基于16SrDNA高通量测序方法检测猪舍空气微生物多样性

摘要

采用16SrDNA高通量测序方法研究猪舍空气微生物的多样性.实验采用Illumina MiSeq 2×250系统,对细菌16SrDNA (V4)区进行测序;采用QIIME软件对数据进行分析.结果表明:猪舍空气微生物多样性丰富,基于97％的相似规律来确定OTU (operational taxonomical unit),其中,有16种门、115种科、217种属被鉴定;在属水平上,10种优势菌群是Pseudomonas、Acinetobacter、Streptococcus、Lactococcus、Enhydrobacter、Lactobacillus、Chryseobacterium、Wautersiella、Flavobacterium、Leuconostoc,其中,6种被报道为病原微生物.实验结果表明,了解猪舍空气微生物的多样性、丰度及优势菌群的病原性对猪舍疾病防控有一定指导意义.