SSR标记

摘要： 澳洲坚果原产于澳大利亚亚热带雨林,是我国新兴的重要经济作物,其种质资源丰富,但遗传背景复杂,亲缘关系混乱。开展澳洲坚果种质资源遗传多样性分析,可拓展澳洲坚果种质资源创新利用途径,有效加快澳洲坚果育种进程。形态表型分析是最早用于种质鉴定和管理的标记之一,但易受环境因素影响。DNA分子标记技术在种质资源鉴定、遗传多样性分析中克服了传统表型分析易受环境影响的缺点。本研究采用9对高多态性SSR引物对91份国外引进以及自主选育品种(品系)澳洲坚果种质进行遗传多样性分析。结果表明,共扩增出73个等位基因位点,平均等位基因8个,平均基因多样性为0.689,平均杂合度为0.578,多态性信息含量PIC为0.453~0.792,平均值为0.659,表明91份澳洲坚果具有较高的多态性。UPGMA聚类分析表明,在遗传距离为0.33处,将91份澳洲坚果分为2大类,且其亲缘关系与地理来源无显著相关性,与主成分分析、Structure分析结果一致。本研究供试澳洲坚果材料群体内遗传变异显著高于群体间变异,且遗传成分来源单一,遗传结构较为简单。本研究为澳洲坚果种质的有效利用以及核心种质构建提供理论基础,为进一步加速澳洲坚果种质遗传改良以及分子辅助育种奠定基础。

摘要： 研究大豆育成品种遗传多样性及群体结构对大豆遗传改良具有重要的指导意义。本文利用99个与大豆QTL性状相关的SSR标记,对黄淮海和南方产区的105份大豆育成品种进行遗传多样性和群体结构分析。结果表明:99个位点共检测出1142个等位标记,每个位点变异范围为5~24个,平均每个位点11.54个等位变异。按品种育成时期将群体划分为4个亚群,亚群内Nei’s基因多样性范围0.628~0.839,平均0.774。多态性信息含量范围0.562~0.820,平均0.742。亚群间Nei’s遗传距离范围0.387~0.197,平均0.297。分子方差分析表明大豆材料99%为亚群内变异,仅1%为亚群间变异,说明不同时期内大豆材料之间交流频繁。主坐标分析的三个主成分分别解释了4.12%、3.61%和2.90%的总变异。UPGMA聚类和群体遗传结构分析都将大豆材料划分为3个类群,且结果高度一致,而且与大豆育成品种在主要家族系谱中代数及各时期亚群的遗传基础相关。大豆育成品种遗传多样性水平具有一定的时期特征,其总体水平呈递增趋势。

摘要： 【目的】寻找与蚕豆主要农艺性状紧密连锁的分子标记,挖掘农艺性状的优异等位变异与种质。【方法】以321份蚕豆种质为供试材料,调查其初荚高度、初荚节位、成荚节数、生殖节数、有效籽粒数、有效分枝、有效荚数、单荚粒数、荚长、荚宽、籽粒面积、籽粒厚、籽粒周长、籽粒长、籽粒宽、株高及百粒重。利用具有显著多态性的76对SSR标记进行基因分型,在分析群体结构的基础上,采用Tassel 2.1软件的GLM和MLM两种模型对上述17种农艺性状进行关联分析。【结果】表型性状的变异系数变幅为10.06%~51.64%,平均值为25.07%,表明供试群体具有较为丰富的表型多样性。76个标记在321份蚕豆中共检测到389个多态性位点,各位点的平均等位基因数为5.12个,变异范围为2~11个;多态性信息量(PIC)值为0.1903~0.7766,平均为0.5156,表明所选用的标记多态性较高。利用Structure 2.3.4进行群体遗传结构分析,可将321份供试材料划分为2个亚群,表明该群体结构相对单一,有利于关联分析。基于GLM模型,共检测到11个与12种农艺性状极显著(P<0.01)关联的标记,单个标记对表型变异的解释率为0.0393~0.1101;基于MLM模型,共检测到8个与8种农艺性状极显著(P<0.01)关联的标记,单个标记对表型变异的解释率为0.0291~0.0897。最后,基于MLM模型分析结果中极显著(P<0.01)关联位点各等位变异的表型效应,共发掘出7个分别对成荚节数、单荚粒数、有效荚数、有效籽粒数、株高、籽粒厚、籽粒长和籽粒周长增效潜力最大的优异等位变异,并由此筛选出7份优良种质。【结论】通过关联分析挖掘了多个与蚕豆农艺性状关联的分子标记位以及优异种质,为蚕豆分子标记辅助选择育种以及亲本材料的选配奠定了理论基础。

摘要： 为探究盐胁迫对大麻遗传育种改良的影响,试验对盐胁迫条件下大麻转录组测序数据进行了SSR位点标记的挖掘,并对大麻转录组数据中SSR位点标记、SSR位点信息和序列分布特征等进行了分析。结果表明:共检测出84 483条Unigene序列,序列总长87.31 Mb。筛选出27 861个SSR位点,SSR标记的检出率为33.10%,即平均3.13 kb就会出现一个SSR位点,其中以单、二和三碱基重复为主,检出率分别为52.73%、23.26%和22.16%;重复基元主要为A/T、AG/CT、AT/AT和AAG/CTT,分别占52.57%、11.32%、10.25%和6.69%。通过Primer 3.0在线软件获得17 894条SSR引物序列,引物中SSR位点重复长度绝大多数集中在10~21 bp,占SSR重复总数的79.72%,其中最长重复长度为226 bp。该研究构建的盐胁迫下大麻SSR位点信息与分布特征分析,可为研究大麻分子标记辅助育种、EST-SSR标记的开发等提供信息资源。

摘要： 玉米杂交种纯度的优劣直接决定其产量,常规检测方法采用若干单引物进行若干次电泳检测,鉴定周期长,效率低,不能及时反映杂交种纯度,难以及时指导大田生产。为了提高玉米种子纯度检测的准确性,建立稳定高效的多重PCR检测技术,本研究以‘德美亚1号’、‘德美亚2号’、‘德美亚3号’及其父母本为试验材料,通过比较不同DNA提取方法,确定了适宜多重PCR检测的SDS法;同时针对‘德美亚’不同系列,从国标玉米核心40对引物中筛选多态性并适合组建多重PCR的引物,试验最终为‘德美亚1号’组建了两重PCR,‘德美亚2号’和‘德美亚3号’组建了3重PCR,并尝试了自交系4重和5重引物组合,采用适宜的琼脂糖凝胶电泳检测方法,都获得了很好的扩增效果,试验所采用的扩增体系和扩增程序适宜2~5重PCR反应,并能有效应用于玉米杂交种的种子纯度鉴定。为今后‘德美亚’系列玉米品种鉴定提供了便利,也为其它玉米品种鉴定提供了思路。

摘要： 基于SSR标记对蓝莓品种‘蓝美1号’(Vaccinium corymbosum‘Lanmei 1’)217个自由授粉子代和26个现有蓝莓(Vaccinium spp.)栽培品种的遗传多样性和群体遗传结构进行了分析。结果显示:243个供试材料中,23对引物共检测出113个等位基因。多态性信息含量指数(PIC)为0.5075~0.8330,均值为0.6866;所有引物的PIC值均在0.5以上,表明SSR引物的多态性较高。217个自由授粉子代的Nei’s遗传多样性指数和Shannon’s多态性信息指数的均值分别为0.7334和1.4394,自由授粉子代较现有栽培品种具有较高的遗传多样性水平。UPGMA聚类分析中,26个品种聚为一类;217个自由授粉子代的遗传相似系数为0.70~0.99,除少数自由授粉子代外,其余子代划分为3个类群。STRUCTURE分析将217个自由授粉子代划分为4个亚群,亚群内子代遗传背景相对单一。比较UPGMA聚类分析和STRUCTURE分析的结果,STRUCTURE分析的分群效果更佳,亚群内子代间遗传相似性高。综合分析结果表明:筛选出的23对引物具有高度多态性;‘蓝美1号’自由授粉子代的遗传多样性较高,同现有栽培品种亲缘关系较远,可为蓝莓品种的改良提供丰富的遗传资源。

摘要： 【目的】从表型性状和分子标记两个方面分析亲本和杂交子代群体的遗传特性和遗传分化,为亲本组合的甄选和杂交子代的差异分析等工作提供参考依据。【方法】以35份橡胶树杂交后代群体为供试材料,利用表型性状和SSR分子标记进行遗传特性及遗传多样性研究。【结果】32个表型性状的变异系数平均值为32.59%,其中叶枕沟的变异系数最大为60.90%,小叶柄沟的变异系数最小为0;多样性指数分布在3.22~3.53,平均为3.49。杂种优势分析表明,F_(1)杂种在树围、年平均增长量和产量上具有较强的杂种优势,分别为101.2%、117.2%和95.38%。在35个杂种F_(1)中,产量最高的是材料A38,最低的是材料A9。2017—2020年4年间,材料A22每年都是树围最大的杂交子代;35个F_(1)杂种的年增长量分布在5.6~10.4 cm,年平均周长增量居6.7~8.8 cm。根据分子标记分析结果,从104对引物中筛选出扩增效果较好的引物15对,利用15对SSR标记亲本和后代群体遗传多样性分析,共扩增出15个等位基因,多态信息含量值(PIC)在0.2710~0.6827,Shannon’s信息指数(I),观测杂合度(H_(o))和期望杂合度(H_(e))分别处于0.5004~1.3459、0.1714~1.0000和0.3246~0.7400;采用UPGMA方法进行聚类分析,结果表明杂种可分为3个类群。【结论】亲本选配合理,杂交子代多样性丰富,解析了杂交子代遗传变异和遗传多样性,为杂交育种及亲本选配提供材料和理论支持。

摘要： 为分析长白落叶松生产群体的遗传多样性及其变化趋势,为落叶松优良种质资源收集、保护和多世代遗传改良提供科学依据。该文从270对松科SSR(Simple Sequence Repeat)通用引物中筛选出多态性高的30对引物,利用SSR分子标记对林口县青山林场长白落叶松种子园105个单株进行遗传分析。结果表明,30对引物共检测到258对等位基因,群体平均观测等位基因数(Average number of observed alleles,N_(a))为2.833,平均有效等位基因数(Average number of effective alleles,N_(e))为1.814,平均观测杂合度(Average observed heterozygosity,H_(o))为0.404,平均期望杂合度(Average expected heterozygosity,H_(e))为0.401;群体内近交系数(Inbreeding coefficient in population,F_(is))、群体总近交系数(Total inbreeding coefficient in population,F_(it))均为负值,表现出群体轻微杂合子过量,未出现近交衰退现象;Shannon多样性指数(I)为0.694,多态性信息含量(Polymorphism Information Content,PIC)为0.3541,具有较高遗传多样性,遗传变异主要源于群体内;UPGMA聚类图以0.692为阈值,可以将105个单株分为4个类群。该研究筛选出的SSR引物具有较好通用性,长白落叶松种子园遗传多样性较高,无性系群体遗传变异水平没有降低。

摘要： 为了解甘肃黄河沿岸枣品种的遗传多样性,用SSR分子标记对39份枣品种进行遗传分析。20对SSR引物共扩增出142个条带,多态性条带百分率达100%。每对引物扩增的条带数为3~13个,平均每对引物扩增的条带数为7.10个,扩增片段大小为70~300 bp。引物BFU0308扩增的条带数最多,为13条,扩增条带最少的引物为JSSR198和JSSR289,各有3条。用NTSYS-pc V2.10软件计算的39份枣品种的遗传距离(GS)为0.0000~0.9938,平均遗传距离为0.5587。结果表明,39份枣品种间遗传差异较大,遗传多样性丰富。UPGMA聚类图将39份枣品种分为两大类群Ⅰ和Ⅱ,第Ⅱ类群又分为4个亚群。结果表明,枣品种间的亲缘关系与品种原产地有一定相关性。亲缘关系近的品种有晋矮4号和晋矮3号、鸣山大枣、敦煌大枣、小口枣和开口酥等。SSR聚类分析结果也证实“大王枣”是与晋矮4号、晋矮3号起源相同的品种,“冷白玉2”是芒果冬枣类品种,“晋赞大枣”是壶瓶枣的同源品种。SSR分子标记技术揭示了甘肃黄河沿岸枣品种具有丰富的遗传多样性和复杂的亲缘关系,为有效解决枣品种命名混乱问题提供了依据,也为进一步研究和利用这些枣种质资源提供了依据。

摘要： 本研究利用单序列重复(Simple Sequence Repeat,SSR)分子标记技术对内蒙古36份马铃薯品种进行基因组扩增分析。结果表明,供试的11对引物共扩增出70条条带,其中多态性条带66条,多态性百分率94.2%,平均扩增片段数和扩增多态性均呈现较好的效果。聚类分析结果表明,按不同聚类方法可分别将36份材料聚为4个大的类群,不同聚类群之间存在一定的遗传差异,充分证明供试马铃薯品种间存在丰富的遗传多样性,为内蒙古地区马铃薯的育种亲本和杂种优势提供理论依据,初步构建36份马铃薯材料的指纹图谱。

摘要： 目的：新品系'雅江'具有明显区别于其它3个主推品种的形态特征和遗传背景,这为川西北高原老芒麦主要品种的遗传关系分析及品种的知识产权保护提供了支撑数据. 方法：基于23个形态性状和SSR分子标记,对在川西北推广应用的老芒麦(Elymussibiricus)3个国审品种('川草2号'、'阿坝'和'康巴')及1个新品系('雅江')进行了鉴定研究.各品种表型性状与遗传背景差异较明显.新品系'雅江'表现出优良的农艺性状,在株高、叶长、叶宽、茎粗等形态性状均值显著高于3个对照品种(P＜0.05). 结果：13对多态性好、特异性强、条带清晰的SSR引物在4个品种(系)共扩增出90条带,其中具有多态性的条带共68条,引物多态性条带比例(PPB)、多态性信息含量(PIC)及Shannon多样性指数(H)的平均值分别为76.32％、0.309及0.451,在供试品种(系)中均表现出较高的多态性. 结论：基于形态数据的欧氏距离和基于SSR数据的遗传距离矩阵之间具有较强的相关性(r=0.696,P=0.08),表明联合形态学标记和遗传标记能很好的用于品种鉴定,并且基于形态数据以及SSR分子标记的UPGMA聚类结果基本一致.筛选出4对引物可用于供试品种鉴定,并绘制了DNA指纹图谱.

摘要： 目的：新品系'雅江'具有明显区别于其它3个主推品种的形态特征和遗传背景,这为川西北高原老芒麦主要品种的遗传关系分析及品种的知识产权保护提供了支撑数据. 方法：基于23个形态性状和SSR分子标记,对在川西北推广应用的老芒麦(Elymussibiricus)3个国审品种('川草2号'、'阿坝'和'康巴')及1个新品系('雅江')进行了鉴定研究.各品种表型性状与遗传背景差异较明显.新品系'雅江'表现出优良的农艺性状,在株高、叶长、叶宽、茎粗等形态性状均值显著高于3个对照品种(P＜0.05). 结果：13对多态性好、特异性强、条带清晰的SSR引物在4个品种(系)共扩增出90条带,其中具有多态性的条带共68条,引物多态性条带比例(PPB)、多态性信息含量(PIC)及Shannon多样性指数(H)的平均值分别为76.32％、0.309及0.451,在供试品种(系)中均表现出较高的多态性. 结论：基于形态数据的欧氏距离和基于SSR数据的遗传距离矩阵之间具有较强的相关性(r=0.696,P=0.08),表明联合形态学标记和遗传标记能很好的用于品种鉴定,并且基于形态数据以及SSR分子标记的UPGMA聚类结果基本一致.筛选出4对引物可用于供试品种鉴定,并绘制了DNA指纹图谱.

摘要： 目的：新品系'雅江'具有明显区别于其它3个主推品种的形态特征和遗传背景,这为川西北高原老芒麦主要品种的遗传关系分析及品种的知识产权保护提供了支撑数据. 方法：基于23个形态性状和SSR分子标记,对在川西北推广应用的老芒麦(Elymussibiricus)3个国审品种('川草2号'、'阿坝'和'康巴')及1个新品系('雅江')进行了鉴定研究.各品种表型性状与遗传背景差异较明显.新品系'雅江'表现出优良的农艺性状,在株高、叶长、叶宽、茎粗等形态性状均值显著高于3个对照品种(P＜0.05). 结果：13对多态性好、特异性强、条带清晰的SSR引物在4个品种(系)共扩增出90条带,其中具有多态性的条带共68条,引物多态性条带比例(PPB)、多态性信息含量(PIC)及Shannon多样性指数(H)的平均值分别为76.32％、0.309及0.451,在供试品种(系)中均表现出较高的多态性. 结论：基于形态数据的欧氏距离和基于SSR数据的遗传距离矩阵之间具有较强的相关性(r=0.696,P=0.08),表明联合形态学标记和遗传标记能很好的用于品种鉴定,并且基于形态数据以及SSR分子标记的UPGMA聚类结果基本一致.筛选出4对引物可用于供试品种鉴定,并绘制了DNA指纹图谱.

摘要： 目的：新品系'雅江'具有明显区别于其它3个主推品种的形态特征和遗传背景,这为川西北高原老芒麦主要品种的遗传关系分析及品种的知识产权保护提供了支撑数据. 方法：基于23个形态性状和SSR分子标记,对在川西北推广应用的老芒麦(Elymussibiricus)3个国审品种('川草2号'、'阿坝'和'康巴')及1个新品系('雅江')进行了鉴定研究.各品种表型性状与遗传背景差异较明显.新品系'雅江'表现出优良的农艺性状,在株高、叶长、叶宽、茎粗等形态性状均值显著高于3个对照品种(P＜0.05). 结果：13对多态性好、特异性强、条带清晰的SSR引物在4个品种(系)共扩增出90条带,其中具有多态性的条带共68条,引物多态性条带比例(PPB)、多态性信息含量(PIC)及Shannon多样性指数(H)的平均值分别为76.32％、0.309及0.451,在供试品种(系)中均表现出较高的多态性. 结论：基于形态数据的欧氏距离和基于SSR数据的遗传距离矩阵之间具有较强的相关性(r=0.696,P=0.08),表明联合形态学标记和遗传标记能很好的用于品种鉴定,并且基于形态数据以及SSR分子标记的UPGMA聚类结果基本一致.筛选出4对引物可用于供试品种鉴定,并绘制了DNA指纹图谱.

摘要： 目的：新品系'雅江'具有明显区别于其它3个主推品种的形态特征和遗传背景,这为川西北高原老芒麦主要品种的遗传关系分析及品种的知识产权保护提供了支撑数据. 方法：基于23个形态性状和SSR分子标记,对在川西北推广应用的老芒麦(Elymussibiricus)3个国审品种('川草2号'、'阿坝'和'康巴')及1个新品系('雅江')进行了鉴定研究.各品种表型性状与遗传背景差异较明显.新品系'雅江'表现出优良的农艺性状,在株高、叶长、叶宽、茎粗等形态性状均值显著高于3个对照品种(P＜0.05). 结果：13对多态性好、特异性强、条带清晰的SSR引物在4个品种(系)共扩增出90条带,其中具有多态性的条带共68条,引物多态性条带比例(PPB)、多态性信息含量(PIC)及Shannon多样性指数(H)的平均值分别为76.32％、0.309及0.451,在供试品种(系)中均表现出较高的多态性. 结论：基于形态数据的欧氏距离和基于SSR数据的遗传距离矩阵之间具有较强的相关性(r=0.696,P=0.08),表明联合形态学标记和遗传标记能很好的用于品种鉴定,并且基于形态数据以及SSR分子标记的UPGMA聚类结果基本一致.筛选出4对引物可用于供试品种鉴定,并绘制了DNA指纹图谱.

摘要： 浙江省是我国柚类遗传多样性的主要分布区之一,本研究搜集本省18份地方柚类种质资源利用24对柑橘SSR引物进行遗传多样性分析并构建种质鉴定图,旨在为地方资源的搜集保护和合理利用提供参考.24对引物共检测到92个等位变异位点,变异范围在1-7之间,平均每对SSR引物可检测到3.8个等位位点;24个SSR位点的观察杂合度、期望杂合度和多态性信息含量分别为0.49、0.51和0.45;18份柚类种质资源两两间的遗传相似性系数介于0.55-0.94之间,平均为0.71,表明浙江地方柚类种质资源具有丰富的遗传多样性,遗传背景较复杂.UPGMA聚类分析将供试材料分成A1-A3、B1、C1和D1共6个组群,其中A1组包括四季柚、佛香柚和麻步文旦等7份果肉颜色为黄色或粉红色的种质,A2组包括永嘉红心柚2号、青田红心柚和木兰柚3份果肉颜色为浅红色的种质,A3组包括处红柚、永嘉红心柚1号、古磉柚和官南红柚4份果肉颜色为红色的种质,官南土柚和文成红心柚自成B1和C1组,常山胡柚和槾文柑2个杂种柚类型聚为D1组.除少数个别材料外,浙江地方柚类种质资源有按果肉颜色优先聚类的趋势,但是黄色和粉红色的种质资源间并未得到明显的区分,说明SSR分子聚类结果与果实表型基本吻合.另外,利用AG14、CAG01、CMS-16和CMS-26 4对SSR引物可快速准确地将18份供试种质鉴别开来,以此构建了浙江省地方柚类资源的种质鉴定图,可应用于种苗真实性鉴定.

摘要： 浙江省是我国柚类遗传多样性的主要分布区之一,本研究搜集本省18份地方柚类种质资源利用24对柑橘SSR引物进行遗传多样性分析并构建种质鉴定图,旨在为地方资源的搜集保护和合理利用提供参考.24对引物共检测到92个等位变异位点,变异范围在1-7之间,平均每对SSR引物可检测到3.8个等位位点;24个SSR位点的观察杂合度、期望杂合度和多态性信息含量分别为0.49、0.51和0.45;18份柚类种质资源两两间的遗传相似性系数介于0.55-0.94之间,平均为0.71,表明浙江地方柚类种质资源具有丰富的遗传多样性,遗传背景较复杂.UPGMA聚类分析将供试材料分成A1-A3、B1、C1和D1共6个组群,其中A1组包括四季柚、佛香柚和麻步文旦等7份果肉颜色为黄色或粉红色的种质,A2组包括永嘉红心柚2号、青田红心柚和木兰柚3份果肉颜色为浅红色的种质,A3组包括处红柚、永嘉红心柚1号、古磉柚和官南红柚4份果肉颜色为红色的种质,官南土柚和文成红心柚自成B1和C1组,常山胡柚和槾文柑2个杂种柚类型聚为D1组.除少数个别材料外,浙江地方柚类种质资源有按果肉颜色优先聚类的趋势,但是黄色和粉红色的种质资源间并未得到明显的区分,说明SSR分子聚类结果与果实表型基本吻合.另外,利用AG14、CAG01、CMS-16和CMS-26 4对SSR引物可快速准确地将18份供试种质鉴别开来,以此构建了浙江省地方柚类资源的种质鉴定图,可应用于种苗真实性鉴定.

摘要： 浙江省是我国柚类遗传多样性的主要分布区之一,本研究搜集本省18份地方柚类种质资源利用24对柑橘SSR引物进行遗传多样性分析并构建种质鉴定图,旨在为地方资源的搜集保护和合理利用提供参考.24对引物共检测到92个等位变异位点,变异范围在1-7之间,平均每对SSR引物可检测到3.8个等位位点;24个SSR位点的观察杂合度、期望杂合度和多态性信息含量分别为0.49、0.51和0.45;18份柚类种质资源两两间的遗传相似性系数介于0.55-0.94之间,平均为0.71,表明浙江地方柚类种质资源具有丰富的遗传多样性,遗传背景较复杂.UPGMA聚类分析将供试材料分成A1-A3、B1、C1和D1共6个组群,其中A1组包括四季柚、佛香柚和麻步文旦等7份果肉颜色为黄色或粉红色的种质,A2组包括永嘉红心柚2号、青田红心柚和木兰柚3份果肉颜色为浅红色的种质,A3组包括处红柚、永嘉红心柚1号、古磉柚和官南红柚4份果肉颜色为红色的种质,官南土柚和文成红心柚自成B1和C1组,常山胡柚和槾文柑2个杂种柚类型聚为D1组.除少数个别材料外,浙江地方柚类种质资源有按果肉颜色优先聚类的趋势,但是黄色和粉红色的种质资源间并未得到明显的区分,说明SSR分子聚类结果与果实表型基本吻合.另外,利用AG14、CAG01、CMS-16和CMS-26 4对SSR引物可快速准确地将18份供试种质鉴别开来,以此构建了浙江省地方柚类资源的种质鉴定图,可应用于种苗真实性鉴定.

摘要： 杜仲为雌雄异株木本植物,具有重要的药用价值与经济价值,杜仲的利用价值因其植株性别而异,尤其是杜仲胶以及其它次生代谢产物在雌雄植株中存在差别.杜仲在开花前用形态学方法很难辨别其性别,而杜仲一般需要7年以上才能开花.为了加强对杜仲资源的有效保护和可持续利用,基于杜仲雌雄株转录组数据开发SSR标记,可为杜仲遗传多样性分析、分子标记辅助育种、性别鉴定和遗传图谱构建等奠定基础.

摘要： 杜仲为雌雄异株木本植物,具有重要的药用价值与经济价值,杜仲的利用价值因其植株性别而异,尤其是杜仲胶以及其它次生代谢产物在雌雄植株中存在差别.杜仲在开花前用形态学方法很难辨别其性别,而杜仲一般需要7年以上才能开花.为了加强对杜仲资源的有效保护和可持续利用,基于杜仲雌雄株转录组数据开发SSR标记,可为杜仲遗传多样性分析、分子标记辅助育种、性别鉴定和遗传图谱构建等奠定基础.

摘要： 本发明公开了SSR标记引物设计方法。针对现有SSR标记引物多态性不足的缺陷，本发明提供了一种基于基因组草图序列设计新SSR标记引物的方法。本方法首先选择一位点已知的SSR标记引物作为起始SSR标记引物，其次将起始SSR标记引物与其所在染色体草图序列进行序列比对查找比对结果中的片段重叠群，然后搜寻片段重叠群中的SSR序列作为结果SSR序列，最后根据结果SSR序列设计SSR标记引物。本发明还提供了14对新的与小麦条锈病抗性有关的SSR标记引物，其中5对在供试遗传群体中产生多态性；以及以L693×L661和L661×L693F2单株作为作图群体的小麦遗传图谱构建方法。本发明方法可快速增加已知位点SSR标记引物的数量，增加SSR标记多态性，与基因初定位相结合可以快速加密遗传图谱。

摘要： 本发明涉及分子技术领域，具体涉及三七SSR多态性引物、多态性检测方法及SSR标记在总皂苷含量确定上的应用，三七SSR多态性引物，由序列表中SEQ ID NO.1‑32所示引物组成；利用该引物进行PCR扩增对三七的多态性进行检测。本发明还提供了三七SSR标记在总皂苷含量确定上的用途。三七总皂苷与位点SSR35有关联。三七总皂苷与位点SSR2‑57有关联。本发明提供了三七多态性检测的方法及引物，对三七品种表型的研究和品种鉴定提供了有利的技术支持，对SSR标记与总皂苷的关联性研究，有利于高总皂苷含量三七品种选育的工作开展。

摘要： 本发明提供一种与竹子耐寒性相关的SSR分子标记、SSR引物及其应用，属于分子标记及其检测技术领域。本发明通过转录组测序结果，进一步筛选ICE1‑CBF‑COR通路相关基因，在相关通路里找到了与抗寒标记相关的38条unigene，根据unigene里SSR位点分布特点，合成38对SSR引物，通过引物筛选，最终得到了9对多态性较好的位点，并进一步进行验证，最终证明上述SSR引物扩增获得的SSR分子标记可用于竹子种质资源耐寒鉴定。本发明检测方法在短时间内即可完成耐寒竹子鉴定，具有高效、准确、低成本、操作简便等优势，可应用于竹子种质资源或品种的耐寒鉴定及分子辅助育种，具有良好的实际生产和应用之价值。

摘要： 本发明公开了一种与菠菜雄性紧密连锁的SSR标记SP_SSR04及其在菠菜性别鉴定中的应用，属于分子生物学技术领域。本发明的技术方案要点为：与菠菜雄性紧密连锁的SSR标记SP_SSR04，该SSR标记SP_SSR04通过以下特异引物对扩增获得，其核苷酸序列如序列表中SEQ ID NO.1所示，在菠菜雄株中扩增出176bp的特异条带，在菠菜雌株中无扩增产物，所述特异引物对为：上游引物：5’‑TTGATTGCCTCAAGGTGTTG‑3’；下游引物：5’‑TGGGTTCTTAGCCACTTTTTG‑3’。利用本发明提供的分子标记不但可以用来对菠菜栽培种进行早期性别鉴定，也可以应用到对菠菜野生种早期性别鉴定工作中，提前对菠菜雌、雄株进行筛选，大大提高育种效率，在菠菜生产实践、育种中具有重要的价值。

摘要： 本发明公开了一种与菠菜雄性紧密连锁的SSR标记SP_SSR19及其在菠菜性别鉴定中的应用，属于分子生物学技术领域。本发明的技术方案要点为：一种与菠菜雄性紧密连锁的SSR标记SP_SSR19，该SSR标记SP_SSR19通过以下特异引物对扩增获得，其核苷酸序列如序列表中SEQ ID NO.1所示，在菠菜雄株中扩增出178bp的特异条带，在菠菜雌株中无扩增产物，所述特异引物对为：上游引物：5’‑GGTACTGGTTAGGGCTCTGG‑3’；下游引物：5’‑CATCTGGTCATCCGATGTGA‑3’。利用本发明提供的分子标记不但可以用来对菠菜栽培种进行早期性别鉴定，也可以应用到对菠菜野生种早期性别鉴定工作中，提前对菠菜雌、雄株进行筛选，大大提高育种效率，在菠菜生产实践、育种中具有重要的价值。

摘要： 本发明公开了SSR标记、引物对及其应用和陆地棉早熟分子育种相关SSR标记位点的筛选方法。以中晚熟棉花品种鲁棉研37号为母本，以早熟棉花品种鲁棉研19号为父本，杂交1代，再自交1代获得F2，在F2群体中选择1/8的早熟株系和1/8的晚熟株系，种植F3，自交获得F4利用F2群体进行棉花早熟性状相关SSR标记位点的第一次鉴定，卡方分析初步确定受苗蕾期性状选择有效的陆地棉早熟分子育种相关SSR标记。利用F4群体进行早熟相关SSR标记位点的第二次鉴定，卡方分析最终确定受苗蕾期性状选择有效的陆地棉早熟分子育种相关SSR标记。本发明的有益效果是为陆地棉早熟分子育种分子标记位点。

摘要： 本发明公开了一种基于棉花SSR分子标记筛选藏紫草的特异性SSR标记方法，其包括以下步骤：（1）提取藏紫草根皮部基因组DNA；（2）以第（1）步提取的基因组DNA为模板，选用特异性SSR引物进行PCR扩增；（3）对扩增产物进行凝胶电泳；（4）对电泳结果进行分析，其中所述特异性引物的碱基序列为：SHIN‑1494F：TAACGGAGATGGGTTTCGAC；SHIN‑1494R：CACAACCGTCCATTTCCTCT。本发明方法重复性好、多态性高、遗传稳定、不受环境条件影响，而且检测结果稳定可靠、快速准确、操作简单方便、成本低廉，有利于大规模的快速检测。

摘要： 本发明公开了SSR标记引物设计方法。针对现有SSR标记引物多态性不足的缺陷，本发明提供了一种基于基因组草图序列设计新SSR标记引物的方法。本方法首先选择一位点已知的SSR标记引物作为起始SSR标记引物，其次将起始SSR标记引物与其所在染色体草图序列进行序列比对查找比对结果中的片段重叠群，然后搜寻片段重叠群中的SSR序列作为结果SSR序列，最后根据结果SSR序列设计SSR标记引物。本发明还提供了14对新的与小麦条锈病抗性有关的SSR标记引物，其中5对在供试遗传群体中产生多态性；以及以L693×L661和L661×L693F2单株作为作图群体的小麦遗传图谱构建方法。本发明方法可快速增加已知位点SSR标记引物的数量，增加SSR标记多态性，与基因初定位相结合可以快速加密遗传图谱。

摘要： 本发明公开一种用于朱顶红杂交后代鉴定的SSR分子标记组合、SSR引物组合及其应用，本发明基于朱顶红转录组数据开发EST‑SSR标记，以朱顶红亲本和杂交后代基因组DNA为模板，使用SSR引物进行PCR扩增，通过毛细管电泳，进行朱顶红亲本和杂交后代的EST‑SSR分析，可用于朱顶红杂交后代的早期鉴定。本发明的检测方法适用于朱顶红EST‑SSR分子标记开发及其杂交后代的早期鉴定，既提高了朱顶红杂交育种效率，又降低了杂交后代株系的管理成本，具有准确性高、操作简便等优点。

摘要： 本发明提供一种与竹子耐寒性相关的SSR分子标记、SSR引物及其应用，属于分子标记及其检测技术领域。本发明通过转录组测序结果，进一步筛选ICE1‑CBF‑COR通路相关基因，在相关通路里找到了与抗寒标记相关的38条unigene，根据unigene里SSR位点分布特点，合成38对SSR引物，通过引物筛选，最终得到了9对多态性较好的位点，并进一步进行验证，最终证明上述SSR引物扩增获得的SSR分子标记可用于竹子种质资源耐寒鉴定。本发明检测方法在短时间内即可完成耐寒竹子鉴定，具有高效、准确、低成本、操作简便等优势，可应用于竹子种质资源或品种的耐寒鉴定及分子辅助育种，具有良好的实际生产和应用之价值。