食管鳞状细胞癌肿瘤组织内菌群检测及特征分析

摘要

【目的】分析食管鳞癌患者(ESCC组)与健康对照组(HC组)肿瘤组织菌群多样性,筛选出食管鳞癌患者肿瘤组织中特异性细菌。【方法】收集105例食管鳞癌患者肿瘤组织标本和54例健康对照者的食管组织标本,提取标本总DNA,用PCR方法扩增16S rDNA V4区,后行高通量测序,将数据做OTU聚类及多样性分析筛选食管鳞癌组织内特征菌。最后用定量PCR(Q-PCR)扩增方法验证筛选结果。【结果】多样性分析表明ESCC组肿瘤标本和HC组正常食管组织标本内菌群多样性及组成存在明显差异,物种分析表明ESCC组以梭杆菌属(Fusobacterium)、孪生球菌属(Gemella)、奈瑟菌属(Neisseria)、卟啉单胞菌属(Porphyromonas)、链球菌属(Streptococcus)为主,HC组以梭杆菌属(Fusobacterium)、放线杆菌属(Actinobacillus)、链球菌属(Streptococcus)、普雷沃氏菌属(Prevotella)为主,LEfSe分析表明ESCC组卟啉菌属、梭杆菌属丰度升高,且具有统计学差异(P<0.05)。Q-PCR验证结果表明食管鳞癌组织内牙龈卟啉单胞菌、具核梭杆菌拷贝数明显升高。【结论】食管癌肿瘤组织有其特征性的菌群组成,与健康对照组相比,食管鳞癌肿瘤组织中牙龈卟啉单胞菌、具核梭杆菌拷贝数明显升高,可能是其特征性的细菌。