一株动性球菌ZOYM的初步鉴定及其内源性质粒pPCZ1和pPCZ2的分析

摘要

从来自中国深海的样品中分离到一株菌株ZOYM,PCR获得其16S rRNA基因序列,经比对,与已发表的动性球菌属(Planococcus)的不同种高度相似.提取质粒DNA,在琼脂糖凝胶上检测到多条DNA带,对其中2个小的环型质粒pPCZ1和pPCZ2进行了克隆和测序.pPCZ1和pPCZ2的全长分别为4738 bp和7935 bp,编码3个和8个蛋白.预测的pPCZl和pPCZ2的复制蛋白Rep分别与链球菌(Staphylococcus)质粒pSCFS1和芽孢杆菌(Bacillus)质粒pBM19的Rep有很高的相似性.此外,pPCZ1和pPCZ2的复制蛋白Rep之间也有一定的同源性.质粒pPCZ1和pPCZ2上均未找到滚环复制质粒保守的dso和SSO序列,而在复制基因的上游均发现有多个重复序列和富含AT的序列,因此,推测它们可能不是以滚环方式进行复制,而是theta方式.这是首次报道动性球菌属两个质粒的完整序列.