急性GVHD中Treg细胞相关基因筛选及生物信息学分析

摘要

目的:探讨急性移植物抗宿主病(a GVHD)中Treg细胞(调节性T细胞)的基因表达谱变化,为认识a GVHD的发病机制提供新的思路,同时也为早期诊断和治疗寻找潜在重要靶标分子。方法:利用GEO数据库下载a GVHD基因芯片数据,通过差异基因的筛选,GO分析,信号通路分析,最后获得的重要差异基因,并建立相互作用网络。结果:获得显著表达差异基因533个,功能富集分析及信号通路分析提示主要涉及到细胞周期、免疫反应、凋亡过程、细胞因子介导信号通路、同种异体移植物排斥、移植物抗宿主反应等。相互作用网络分析,得到前10个核心节点基因:PIK3R3、IL8、SOCS3、INPP4B、PIP5K1B、CSF2RB、IRS2、MYC、FOS、SOCS2。结论:利用生物信息学的方法,分析a GVHD基因芯片得到参与a GVHD的重要的细胞功能及信号通路,并且寻找到核心节点基因,为认识a GVHD的机制及治疗靶点提供新的思路。