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普鲁兰酶突变体、工程菌及其应用

摘要

本发明公开了一种普鲁兰酶突变体、工程菌及其应用,所述普鲁兰酶突变体是将SEQ ID NO.1所示氨基酸序列的第365位、第401位、第504位或第499位氨基酸进行单突变或多突变获得的。本发明构建的普鲁兰酶突变体的催化活性、热稳定性与耐酸稳定性均得到了提高,其中突变体PulAR‑A365V‑401C‑H499A‑T504V的催化效率较野生型普鲁兰酶PulAR在pH5.0、6.0,60℃条件下分别提高了6.6倍与9.6倍;在60℃,65℃的半衰期分别比野生型普鲁兰酶提高了2.6和3.1倍,且在pH 4.5与pH 5.0的半衰期分别比野生型普鲁兰酶提高了1.6和1.8倍。

著录项

  • 公开/公告号CN114807099A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2022-07-29

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 浙江工业大学;

    申请/专利号CN202210272672.2

  • 申请日2022-03-18

  • 分类号C12N9/44(2006.01);C12N15/70(2006.01);C12N1/21(2006.01);C07K1/14(2006.01);C07K1/22(2006.01);C07K1/34(2006.01);C07K1/36(2006.01);C12P19/14(2006.01);C12P19/00(2006.01);C12R1/19(2006.01);

  • 代理机构杭州天正专利事务所有限公司 33201;

  • 代理人李世玉

  • 地址 310014 浙江省杭州市拱墅区潮王路18号

  • 入库时间 2023-06-19 16:12:48

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2022-08-16

    实质审查的生效 IPC(主分类):C12N 9/44 专利申请号:2022102726722 申请日:20220318

    实质审查的生效

说明书

(一)技术领域

本发明涉及一种普鲁兰酶,特别涉及一种通过定点突变与组合突变的方法构建普鲁兰酶PulAR突变体,并用于制备热稳定性和耐酸性提高的普鲁兰酶。

(二)背景技术

普鲁兰酶(Pullulanase,EC 3.2.1.41)是一种淀粉脱支酶,能够专一性地断开普鲁兰糖、可溶性淀粉、支链淀粉和一些寡聚糖中的α-1,6糖苷键。普鲁兰酶广泛应用于糖化步骤,与糖化酶或β-淀粉酶协同作用,提高糖化效率,减少糖化酶或β-淀粉酶的使用量,从而提高生产量,降低生产成本的目的。

为了最大化发挥普鲁兰酶和糖化酶或β-淀粉酶之间的协同效应,普鲁兰酶与糖化酶、β-淀粉酶需具有一致的作用温度。工业生产中为了达到糖化酶等的最大催化效率、减少染菌的机率,糖化过程温度和pH一般控制在60℃、pH 4.5-5.0,反应时间达到48小时以上。因此,耐热耐酸的普鲁兰酶亟需开发。然而大部分的从自然界中挖掘到的普鲁兰酶通常不具备在高温、酸性的条件下能够保持高活性和高稳定性。而且目前国内的普鲁兰酶市场被美国杰能科公司垄断,因此仍需对普鲁兰酶加大开发力度,摆脱对进口普鲁兰酶产品的依赖。

得益于生物信息学、基因组学和蛋白质组学等前沿生物技术的快速发展,以及随着人们对普鲁兰酶晶体结构与功能关系的解析、酶催化机制等的深入研究。发明人前期从嗜热菌厌氧芽孢杆菌中克隆并表达了I型普鲁兰酶PulAR,该酶的最适作用条件为55℃、pH6.0,但催化效率较低。本发明通过蛋白质工程技术,构建催化温度、热稳定性、耐酸稳定性与催化效率显著改善的普鲁兰酶PulAR突变体,促进淀粉酶法水解技术工艺发展。

(三)发明内容

本发明目的是提供一种普鲁兰酶PulAR突变体、工程菌及其应用,提升普鲁兰酶PulAR的催化活性、热稳定性与耐酸稳定性,解决野生型普鲁兰酶PulAR在高温、酸性条件下的催化活性低、稳定性差的问题。

本发明采用的技术方案:

本发明提供一种普鲁兰酶PulAR突变体,所述普鲁兰酶PulAR突变体是将SEQ IDNO.1所示氨基酸序列的第365位、第401位、第504位或第499位氨基酸进行单突变或多突变获得的。本发明所述普鲁兰酶PulAR突变体是对普鲁兰酶PulAR基因(SEQ ID NO.2)进行定点突变与组合突变,将获得的突变质粒以热击的方式转入E.coli BL21(DE3)感受态细胞,对获得菌株进行接种、转接、诱导,获得普鲁兰酶PulAR突变体蛋白。

本发明首先将野生型普鲁兰酶PulAR的重组菌E.coli BL21(DE3)/pET32a(+)-PulAR活化并提取质粒,并保存于-20℃。其次通过同源建模,获得待改造的普鲁兰酶的三维结构,选择位于活性中心附近的氨基酸残基,同时根据PulAR与耐酸普鲁兰酶的序列比对,确定了7个关键性氨基酸Q355、A365、T399、V401、Y491、H499与T504。以pET32a-PulAR基因为模板质粒,进行定点突变,获得突变质粒后,并转化,进行优势突变菌的筛选,获得正突变并进行叠加突变,筛选优势突变体。

优选的,所述普鲁兰酶PulAR突变体是将SEQ ID NO.1所示氨基酸序列突变为下列之一:(1)第365位丙氨酸突变为缬氨酸(A365V);(2)第401位缬氨酸突变为半胱氨酸(V401C);(3)第504位苏氨酸突变为缬氨酸(T504V);(4)第499位组氨酸突变为丙氨酸(H499A);(4)第365位丙氨酸突变为缬氨酸、第401位缬氨酸突变为半胱氨酸(A365V/V401C);(5)第365位丙氨酸突变为缬氨酸、第401位缬氨酸突变为半胱氨酸、第504位苏氨酸突变为缬氨酸(A365V/V401C/T504V);(6)第365位丙氨酸突变为缬氨酸、第401位缬氨酸突变为半胱氨酸、第504位苏氨酸突变为缬氨酸、第499位组氨酸突变为丙氨酸(A365V/V401C/T504V/H499A,氨基酸序列SEQ ID NO.3,核苷酸序列SEQ ID NO.4)。

本发明还涉及所述普鲁兰酶PulAR突变体编码基因,含编码基因的重组载体,含所述重组载体的重组基因工程菌。所述重组载体的基础载体可以是pET 32a(+),所述重组基因工程菌的宿主菌可以是E.coli BL21(DE3)。

优选的,所述重组基因工程菌按如下方法构建:将普鲁兰酶PulAR突变体连入pET32a(+)的EcoR V与Xho I位点,转入E.coli BL21(DE3)感受态细胞,获得所述的重组基因工程菌。

本发明还提供一种所述普鲁兰酶PulAR突变体在制备普鲁兰酶蛋白中的应用,所述的应用方法为:将普鲁兰酶PulAR突变体重组基因工程菌诱导培养后,取湿菌体用缓冲液重悬,超声破碎,破碎液再进行镍柱纯化,获得普鲁兰酶蛋白。

优选的,所述普鲁兰酶PulAR突变体重组基因工程菌诱导培养方法为:将普鲁兰酶PulAR突变体重组基因工程菌接种到含有50μg/mL卡钠霉素(Kan)与100μg/mL氨苄抗生素(Amp)的LB液体培养基中,37℃,220rpm活化培养过夜,获得种子液;将种子液以体积浓度1-5%(优选1%)转接到含50μg/mL Kan与100μg/mL Amp的LB液体培养基中,37℃、220rpm培养2.0-2.5小时,至发酵液OD值达到0.6-0.8后,加入终浓度为0.15mM的IPTG,低温16℃继续诱导培养20小时;发酵液4℃、12,000rpm离心10min,收集湿菌体。

优选的所述普鲁兰酶蛋白按如下方法制备:(1)将湿菌体悬浮于PBS缓冲液(50mM、pH 7.5),利用超声破碎仪破碎细胞10min,破碎条件:功率为350W,破碎1s,暂停1s;然后4℃、12,000rpm离心30min,收集上清,制得粗酶液;(2)将粗酶液在4℃、8000rpm条件下离心10min,去沉淀,上清液经0.22μm的滤膜过滤后,滤液作为上样液,以0.25mL/min速度上样镍柱(40×12.6mm,Bio-Rad,USA),上样量为有效柱体积的2%;先用冲洗缓冲液(20mM,pH7.0的磷酸钠缓冲液,含0.3M NaCl,20mM咪唑)洗脱杂蛋白,流速1mL/min,洗脱量为5-10个柱体积,洗脱至基线平衡,使得杂蛋白完全被冲洗掉;再用洗脱缓冲液(Elution buffer,20mM,pH 7.0的磷酸钠缓冲液,含0.3M NaCl,500mM咪唑)洗脱目的蛋白,流速为1mL/min,通过观察检测器紫外吸收值进行监测,当紫外吸收值相对于基线向上扬起时用试管收集洗脱液,当紫外吸收值回到基线时停止收集,将收集到的洗脱液装入透析袋(截留分子量MD 34(3500)),置于pH 7.0、20mM的PBS溶液中4℃透析12h,透析后截留液即为普鲁兰酶蛋白纯酶液。

优选的,所述镍柱纯化前先用超纯水冲洗管路中的杂质与空气,并除去镍柱中的20%无水乙醇;再用5-10倍柱体积的结合缓冲液(Binding buffer,20mM,pH 7.0的磷酸钠缓冲液,含0.3M的NaCl)平衡镍柱,使基线平衡。

本发明还涉及所述普鲁兰酶突变体在淀粉糖化中的应用,例如高麦芽糖浆糖等的生产。

本发明普鲁兰酶突变体基因工程菌的接种、转接、诱导、菌体回收,培养基可为本领域任何可使菌体生长,优选LB培养基:胰蛋白胨10g/L,酵母提取物5g/L,NaCl 10g/L,蒸馏水溶解,调节pH 7.0。培养方法和培养条件没有特殊的限制,培养方法和培养条件没有特殊的限制,培养方法和条件可以根据宿主类型和培养方法等因素的不同进行适当的选择。

与现有的技术相比,本发明有益效果主要体现在:本发明构建的普鲁兰酶突变体PulAR-A365V、PulAR-V401C、PulAR-A365V/V401C、PulAR-A365V/V401/T504V、PulAR-A365V/V401C/T504V/H499A在60℃的热稳定性分别较野生型普鲁兰酶PulAR提高了0.23倍、0.25倍、1.06倍、1.75倍、2.65倍;在65℃的热稳定性分别较野生型普鲁兰酶PulAR提高了0.64倍、0.64倍、1.68倍、2.68倍、3.12倍;上述突变体在pH 4.5的稳定性分别较野生型增加了0.30倍、0.31倍、0.74倍、1.06倍、1.57倍;在pH 5.0的稳定性分别较野生型增加了0.39倍、0.38倍、0.77倍、1.23倍、1.84倍。此外,突变体在pH 6.0、60℃的催化效率较野生型提高了0.50倍、0.69倍、2.56倍、3.42倍、6.55倍;在pH 5.0,60℃的催化效率较野生型提高了0.63倍、0.85倍、2.75倍、4.30倍、9.56倍。综上所述,本发明构建的普鲁兰酶PulAR突变体比野生型PulAR具有更好的催化性能和工业属性。

(四)附图说明

图1是普鲁兰酶PulAR野生型及其突变体纯化酶的SDS-PAGE电泳图,泳道M为蛋白Marker,泳道1代表野生型PulAR突变体的纯化蛋白,泳道2代表PulAR-A365V的纯化蛋白,泳道3代表PulAR-V401C的纯化蛋白,泳道4代表PulAR-A365V/V401C的纯化蛋白,泳道5代表PulAR-A365V/V401C/T504V,泳道6代表PulAR-A365V/V401C/T504V/H499A。

图2是普鲁兰酶PulAR野生型及突变体纯化酶的最适催化温度曲线图。

图3是普鲁兰酶PulAR野生型及突变体纯化酶的最适pH曲线图。

(五)具体实施方式

下面结合具体实施例对本发明进行进一步描述,但本发明的保护范围并不仅限于此:

实施例1:野生型普鲁兰酶重组菌的构建

根据Genbank中来源于嗜热厌氧芽孢杆菌(Anoxybacillus sp.)AR-29的I型普鲁兰酶的基因(KY273924)片段,设计普鲁兰酶的克隆引物如表1所示,人工合成该片段并插入到载体pET-32a(+)的EcoR V与Xho I酶切位点之间,得到重组质粒pET-32a(+)-PulAR(核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示,编码蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示),将测序正确的重组质粒pET-32a(+)-PulAR转化到E.coli BL21(DE3),挑取单菌落进行测序,得到重组菌E.coli BL21(DE3)/pET-32a(+)-PulAR,即为野生型E.coli BL21(DE3)/pET-32a(+)-PulAR。

SEQ ID NO.1

MYEVFSSLILKTNEKMGLFILGGANLLTVHRTFEAYLDTMTVITILIPKSYHSGMVGNFIIEKPNGERCQLQVAKREDLWTSIKYECVIDFAVEIGRRYLIYDDHGAFTDLQIGAVIRTAEFDEQFYYEGNDLGITYTPEATTFKLWAPTATEVKVKLLDEAEGKQEQIPLQRMEKGVWMTTVSGDLEGRYYTFLVCVNLVWREAVDPYAMAVSVNGEYGVVVDLAKTHVPKPTLSPLSSPTDAIIYEVHIRDFTIHGDSGVAHKGLYLGLAELGTSGPNNTTTGLSYLAQLGVTHVELLPFNDFAGVDEKAPLKEYNWGYNPLHYNAPEGSYATNPFDPYARIQELKQAIRALQAQGIRVIMDAVYNHVYIREQSSFEKIVPGYYFRHDLYGMPSNGTGVGNDIASERRMVRKFIVDSVRFWLTEYGVDGFRFDLMGVLDIETMREVEAVVHALDPSALLLGEGWDLPTPLPAEQKATMNNADKLPCIAYFNDRFRDHVKGSTFAIHEKGFALGNMAFREQAMRAIQGNVRIKKEAGMFLNPTQAVNYVESHDNHTFWDKMSVSNADESEEIRQKRQKLATAFVILSQGIPFLHSGQEFYRTKQGIENSYNAPDAINQLDWRQKSLYEKDVRYVAGLIQLRKLHRAFRFSTSAEIEKHLRLVEETPPSVIAYHLQSVQEYGPWSDILVIHHNQEATERLPLPDEEEWHVVCDHTASGTTPLYTVKQEIEVQGISTFVLTKMTDLTKKANHI.

SEQ ID NO.2

gtgtatgaggtcttttcctccttgatcctcaaaacaaatgaaaagatgggtttattcatattgggaggtgccaatttgttaactgttcatcgaacgtttgaagcgtatctggatacgatgacggtgattacaattttaatcccgaagtcgtatcattctggaatggtcgggaattttattatcgaaaagccaaatggagaacgatgtcagcttcaagtggcaaaacgagaagatttatggacaagtattaagtatgaatgtgtaatcgattttgctgtcgagatcgggcggaggtatctcatttatgatgatcacggtgcttttaccgatttgcaaatcggggcagtcattcgcaccgcagaatttgatgaacagttttattacgaagggaatgaccttggtatcacctatactccagaagcaaccacttttaagctttgggctcctacggcgacggaagtgaaggtgaaattgctcgatgaggcggaaggaaagcaggagcaaattccgctgcagcgcatggaaaagggagtatggatgactacagtttccggagaccttgaaggaagatattatacgtttttagtgtgtgtgaaccttgtttggcgtgaggctgttgatccatacgcaatggctgtttcagtcaatggagagtacggggttgtcgtcgatttggcgaaaacacatgtgccgaagccaacgctgtcgccgttatcgtccccgacggatgcgattatttatgaagtgcatattcgcgattttaccattcacggcgatagcggggtggctcacaaagggttgtatttaggccttgctgagctcggaacaagcgggccaaataatacaaccacaggcctttcctatttagcgcagctaggagtaacgcatgtagagttgcttccatttaacgattttgctggagtagatgaaaaagccccgctgaaggaatacaactggggctataacccgctgcattataacgctcctgaagggagctatgccactaatccgtttgatccatatgcgcggattcaggagctgaaacaagcgatccgtgcgttgcaggcacagggcattcgcgtgattatggatgctgtttataatcatgtctatattcgcgagcagtcatcatttgaaaaaattgtccctggttattattttcgacatgatctatatggaatgccatccaatggaacaggagtggggaatgacatagcatcggaacggcggatggtgcgaaaatttattgttgactctgtgcgtttttggctgactgagtatggggtggacggatttcgttttgacttaatgggagttttagatatagagacgatgagagaagtggaggccgtcgtccatgcgctcgatccgtccgcacttttgcttggcgagggatgggatttgccgacccctcttcctgccgagcaaaaagctacgatgaacaacgctgacaagctgccttgtattgcgtattttaatgacagatttcgcgatcatgtcaaaggaagtacctttgctattcatgaaaaggggtttgcattaggaaatatggctttccgtgagcaagcgatgcgagcgatccaaggcaatgtgcgaattaaaaaagaagcagggatgtttctgaacccaacgcaagcggtcaattatgttgaatcacatgataatcacacgttctgggataaaatgagcgtgtccaatgcggatgaaagtgaagagattcgtcagaaacggcaaaagctggccaccgcttttgttattctctcgcaaggcattccgtttttgcatagcggccaagaattttatcggacgaagcaagggatagaaaacagctataatgctccggatgccattaaccagcttgattggaggcaaaaaagcctgtatgagaaggatgtgcggtatgttgcaggattgattcaactgcgcaagcttcatcgggctttccgcttttcaacgtctgccgaaatcgaaaaacatcttcgattggttgaagagactccgccatctgtcattgcttatcatcttcaatccgtgcaagaatatgggccatggagcgatattttggtcattcatcataatcaagaagcaacagagcgcttaccccttccggatgaggaggaatggcatgtcgtgtgcgatcacacagcgagcggaacgactcctttatacaccgtgaaacaagagattgaagtccaggggatcagtacgtttgttcttacgaaaatgactgacttgacgaaaaaagcaaatcacatataa.

实施例2:普鲁兰酶突变体的构建与筛选

1、普鲁兰酶突变体的构建

根据SEQ ID NO.2所示的普鲁兰酶PulAR的基因序列,设计并合成引入突变Q355、A365、T399、V401、Y491、H499与T504的突变引物(表1),利用实施例1中获得的重组质粒pET-32a(+)-pulAR为模板,进行全质粒PCR扩增,转化至大肠杆菌E.coli BL21(DE3),进行测序鉴定,获得单突变体E.coli BL21(DE3)-PulAR-Q355H、E.coli BL21(DE3)-PulAR-A365V、E.coli BL21(DE3)-PulAR-T399S、E.coli BL21(DE3)-PulAR-V401T、E.coli BL21(DE3)-PulAR-V401C、E.coli BL21(DE3)-PulAR-Y491V、E.coli BL21(DE3)-PulAR-H499A与E.coliBL21(DE3)-PulAR-T504V。

PCR扩增体系::1μL正向引物(100μM),1μL反向引物(100μM),12.5μL 2×Phanta缓冲液,0.5μL dNTP混合物(各10mM),1μL质粒模板,0.5μL DNA聚合酶和8.5μL超纯水。

PCR扩增条件:95℃预变性5min,然后30个循环(95℃变性15s,55℃退火15s,72℃延伸6min),72℃终延伸10min。

表1突变引物设计

注:下划线为突变位点。

2、单突变诱导培养

将步骤1获得的普鲁兰酶单突变体分别转接到10mL含有50μg/mL卡钠霉素(Kan)与100μg/mL氨苄抗生素(Amp)的LB液体培养基中,37℃,220rpm活化培养过夜,获得种子液;分别将1mL种子液转接到装有100mL含50μg/mL Kan与100μg/mL Amp的LB液体培养基的摇瓶中,37℃、220rpm培养2.0-2.5小时,至发酵液OD值达到0.6后加入终浓度为0.15mM的IPTG,低温16℃继续诱导培养20小时;发酵液4℃、12,000rpm离心10min,收集菌体,并悬浮于1mLPBS缓冲液(50mM,pH 7.5),利用超声破碎仪破碎细胞10min,破碎条件:功率为350W,破碎1s,暂停1s;然后,4℃、12,000rpm离心30min,收集上清,制得突变体粗酶液。

3、酶活测定

普鲁兰酶酶活性的测定采用3,5-二硝基水杨酸方法。普鲁兰酶在一定条件下,催化水解普鲁兰糖生成还原糖。3,5-二硝基水杨酸与还原糖溶液共热后被还原为显棕红色的氨基络合物,在一定范围内其颜色的深浅与还原糖的量成正比,故可以在540nm的波长下进行显色,计算酶活。酶活单位(U),每分钟催化产生1μmol葡萄糖所需的酶量即为一个酶活力单位。

酶活测定反应体系为0.5mL:50μL质量浓度5%的普鲁兰多糖水溶液(购自Sigma公司)分别溶解在440μL pH 6.0、pH 5.0 100mM NaAc/HAC缓冲液,10μL步骤2制备的突变体粗酶液。55℃下反应10分钟,加入DNS液终止反应,100℃水浴10min,测定OD540光吸收值。以葡萄糖的DNS显色OD540光吸收值绘制标准曲线进行标定。

初筛阶段耐酸性强化的正突变标准是:突变体pH 5.0的酶活/pH 6.0的酶活(A

表2普鲁兰酶PulAR及其突变体的pH 5.0的活性/pH 6.0的活性的比例

实施例3:组合突变与普鲁兰酶蛋白的纯化

1、组合突变

将实施例2中获得的普鲁兰酶的有益突变A365V、V401C、T504V与H499A进行组合突变研究,以实施例1中突变方法分别构建组合突变体PulAR-A365V/V401C、PulAR-A365V/V401C/T504V、PulAR-A365V/V401C/T504V/H499A,具体如下:

(1)组合突变体PulAR-A365V/V401C构建

以实施例2单突变体E.coli BL21(DE3)-PulAR-A365V的质粒pET-32a-PulAR-A365V为模板,以表2中Q355H(F)、Q355H(R)为引物,采用实施例2方法进行全质粒PCR,筛选获得突变体PulAR-A365V/V401C。

(2)组合突变体PulAR-A365V/V401C/T504V构建

以上述已构建组合突变体E.coli BL21(DE3)-PulAR-A365V/V401C的质粒pET-32a-PulAR-A365V/V401C为模板,以表2中V401C(F)、V401C(R)为引物,采用实施例2方法进行全质粒PCR,筛选获得突变体PulAR-A365V/V401C/T504V。

(3)组合突变体PulAR-A365V/V401C/T504V/H499A构建

以上述已构建组合突变体E.coli BL21(DE3)-PulAR-A365V/V401C/T504V的质粒pET-32a-PulAR-A365V/V401C/T504为模板,以表2中T504V(F)、T504V(R)为引物,采用实施例2方法进行全质粒PCR,筛选获得突变体PulAR-A365V/V401C/T504V/H499A。

2、纯酶

(1)采用实施例2步骤2方法对步骤1制备的各个组合突变体、实施例2制备的突变体PulAR-A365V、PulAR-V401C及实施例1野生型进行诱导培养,收集的湿菌体按50g/L的量用(pH 7.0、100mM)磷酸钾缓冲液重悬,置于冰水混合物中,破碎10min;破碎条件:功率为350W,破碎1s,暂停1s,破碎混合液即为粗酶液;

(2)将粗酶液在4℃、8000rpm条件下离心10min,去沉淀,上清液经0.22μm的滤膜过滤后,滤液作为上样液使用镍柱(40×12.6mm,Bio-Rad,USA)纯化酶蛋白,其步骤为:

先用超纯水冲洗管路中的杂质与空气,并除去镍柱中的20%无水乙醇;

平衡:用5-10倍柱体积的结合缓冲液(Binding buffer,20mM,pH 7.0的磷酸钠缓冲液,含0.3M的NaCl)平衡镍柱,使基线平衡。

样品上样:将先前收集到的滤液上样,设置流速为0.25mL/min,总上样量为10mL。

洗脱杂蛋白:用5-10倍柱体积的冲洗缓冲液(20mM,pH7.0的磷酸钠缓冲液,含0.3MNaCl,20mM咪唑)洗脱杂蛋白,流速1mL/min,直至基线平衡,使得杂蛋白完全被冲洗掉。

洗脱目的蛋白:用洗脱缓冲液(Elution buffer,20mM,pH 7.0的磷酸钠缓冲液,含0.3M NaCl,500mM咪唑)洗脱目的蛋白,流速为1mL/min;通过观察检测器紫外吸收值进行监测,当紫外吸收值相对于基线向上扬起时用试管收集洗脱液,当紫外吸收值回到基线时停止收集。将收集到的洗脱液(即含目的蛋白洗脱液),置于冰上保存。

透析:将含目的蛋白洗脱液装入透析袋(截留分子量MD 34(3500)),置于pH 7.0、20mM的PBS溶液中4℃透析12h,透析后截留液即为纯酶液,将纯酶液用pH 7.0、20mM的PBS调整至蛋白含量为2.6mg/mL。将各个纯酶液进行琼脂糖凝胶电泳检测,结果见图1所示,结果表明突变体蛋白与野生型的蛋白的表达量一致,并无明显差异。

实施例4:普鲁兰酶及突变体的最适作用条件及稳定性的测定

1、最适温度及热稳定性表征

(1)最适温度

将表3中野生型及突变体按实施例3方法制备的纯酶,在不同温度(40、50、55、60、65、70与80℃)采用实施例2方法测定酶活力,并以最适反应温度下酶活力为100%绘制温度对酶的影响曲线,结果如图2所示,图2可以看出野生型PulAR与突变体PulAR-A365V、PulAR-V401C、PulAR-A365V-V401C、PulAR-A365V-V401C-T504V、PulAR-A365V-V401C-T504V-H499A的最适温度分别为55、55、60、60、60与65℃。表明突变体PulAR-V401C、PulAR-A365V-V401C、PulAR-A365V-V401C-T504V、PulAR-A365V-V401C-T504V-H499A最适温度显著提高,分别比野生型PulAR提高了5、5、5、10℃。

(2)热稳定性

半衰期(t

将表3中野生型及突变体按实施例3方法制备的纯酶,分别用pH 6.0的100mM乙酸盐缓冲液将其稀释至蛋白浓度0.1μg/μL,在60、65℃保温一定时间,每隔2h,取样,采用实施例2方法测定残余酶活,结果见表3所示。

由表3可以看出,突变体PulAR-A365V、PulAR-V401C、PulAR-A365V-V401C、PulAR-A365V-V401C-T504V、PulAR-A365V-V401C-T504V-H499A比野生型PulAR在60℃的半衰期分别提高了0.23、0.25、1.06、1.75、2.65倍。而在65℃,突变体PulAR-A365V、PulAR-V401C、PulAR-A365V-V401C、PulAR-A365V-V401C-T504V、PulAR-A365V-V401C-T504V-H499A半衰期分别比野生型提高了1.6、1.6、1.68、2.68、3.12倍。

表3普鲁兰酶PulAR及其突变体在60、65℃的热稳定性测定

k

2、最适pH及pH稳定性表征

(1)最适pH

将表4中野生型及突变体按实施例3方法制备的纯酶,采用实施例2方法在60℃,pH4.5-6.0(4.5、5.0、5.5、6.0)的100mM乙酸盐缓冲液,pH 6.5-8.0(6.5、7.0、7.5、8.0)的100mM磷酸盐缓冲液中测定反应的最适pH。结果见图3所示,野生型PulAR及突变体的最适pH并未发生明显改变。

(2)pH稳定性

将表4中野生型及突变体按实施例3方法制备的纯酶,用pH 4.5或者pH 5.0的100mM乙酸盐缓冲液将其稀释至蛋白浓度0.1μg/μL,25℃孵育一定时间,每隔1h,取样,采用实施例2方法检测残余酶活,以未孵育的样品酶活为100%,结果如表4所示,表4可以看出突变体在pH 4.5的半衰期比野生型PulAR提高了0.30倍、0.31倍、0.74倍、1.06倍、1.57倍。而在pH 5.0的半衰期比野生型PulAR提高了0.39倍、0.38倍、0.77倍、1.23倍、1.84倍。

表4普鲁兰酶PulAR及其突变体在pH 4.5、5.0的稳定性测定

k

实施例5:普鲁兰酶及突变体的动力学参数测定

分别用pH 6.0、5.0的100mM乙酸盐缓冲液配制成一系列浓度普鲁兰糖溶液(1.0、1.25、1.33、2.0、2.5、3.33与5.0mg/mL)。在500μL普鲁兰糖溶液的加入以蛋白含量计1μg纯酶(野生型及突变体按实施例3方法制备获得纯酶),在60℃,pH 6.0与60℃,pH 5.0条件下反应10min,加入DNS液终止反应,100℃水浴10min,测定OD540光吸收值,根据实施例2酶活测定部分计算产物麦芽三糖的量。使用origin 9.1的米氏方程进行拟合,计算得出普鲁兰酶及其突变体对底物的米氏常数K

表5普鲁兰酶PulAR及其突变体动力学参数的测定(60℃,pH 6.0)

表6普鲁兰酶PulAR及其突变体动力学参数的测定(60℃,pH 5.0)

序列表

<110> 浙江工业大学

<120> 普鲁兰酶突变体、工程菌及其应用

<160> 4

<170> SIPOSequenceListing 1.0

<210> 1

<211> 752

<212> PRT

<213> 嗜热厌氧芽孢杆菌(Anoxybacillus sp.)

<400> 1

Met Tyr Glu Val Phe Ser Ser Leu Ile Leu Lys Thr Asn Glu Lys Met

1 5 10 15

Gly Leu Phe Ile Leu Gly Gly Ala Asn Leu Leu Thr Val His Arg Thr

20 25 30

Phe Glu Ala Tyr Leu Asp Thr Met Thr Val Ile Thr Ile Leu Ile Pro

35 40 45

Lys Ser Tyr His Ser Gly Met Val Gly Asn Phe Ile Ile Glu Lys Pro

50 55 60

Asn Gly Glu Arg Cys Gln Leu Gln Val Ala Lys Arg Glu Asp Leu Trp

65 70 75 80

Thr Ser Ile Lys Tyr Glu Cys Val Ile Asp Phe Ala Val Glu Ile Gly

85 90 95

Arg Arg Tyr Leu Ile Tyr Asp Asp His Gly Ala Phe Thr Asp Leu Gln

100 105 110

Ile Gly Ala Val Ile Arg Thr Ala Glu Phe Asp Glu Gln Phe Tyr Tyr

115 120 125

Glu Gly Asn Asp Leu Gly Ile Thr Tyr Thr Pro Glu Ala Thr Thr Phe

130 135 140

Lys Leu Trp Ala Pro Thr Ala Thr Glu Val Lys Val Lys Leu Leu Asp

145 150 155 160

Glu Ala Glu Gly Lys Gln Glu Gln Ile Pro Leu Gln Arg Met Glu Lys

165 170 175

Gly Val Trp Met Thr Thr Val Ser Gly Asp Leu Glu Gly Arg Tyr Tyr

180 185 190

Thr Phe Leu Val Cys Val Asn Leu Val Trp Arg Glu Ala Val Asp Pro

195 200 205

Tyr Ala Met Ala Val Ser Val Asn Gly Glu Tyr Gly Val Val Val Asp

210 215 220

Leu Ala Lys Thr His Val Pro Lys Pro Thr Leu Ser Pro Leu Ser Ser

225 230 235 240

Pro Thr Asp Ala Ile Ile Tyr Glu Val His Ile Arg Asp Phe Thr Ile

245 250 255

His Gly Asp Ser Gly Val Ala His Lys Gly Leu Tyr Leu Gly Leu Ala

260 265 270

Glu Leu Gly Thr Ser Gly Pro Asn Asn Thr Thr Thr Gly Leu Ser Tyr

275 280 285

Leu Ala Gln Leu Gly Val Thr His Val Glu Leu Leu Pro Phe Asn Asp

290 295 300

Phe Ala Gly Val Asp Glu Lys Ala Pro Leu Lys Glu Tyr Asn Trp Gly

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Tyr Asn Pro Leu His Tyr Asn Ala Pro Glu Gly Ser Tyr Ala Thr Asn

325 330 335

Pro Phe Asp Pro Tyr Ala Arg Ile Gln Glu Leu Lys Gln Ala Ile Arg

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Ala Leu Gln Ala Gln Gly Ile Arg Val Ile Met Asp Ala Val Tyr Asn

355 360 365

His Val Tyr Ile Arg Glu Gln Ser Ser Phe Glu Lys Ile Val Pro Gly

370 375 380

Tyr Tyr Phe Arg His Asp Leu Tyr Gly Met Pro Ser Asn Gly Thr Gly

385 390 395 400

Val Gly Asn Asp Ile Ala Ser Glu Arg Arg Met Val Arg Lys Phe Ile

405 410 415

Val Asp Ser Val Arg Phe Trp Leu Thr Glu Tyr Gly Val Asp Gly Phe

420 425 430

Arg Phe Asp Leu Met Gly Val Leu Asp Ile Glu Thr Met Arg Glu Val

435 440 445

Glu Ala Val Val His Ala Leu Asp Pro Ser Ala Leu Leu Leu Gly Glu

450 455 460

Gly Trp Asp Leu Pro Thr Pro Leu Pro Ala Glu Gln Lys Ala Thr Met

465 470 475 480

Asn Asn Ala Asp Lys Leu Pro Cys Ile Ala Tyr Phe Asn Asp Arg Phe

485 490 495

Arg Asp His Val Lys Gly Ser Thr Phe Ala Ile His Glu Lys Gly Phe

500 505 510

Ala Leu Gly Asn Met Ala Phe Arg Glu Gln Ala Met Arg Ala Ile Gln

515 520 525

Gly Asn Val Arg Ile Lys Lys Glu Ala Gly Met Phe Leu Asn Pro Thr

530 535 540

Gln Ala Val Asn Tyr Val Glu Ser His Asp Asn His Thr Phe Trp Asp

545 550 555 560

Lys Met Ser Val Ser Asn Ala Asp Glu Ser Glu Glu Ile Arg Gln Lys

565 570 575

Arg Gln Lys Leu Ala Thr Ala Phe Val Ile Leu Ser Gln Gly Ile Pro

580 585 590

Phe Leu His Ser Gly Gln Glu Phe Tyr Arg Thr Lys Gln Gly Ile Glu

595 600 605

Asn Ser Tyr Asn Ala Pro Asp Ala Ile Asn Gln Leu Asp Trp Arg Gln

610 615 620

Lys Ser Leu Tyr Glu Lys Asp Val Arg Tyr Val Ala Gly Leu Ile Gln

625 630 635 640

Leu Arg Lys Leu His Arg Ala Phe Arg Phe Ser Thr Ser Ala Glu Ile

645 650 655

Glu Lys His Leu Arg Leu Val Glu Glu Thr Pro Pro Ser Val Ile Ala

660 665 670

Tyr His Leu Gln Ser Val Gln Glu Tyr Gly Pro Trp Ser Asp Ile Leu

675 680 685

Val Ile His His Asn Gln Glu Ala Thr Glu Arg Leu Pro Leu Pro Asp

690 695 700

Glu Glu Glu Trp His Val Val Cys Asp His Thr Ala Ser Gly Thr Thr

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Pro Leu Tyr Thr Val Lys Gln Glu Ile Glu Val Gln Gly Ile Ser Thr

725 730 735

Phe Val Leu Thr Lys Met Thr Asp Leu Thr Lys Lys Ala Asn His Ile

740 745 750

<210> 2

<211> 2259

<212> DNA

<213> 嗜热厌氧芽孢杆菌(Anoxybacillus sp.)

<400> 2

gtgtatgagg tcttttcctc cttgatcctc aaaacaaatg aaaagatggg tttattcata 60

ttgggaggtg ccaatttgtt aactgttcat cgaacgtttg aagcgtatct ggatacgatg 120

acggtgatta caattttaat cccgaagtcg tatcattctg gaatggtcgg gaattttatt 180

atcgaaaagc caaatggaga acgatgtcag cttcaagtgg caaaacgaga agatttatgg 240

acaagtatta agtatgaatg tgtaatcgat tttgctgtcg agatcgggcg gaggtatctc 300

atttatgatg atcacggtgc ttttaccgat ttgcaaatcg gggcagtcat tcgcaccgca 360

gaatttgatg aacagtttta ttacgaaggg aatgaccttg gtatcaccta tactccagaa 420

gcaaccactt ttaagctttg ggctcctacg gcgacggaag tgaaggtgaa attgctcgat 480

gaggcggaag gaaagcagga gcaaattccg ctgcagcgca tggaaaaggg agtatggatg 540

actacagttt ccggagacct tgaaggaaga tattatacgt ttttagtgtg tgtgaacctt 600

gtttggcgtg aggctgttga tccatacgca atggctgttt cagtcaatgg agagtacggg 660

gttgtcgtcg atttggcgaa aacacatgtg ccgaagccaa cgctgtcgcc gttatcgtcc 720

ccgacggatg cgattattta tgaagtgcat attcgcgatt ttaccattca cggcgatagc 780

ggggtggctc acaaagggtt gtatttaggc cttgctgagc tcggaacaag cgggccaaat 840

aatacaacca caggcctttc ctatttagcg cagctaggag taacgcatgt agagttgctt 900

ccatttaacg attttgctgg agtagatgaa aaagccccgc tgaaggaata caactggggc 960

tataacccgc tgcattataa cgctcctgaa gggagctatg ccactaatcc gtttgatcca 1020

tatgcgcgga ttcaggagct gaaacaagcg atccgtgcgt tgcaggcaca gggcattcgc 1080

gtgattatgg atgctgttta taatcatgtc tatattcgcg agcagtcatc atttgaaaaa 1140

attgtccctg gttattattt tcgacatgat ctatatggaa tgccatccaa tggaacagga 1200

gtggggaatg acatagcatc ggaacggcgg atggtgcgaa aatttattgt tgactctgtg 1260

cgtttttggc tgactgagta tggggtggac ggatttcgtt ttgacttaat gggagtttta 1320

gatatagaga cgatgagaga agtggaggcc gtcgtccatg cgctcgatcc gtccgcactt 1380

ttgcttggcg agggatggga tttgccgacc cctcttcctg ccgagcaaaa agctacgatg 1440

aacaacgctg acaagctgcc ttgtattgcg tattttaatg acagatttcg cgatcatgtc 1500

aaaggaagta cctttgctat tcatgaaaag gggtttgcat taggaaatat ggctttccgt 1560

gagcaagcga tgcgagcgat ccaaggcaat gtgcgaatta aaaaagaagc agggatgttt 1620

ctgaacccaa cgcaagcggt caattatgtt gaatcacatg ataatcacac gttctgggat 1680

aaaatgagcg tgtccaatgc ggatgaaagt gaagagattc gtcagaaacg gcaaaagctg 1740

gccaccgctt ttgttattct ctcgcaaggc attccgtttt tgcatagcgg ccaagaattt 1800

tatcggacga agcaagggat agaaaacagc tataatgctc cggatgccat taaccagctt 1860

gattggaggc aaaaaagcct gtatgagaag gatgtgcggt atgttgcagg attgattcaa 1920

ctgcgcaagc ttcatcgggc tttccgcttt tcaacgtctg ccgaaatcga aaaacatctt 1980

cgattggttg aagagactcc gccatctgtc attgcttatc atcttcaatc cgtgcaagaa 2040

tatgggccat ggagcgatat tttggtcatt catcataatc aagaagcaac agagcgctta 2100

ccccttccgg atgaggagga atggcatgtc gtgtgcgatc acacagcgag cggaacgact 2160

cctttataca ccgtgaaaca agagattgaa gtccagggga tcagtacgtt tgttcttacg 2220

aaaatgactg acttgacgaa aaaagcaaat cacatataa 2259

<210> 3

<211> 752

<212> PRT

<213> 嗜热厌氧芽孢杆菌(Anoxybacillus sp.)

<400> 3

Met Tyr Glu Val Phe Ser Ser Leu Ile Leu Lys Thr Asn Glu Lys Met

1 5 10 15

Gly Leu Phe Ile Leu Gly Gly Ala Asn Leu Leu Thr Val His Arg Thr

20 25 30

Phe Glu Ala Tyr Leu Asp Thr Met Thr Val Ile Thr Ile Leu Ile Pro

35 40 45

Lys Ser Tyr His Ser Gly Met Val Gly Asn Phe Ile Ile Glu Lys Pro

50 55 60

Asn Gly Glu Arg Cys Gln Leu Gln Val Ala Lys Arg Glu Asp Leu Trp

65 70 75 80

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100 105 110

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115 120 125

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Glu Ala Glu Gly Lys Gln Glu Gln Ile Pro Leu Gln Arg Met Glu Lys

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180 185 190

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Leu Ala Lys Thr His Val Pro Lys Pro Thr Leu Ser Pro Leu Ser Ser

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Pro Thr Asp Ala Ile Ile Tyr Glu Val His Ile Arg Asp Phe Thr Ile

245 250 255

His Gly Asp Ser Gly Val Ala His Lys Gly Leu Tyr Leu Gly Leu Ala

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275 280 285

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<210> 4

<211> 2259

<212> DNA

<213> 嗜热厌氧芽孢杆菌(Anoxybacillus sp.)

<400> 4

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