基于网络药理学与分子对接技术探讨红花治疗视网膜静脉阻塞的作用机制研究

摘要

本文旨在通过网络药理学和分子对接技术探讨红花治疗视网膜静脉阻塞(RVO)的分子作用机制.首先,通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取红花的活性成分和潜在作用靶点.然后,利用GeneCards数据库和OMIM数据库收集RVO相关疾病靶点,借助R3.6.3软件运行R语言获取红花-RVO交集靶点数据集,通过Fun-Rich 3.1.3软件绘制Venn图和Cytoscape 3.7.0软件构建疾病-成分-靶点网络.利用String数据库和Cytoscape 3.7.0软件绘制蛋白互作(PPI)网络.利用Metascape数据库进行GO和KEGG富集分析.最后,利用AutoDock Vina 1.1.2软件对红花主要活性成分与对应关键靶点进行分子对接验证.本研究共筛选得到红花22个活性成分、186个潜在作用靶点及1 842个RVO相关疾病靶点,最终得到128个红花-RVO交集靶点.PPI网络分析表明,AKT1、JUN、IL6、MAPK1、MAPK8、EGF、CXCL8、MMP9等可能是治疗RVO的核心靶点.GO富集分析,共得到生物过程(BP)条目2 000个,分子功能(MF)条目174个,细胞成分(CC)条目108个;KEGG富集分析,共筛选得到167条信号通路.分子对接结果提示,槲皮素、木犀草素、山柰酚等与AKT1、IL6、MAPK1、MAPK8、VEGFA等关键靶点有着较好的结合活性.槲皮素、木犀草素、黄芩素、β-谷甾醇等化合物可能是治疗RVO的物质基础,通过作用于AKT1、IL6、VEGFA、MAPKl、MAPK8、JUN等关键靶点,同时调控PI3K/Akt信号通路、IL-17信号通路、NF-KB信号通路、VEGF信号通路等多种信号途径,从而发挥抑制炎性反应、抗氧化应激及调节免疫等作用.