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S基因

S基因的相关文献在1986年到2023年内共计87055篇,主要集中在畜牧、动物医学、狩猎、蚕、蜂、内科学、基础医学 等领域,其中期刊论文301篇、会议论文21篇、专利文献86733篇;相关期刊153种,包括中国病毒学、中华微生物学和免疫学杂志、传染病信息等; 相关会议19种,包括福建省科协第十五届学术年会畜牧兽医分会场——福建省畜牧兽医学术年会、第一次全国中西医结合检验医学学术会议、中国畜牧兽医学会畜牧兽医生物技术学分会暨中国免疫学会兽医免疫分会第十次学术研讨会等;S基因的相关文献由50000位作者贡献,包括姚斌、王磊、王亚茹等。

S基因—发文量

期刊论文>

论文:301 占比:0.35%

会议论文>

论文:21 占比:0.02%

专利文献>

论文:86733 占比:99.63%

总计:87055篇

S基因—发文趋势图

S基因

-研究学者

  • 姚斌
  • 王磊
  • 王亚茹
  • 许嘉森
  • 罗会颖
  • 柏映国
  • 黄火清
  • 陈宏
  • 张伟
  • 李宁
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利文献

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作者

    • 蔡冬冬; 李建岗; 范毅; 罗毅; 崔鹏博; 胡晓亮; 田志革
    • 摘要: 为了解犬冠状病毒(CCoV)的基因组特征和遗传变异情况,本试验利用RT-PCR方法从患病犬肠道内容物中鉴定出一株CCoV,命名为BM35。通过RT-PCR方法扩增S、E、M、N和ORF7基因,然后对测序结果拼接并进行系统进化树和遗传重组分析。结果显示:BM35的3'端序列长度为8 870 bp;遗传进化树分析发现BM35与浙江株B639/ZJ/2019、台湾株NTU336、日本株FC1和越南株HCM47处于同一独立分支;重组分析发现BM35与台湾株NTU156和越南株HCM47在S基因发生重组。本研究有助于深入了解国内CCoV流行毒株的分子特性,为后续CCoV诊断试剂和疫苗的开发提供依据。
    • 李春英; 何奇松; 冯淑萍; 杨可妍; 曾咏芳; 熊毅; 颜健华
    • 摘要: 采集广西25个猪场的病料,对猪流行性腹泻病毒(PEDV)阳性组织样品进行全S基因扩增。将41株全S基因进行序列比对及遗传进化分析,41株PEDV的S基因之间核苷酸同源性为94.8%~100%,与参考毒株核苷酸同源性为89.3%~99.4%。S基因进化树图谱显示,广西当前流行的PEDV可分为2个谱系。Attenuated-DR13、CV777和该研究中的CHGXLC055-92013、CHGXLC055-52013、CHGXGP035-72013和CHGXGP035-82013为Cluster1;Cluster3包括该研究另外37株毒株、韩国株Spk1、HuN和日本株NK等参考毒株。表明广西大部分毒株S基因与欧洲株CV777、LZC等国内早期毒株存在较大的差异,进化树亲缘关系比较远;在抗原表位区域存在较大变异,当前的CV777疫苗株在防控PEDV入侵时可能不会产生良好的免疫保护效果。
    • 赵攀登; 冀梦瑶; 朱文龙; 陈益; 卢建洲; 杨霞; 朱芳; 田欣; 程云; 潘颂佳; 张宁; 范宝超
    • 摘要: 本研究旨在从临床仔猪腹泻样品中分离猪流行性腹泻病毒(PEDV),并对其S基因进行测序分析。对腹泻仔猪小肠样品进行RT-PCR检测、病毒的分离培养、RT-PCR和间接免疫荧光鉴定、S基因测序及遗传演化分析。结果显示:仔猪腹泻由流行性腹泻病毒引起;在Vero细胞上成功分离流行性腹泻病毒,命名为XP2018,该毒株细胞病变明显,并且连续传代细胞病变稳定;该毒株S基因全长为4161 bp,与中国经典毒株CV777 S基因核苷酸同源性为92.6%,氨基酸同源性为91.0%;与近年来中国分离的其他毒株S基因核苷酸同源性为96.9%~97.6%,氨基酸同源性为96.9%~98.0%;与美国参考毒株S基因核苷酸同源性为96.9%~97.6%,氨基酸同源性为96.6%~98.3%;遗传进化分析显示XP2018毒株与与目前中国流行毒株在同一分支,与经典毒株CV777不在一个分支上。本研究成功分离1株猪流行性腹泻病毒流行毒株,为PEDV疫苗研发奠定了基础。
    • 李云锋; 段滢; 梁淳; 李昱辰; 姜瑜琦; 李建达; 刘朋; 王文骞; 杨诚洁; 杨倩
    • 摘要: 为探究江苏省内猪场猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)的流行和遗传变异情况,采集江苏省13个地级市规模猪场和屠宰场健康猪群的鼻拭子和肛拭子样品,通过RT-PCR方法检测PEDV,并对部分阳性样品进行S基因序列扩增、测序及遗传进化分析。结果显示:259份猪鼻拭子样品中,PEDV阳性检出率为10.42%(27/259);178份猪肛拭子样品中,PEDV阳性检出率为9.55%(17/178)。选取的8株PEDV代表株的核苷酸序列同源性在99.2%~100%之间,氨基酸序列同源性在95.2%~97.1%之间,与国内流行毒株SD-M、JS2008的同源性最高,核苷酸序列同源性达到97%以上;遗传进化分析显示,8株PEDV代表株属于同一群,与经典毒株CV777、DR13亲缘关系较近。本研究初步明确了江苏地区健康猪群中猪流行性腹泻流行状况和PEDV遗传演化特点,为有效防控猪流行性腹泻提供参考。
    • 赵辉; 李双星; 朱明哲; 赵洋; 杜吉革; 刘业兵; 张传美; 印春生
    • 摘要: 从北京地区临床疑似传染性腹膜炎患猫的粪便和腹水样品中分离猫传染性腹膜炎病毒(Feline infectious peritonitis virus,FIPV),共采集10份样品进行RT-PCR检测,并接种MDCK细胞进行病毒分离和鉴定。结果表明:10份样品的RT-PCR检测结果均为FIPV阳性,将样品接种MDCK细胞并经连续传代培养,成功分离到一株FIPV,经鉴定属于FCoV-Ⅱ血清型,将其命名为FIPV/BJ01株;该毒株可以在MDCK细胞上增殖并产生典型的细胞病变,病毒滴度为10^(5.5)TCID_(50)/0.1mL;S和N基因的核苷酸与其他毒株的同源性分别为63.3%~99.4%和45.5%~99.2%,均与美国毒株同源性较高,而与中国毒株的同源性较低。
    • 崔志刚; 于合宅
    • 摘要: 2021年初,河北省某规模化猪场仔猪出现严重腹泻。为查明仔猪腹泻病因,通过观察临床症状、剖检病理变化,并采集肠组织样品进行RT-PCR检测。结果发现,发病仔猪精神萎靡、呕吐、腹泻等,临床剖检发现小肠壁变薄、小肠黏膜充血等,进一步的RT-PCR检测结果表明被检测样品中仅含有PDCoV核酸,未检出其他病原核酸;其后对该毒株的S基因部分序列进行扩增与分析,扩增片段大小约为1100 bp,与GenBank收录的PDCoV毒株对应基因核苷酸序列同源性最高,仅部分碱基出现变异,未见碱基缺失或插入等。其结果表明,该场仔猪腹泻是由PDCoV感染引起的,且该毒株S基因出现一定变异。该研究调查结果为该场仔猪腹泻的防治提供科学依据。
    • 刘雨桐; 姚妍婷; 黎芮伶; 韩文琪; 石婷; 王一丹; 任玉鹏
    • 摘要: 【目的】了解中国西南部分地区流行的猪流行性腹泻病毒(PEDV)基因型及遗传变异规律。【方法】对2020-2021年四川和云南不同地区来源的200份腹泻猪肛门拭子进行RT-PCR检测,对PEDV S和ORF3基因进行克隆测序,利用MegAlign软件进行变异性分析,采用Mega 7.0软件进行系统进化分析,采用RDP4软件进行基因重组分析。【结果】在所有样本中PEDV总体阳性率为15.50%(31/200),群体阳性率为100%(8/8)。检出的8株PEDV S基因和ORF3基因序列与已登录毒株相似性分别为90.5%~99.4%和92.9%~100%。对S基因的进化分析显示,8个PEDV流行株分布于G2a、G2b和G2c 3个亚群中。其中,四川SCWJSWUN02株与福建CH/FJXM/1/2012株遗传距离较近,云南YNKMSWUN01株与越南毒株单独聚为一支,表明当前西南地区PEDV的流行呈现出区域间传播的特征。与本地区近年流行毒株和常用疫苗株相比,其S蛋白氨基酸序列均存在不同程度的变异,但ORF3蛋白相对保守。部分毒株S蛋白存在连续氨基酸的插入或缺失,如在SCMYSWUN03株S蛋白59-62位氨基酸处发现4个氨基酸的缺失;在YNKMSWUN01株78-82位氨基酸处和84-88位氨基酸处分别有5个氨基酸插入和缺失。部分氨基酸突变位点存在于已鉴定的PEDV S蛋白受体结合中。此外,基因重组分析结果显示,SCMYSWUN03株可能发生了基因重组事件,概率为98.2%(P<0.01)。【结论】本研究发现当前西南地区流行的PEDV毒株包括G2a、G2b和G2c 3个亚群,毒株基因型具有多样性,且不同毒株间的变异性较大,丰富了PEDV在四川和云南地区的分子流行病学调查资料,揭示了中国西南地区流行的8个PEDV毒株的分子遗传变异规律和进化特征,为本地区猪腹泻病防控措施的制定提供了理论依据。
    • 何敏; 董晓庆; 石利民; 王雅倩; 张守刚
    • 摘要: 目的对2020年4月南京鼓楼医院送检的一起疑似聚集性发热伴血小板减少综合征(SFTS)开展病原检测,对其S基因进行测序,分析基因分型和系统发育特征。方法采用荧光定量PCR法对6例疑似患者血清标本进行新型布尼亚病毒(SFTSV)核酸定性检测,RT-PCR扩增SFTSV S基因片段并测序。分析核苷酸同源性,构建系统进化树。结果6例血清样本中,SFTSV核酸阳性5例。5例核苷酸高度同源,其中4例S片段基因核苷酸序列同源性100%,1例与其他4例间同源性为99.7%;最大相似株为江苏2014年分离株JS2014-06、2015年分离株JS2015-26,同源性100%。5例均聚集在C2亚型分支上。结论聚集性疫情SFTSV基因型为C2型,与近年来国内分离株亲缘关系近。需加强监测和宣教,关注病毒的进化与变异。
    • 陈胜男; 胡柱祺; 林金森; 邵洋洋; 钟汝情; 张杰; 谢莹; 焦思思; 欧阳慧敏; 卢嘉贤; 许伟锋; 邹育根; 张建峰; 翟少伦
    • 摘要: 广东省是生猪消费大省,也是养猪大省。猪流行性腹泻病毒引起的猪流行性腹泻严重威胁着生猪健康,尤其是对产床仔猪危害巨大,严重者可引起仔猪100%死亡。本研究对2021年采集的来自广东省主要地市养猪场的379份样品进行监测,样品阳性率13.19%。对获得的8株S基因与参考序列进行比较,发现其与疫苗株(CV777、DR13、AJ1102、LW、ZJ08)同源性较低,而与流行株(SDFQ、SDSJ、SXZJ、JXTQ)同源性较高;遗传进化树分析也显示本研究获得的毒株多与流行毒株在同一分支。综上分析,通过一年的监测表明猪流行性腹泻病毒仍然在猪场流行,并且多以流行毒株为主,揭示今后仍要做好猪流行性腹泻病毒流行毒株的预防和控制。
    • 李任; 余艳芬; 李春林; 黎运; 邱晓颖; 李湖
    • 摘要: 目的 了解HBV相关慢加急性肝衰竭(HBV-ACLF)患者的病毒S基因准种变异特征,探讨HBV-ACLF可能的发生机制.方法 将2016年1月至2018年10月高州市人民医院收治的HBV-ACLF患者和慢性乙型肝炎(CHB)患者纳入研究,收集患者基本资料以及治疗前血清样本.提取HBV DNA,巢式PCR法扩增HBVS基因,参照相应基因型标准序列,分析两组患者的HBVS基因的准种异质性差异,包括信息熵(Sn)、平均遗传距离(d*)、同义替换率(dS)、非同义替换率(dN)指标.结果 成功扩增HBV S基因的患者共99例,其中HBV-ACLF患者56例,CHB患者43例.HBV S基因准种异质性分析显示,HBV-ACLF组的Sn(核苷酸、氨基酸)、dS、dN 分别为(0.716±0.181)nt、(0.598±0.218)AA、8.259±2.607和7.103±3.081,均高于CHB组,差异均有统计学意义(t=2.579、2.546、8.232和5.297,P均<0.05).S基因MHR区准种变异性分析结果显示,HBV-ACLF组的Sn(核苷酸、氨基酸)、d*(核苷酸、氨基酸)、dS、dN 分别为(0.756±0.184)nt、(0.613±0.229)AA、(7.137±3.074)nt、(8.280±3.194)AA、9.091±2.720和7.429±2.860,明显高于CHB 组,差异均有统计学意义(t=5.332,、5.020、3.599、5.772、4.093和3.857,P均<0.01).结论 HBV-ACLF患者更易发生S基因变异,尤其是MHR区变异,可能与HBV-ACLF产生相关.
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