三种七叶一枝花活性成分抗新型冠状病毒的分子对接预测

摘要

以分子对接法探索中草药七叶一枝花治疗新型冠状病毒SARS-CoV-2的活性化合物.SARS-CoV-2主要通过其S蛋白与人体细胞表面的Angiotensin-converting enzyme 2(ACE2)受体结合.本研究通过分子对接模拟预测了七叶一枝花中富含的3种重楼皂苷(Ⅰ、Ⅵ、Ⅶ)与ACE2的结合亲和力.结果 表明:三种重楼皂苷均能够与ACE2结合,结合自由能均低于-8 kcal/mol.三种化合物共同结合的氨基酸残基包括:Pro-346、Thr-347、Ala-348、Asp-350、Asn-394、His-401、Glu-402.三种药物结合以上位点的结构主要是共同的母核结构起着关键作用.另外,重楼皂苷Ⅰ与ACE2结合所需能量最低,而重楼皂苷Ⅵ与靶蛋白作用的关键氨基酸数量最多及形成的氢键数量最多.因此,基于这三种有效成分进行结构设计有望获得高效的SARS-CoV-2抑制剂,以期为COVID-19治疗药物发现提供研究基础.