基于高通量测序重茬草莓土壤细菌和真菌多样性分析

摘要

研究利用Illumina Miseq高通量测序技术,比较新茬草莓和连作3年草莓根际土壤细菌、真菌群落多样性,旨在了解其微生物群落生态特征,为防治连作障碍奠定基础。结果:重茬3年后土壤中细菌物种多样性及丰富度降低;新茬土壤中丰度最高的鞘氨醇单胞菌被节杆菌属取代,肠杆菌属丰度显著升高。对于真菌来讲,重茬3年后土壤中真菌物种多样性和丰富度增大;新茬土壤中含有植物病原菌链格孢菌和茎点霉菌,重茬3年后枝顶孢属、被孢霉属、镰刀菌属等病原菌大量积累。结论:重茬土壤中细菌多样性降低、真菌多样性增高,病原真菌积累是引起草莓连作障碍的主要原因。