C12-NPAS降低界面张力的能力相对较强，表现出相对较好的界面性质，其中3-C12-NPAS最佳；通过对比磺酸基与酚氧基与水分子形成氢键数量可以得出：3-C12-NPAS和4-C12-NPAS与水分子之间的作用强度明显强于1-C12-NPAS和2-C12-NPAS，其中3-C12-NPAS的作用最强。 (2)随着苯环取代位置向烷基链中间移动，两个亲水基之间的距离发生变化，两个亲水基与水分子之间形成的氢键逐渐增多，酚氧基的这种趋势尤其明显。可以推断由于苯环取代位置向链中间移动会将两个亲水基之间的距离拉远，相互争夺水分子的趋势变弱，因此3-C12-NPAS、4-C12-NPAS的酚氧基可以与更多的水分子结合：除此之外，3-C12-NPAS、4-C12-NPA的链疏水部分长度与用来模拟油相的正癸烷有相似结构，符合相似相溶原理因此表现出更好的界面活性。
6.Ni-MoS2催化剂对官能化硝基苯的高选择性加氢
- 葛晖;韩文鹏;李学宽
- 《第九届国际分子模拟与信息技术应用学术会议（ICMSI2018）》
摘要：芳香胺类化合物是重要的化工中间体和原料,在医药、农药、色素、聚合物、染料、光电材料、橡胶助剂、表面活性剂、阻聚剂等领域有着广泛应用.贵金属催化剂被广泛用于选择性加氢芳香硝基化合物到相应的苯胺,但由于价格昂贵限制了应用范围,本研究采用非贵金属Ni-MoS2/γ-Al2O3催化剂,对带官能团(如-C=C,-C=O,-C≡N)的各种硝基苯具有很好的选择性加氢能力,用水合肼作还原剂,在常温常压下就可以完成反应.
7.星形聚合物聚合诱导自组装形成多孔结构的分子模拟研究
- Jiawei Li;李嘉伟;Youguo Yan;燕友果
- 《第九届国际分子模拟与信息技术应用学术会议（ICMSI2018）》
摘要：通过耗散粒子动力学和反应模型研究了星形结构共聚物的聚合诱导自组装(PISA)过程.模拟结果表明,可以通过共聚物的PISA直接制备多孔囊泡.而在不同的αAS和αAB下观察其的自组装过程,发现αAS(亲溶剂嵌段与溶剂之间的相互作用参数)和αAB(疏溶剂嵌段和亲溶剂嵌段之间的相互作用参数)可以影响平均孔径和孔径分布.此外,与线性共聚物相比,聚合物的星形结构可以促进多孔囊泡的形成.两种疏溶剂链的空间效应被证实是形成多孔囊泡的关键因素.这种效果的进一步增强可以扩大用于生产多孔囊泡的αAS范围,减小αAB范围和大幅度降低孔径分布.本研究采用LAMMPS软件进行模拟,此模拟研究提供了对星形结构共聚物的PISA更深入的了解,有助于多孔纳米材料的生产.
8.Temperature dependence of Al elastic constants from first principles
- Haijun Zhang;Haijun Zhang
- 《第九届国际分子模拟与信息技术应用学术会议（ICMSI2018）》
摘要：分别基于AIMD方法和GIBBS程序方法，计算了铝的晶格常数随温度的变化，用Vol+ElecT方法，计算了铝的弹性常数随温度的变化，其计算结果都和实验结果相吻合。其中晶格常数随温度升高而增加，弹性常数随温度上高而降低。Vol+ElecT方法比MD方法更贴近实验值，表明铝在高温下的结构是稳定的，以及温度对铝的弹性常数的影响主要体现在热膨胀效应和电子温度效应。
9.Screening for cyclooxygenase2inhibitors from natural compounds of Radix Glycyrrhizae using computer simulation
- Ming Yang;Ming Yang;Yi Jin;Yi Jin;Li-Ping Yang;Li-Ping Yang
- 《第九届国际分子模拟与信息技术应用学术会议（ICMSI2018）》
摘要：目的:探索甘草通过抑制环氧酶-2(COX-2)发挥抗炎作用的分子基础. 方法:运用Discovery Studio4.5系统预测化合物的分子性质,运用Ligand Profiler筛选与COX-2药效团作用的甘草天然成分;运用AutoDock Vina1.1.2软件进行甘草天然成分与COX-2蛋白的分子对接. 结果:甘草中的芳香族在分子量、分子表面积和分子溶解度这三方面与非甾体类抗炎药物(NSAIDs)最为接近,其次是黄酮,萜类/皂苷类则相差最大,而脂肪族类波动较大;将513个甘草小分子与59个COX-2药效团进行模拟结合,筛选出了118个小分子(FitValue＞0.5);用这118个甘草成分(A组)与40个NSAIDs(B组)与COX-2蛋白(1CVU)对接后发现,COX-2蛋白与甘草中的黄酮类和芳香族的结合能较低,而与脂肪族和萜类的结合能较高;结合分子量、分子表面积、分子溶解度的预测值,最终筛选出结合能低的、对COX-2酶具有潜在抑制作用的42个甘草天然成分,包括35个甘草黄酮成分和7个芳香族成分,其中有2个黄酮成分已被实验证实对COX-2酶具有选择性抑制作用. 结论:采用药效团初筛、分子对接再筛、结合小分子的理化性质精筛的三步曲方案,可以从中药天然成分中筛选出已知靶标(如COX-2酶)的潜在抑制剂.
10.基于SQS和CPA算法α-Ti合金广义层错能第一性原理比较研究
- 于慧;祁阳;胡青苗;杨锐
- 《第九届国际分子模拟与信息技术应用学术会议（ICMSI2018）》
摘要：α-Ti合金在航空航天领域有着十分广泛的应用.本文应用平面波赝势方法结合SQS超原胞模型以及EMTO结合相干近似(CPA)计算了α-Ti合金的广义层错能.纯钛的广义层错能计算结果显示:以棱柱面滑移优先的α-Ti在棱柱面上存在亚稳层错.弛豫对柱面层错能影响较大，对基面层错能影响不明显，SQS结构平均是一种较好的计算无序合金的方法。无论哪种无序模型，Al的添加使α-Ti基面的不稳定和固有层错能都降低了：与之相反，柱面层错能随Al的添加逐渐增加。位错分析表明Al的添加使α-Ti γpus/γbus比值大于1，柱面半位错宽度减小，基面半位错宽度增加，Al的添加导致α-Ti沿棱柱面滑移的临界剪切应力明显增加，这与Al含量增加到一定程度后基面更易于激活的实验结果一致。电子态密度的计算进一步解释了合金原子添加改变广义层错能的机理。
11.TATB基PBX材料力学性能的粗粒化计算
- WANG Li-li;王丽莉;JIN Zhao;金钊;LI Jifeng;李纪峰;SUN Huai;孙淮
- 《第九届国际分子模拟与信息技术应用学术会议（ICMSI2018）》
摘要：在自研发粘结炸药PBX材料粗粒化力场的基础上,使用大尺度分子动力学开源程序LAMMPS和多尺度材料模拟软件Materials Studio,自主开发功能模块和专用接口程序实现了PBX材料粗粒化模型的可视化建模、计算结果的图形化演示、输出文件的数据采集与分析.构建了1,3,5-三氨基-2,4,6-三硝基苯(TATB)超晶胞和粘结剂氟橡胶(F2311)高分子链随机均匀分布,空间位置和空间取向都是完全随机的PBX材料的粗粒化模型,应用粗粒化力场和大尺度分子动力学方法,对TATB炸药晶体和F2311高分子粘结剂在不同质量配比下的PBX材料的应力-应变曲线进行计算,模型的空间尺度达到微米量级,弹性模量的计算结果与类似材料的实验结果误差在一个数量级以内.
12.The ultimate solutions for therapeutic antibody design:iCDR graft,iCDR opt and iStable
- 刘明
- 《第九届国际分子模拟与信息技术应用学术会议（ICMSI2018）》
摘要：文章指出行业的火爆，带来的机遇与挑战并存，要想在这场没有硝烟的战争中屹立不倒，不仅需要不断增强自身的竞争力，而且必须找到适合自己发展的道路。目前，治疗性抗体行业虽然呈爆发式增长，但这显然会带来两个问题:(1)导致相当长一段时间内人才相对匮乏(2)对研发速度要求非常高。本公司拥有全套且高效的上游研发技术，显然可与其他公司展开技术合作或提供技术服务。
13.虚拟筛选发现临床药物的潜在抗癌新用途
- ZHU Jiawei;朱嘉炜;胡百淳;HU Baichun;XUN Wenbo;许文博;QIU Xirong;邱玺融;CAI Xiaoyu;蔡小羽;ZHANG Jiarui;张佳瑞;常莉;CHANG Li;WANG Jian;王健
- 《第九届国际分子模拟与信息技术应用学术会议（ICMSI2018）》
14.虚拟筛选发现临床药物的潜在降糖新用途
- 宋优佳;孙印;李芷怡;张雅娜;蒋重宁;李思涵;王健
- 《第九届国际分子模拟与信息技术应用学术会议（ICMSI2018）》
摘要：目的：发现临床药物的降血糖新用途.方法：基于降血糖靶标的晶体结构,利用Accelrys Discovery studio3.0,通过受体-配体相互作用,构建药效团模型,对ZINC数据库中的FDA数据库进行筛选,筛选出符合药效团结构的两个临床药物.结果与结论：发现了具有潜在降血糖活性的临床药物.
15.一种可通过皮下注射的新型直接凝血酶抑制剂
- 赵冰;张艳玲;黄一农;于锦超;李亚然;王琪;马亦信;宋后燕;于敏;莫炜
- 《第九届国际分子模拟与信息技术应用学术会议（ICMSI2018）》
摘要：目的:重组双功能水蛭素(RGD-hirudin)是在野生型水蛭素分子的合理部位融入了Arg-Gly-Asp(RGD)序列融合在野生型水蛭素的合理部位,具有抗凝血酶、抗血小板聚集的双重功能.但是RGD-Hirudin是一种蛋白质,只能通过静脉注射给药,临床应用范围有限.以RGD-hirudin序列为基础,保留其C末端和N末端的功能氨基酸残基,利用分子模拟和同源建模技术设计具有抗凝活性的短肽(Direct Thrombin Inhibitor Peptide,DTIP),以利于皮下用药. 方法:利用同源建模和分子模拟,以RGD-hirudin的序列为基础,保留其功能氨基酸残基,借助分子模拟软件设计多肽类似物；利用毕赤酵母表达DTIP；经纯化后获得目的蛋白；利用毕赤酵母表达DTIP；经纯化后获得目的蛋白；凝血酶滴定法测定DTIP的抗凝活性；HPLC-MS测定DTIP的纯度、分子量,利用生物膜干涉技术测定凝血酶与DTIP的亲和力.在体外实验中,通过血栓弹力试验测定DTIP对血栓形成的抑制作用.大鼠皮下注射DTIP,比较给药前后部分凝血活酶时间(Activated Partial Thromboplastin Time,aPTT),凝血酶原时间(Prothrombin Time,PT),凝血酶时间(Thrombin Time,TT)和凝血时间(Clotting Time)的变化.分别构建尾静脉注射肾上腺素和胶原诱导的急性肺栓塞模型和FeCl3损伤诱导的肠系膜微动脉血栓模型,研究DTIP预防血栓形成的药效学作用. 结果:利用同源建模设计出一条具有抗凝活性的短肽DTIP；DTIP抗凝比活性为7000ATU/mg,与凝血酶的亲和力为0.9μMol/L.体内和体外试验结果均显示DTIP显著延长aPTT、PT和TT,体内试验中,用药后,CT也显著延长,但不会引起出血.在急性肺栓塞模型中,DTIP显著提高小鼠存活率；在肠系膜微动脉血栓模型中,DTIP抑制血栓的形成. 结论:DTIP具有抗凝活性,且可以通过皮下注射的方式预防血栓的形成,可作为一种潜在的皮下注射直接凝血酶抑制剂进行更加深入的研究.