鸡miR-21的组织表达谱及其功能预测分析

摘要

已知mi R-21在多种生物学过程中发挥重要的调控作用,然而有关鸡mi R-21功能的研究尚未见报道。为了解鸡mi R-21的潜在生物学功能,采用q RT-PCR检测了固始鸡5个发育阶段、15种组织中mi R-21的表达情况。同时,利用Pictar和Target Scan算法预测了mi R-21的靶基因并对预测的靶基因进行了Gene Ontology分析和通路分析。结果显示,mi R-21的表达具有明显的时序特征,除14胚龄鸡的小脑和腺胃外,胚胎期各组织中mi R-21的表达水平均显著低于出壳后对应组织的表达水平;出壳后鸡的下丘脑、大脑、小脑、小肠、肝脏、胸肌和肾脏等组织中mi R-21的表达水平随发育进程均显著上调。生物信息学分析显示,预测的mi R-21的靶基因在基因表达调控、大分子代谢调控、转录调控、细胞代谢调控、细胞衰老和增殖、呼吸系统发育、骨骼发育、心脏发育和神经系统发育等广泛的生物学过程中显著富集。总之,鸡mi R-21为广泛性时序表达mi RNA,可能参与鸡出壳后诸多器官发育相关的生物学过程的调控。