通过生物信息学分析鉴定干燥综合征的关键基因

摘要

目的:使用生物信息学方法鉴定干燥综合征(SS)的关键差异表达基因(DEGs).方法:从基因数据库中下载GSE23117和GSE127952的基因表达谱,用GEO2R在线工具和Venn软件筛选出其中的DEGs.通过DAVID网站进行GO和KEGG分析.使用STRING工具建立蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,用Cytoscape软件进行模块分析.结果:在SS标本中总共检测到31个DEGs重叠区域.其中28个上调基因和3个下调基因主要在免疫炎症中起作用.KEGG分析显示DEGs与细胞因子-细胞因子受体相互作用、趋化因子信号通路、阿米巴病和白细胞跨内皮迁移有关.PPI和模块分析显示CXCL9、CXCL11、CXCL13、CCR1、CD69、PTPRC、GPR183、MMP9和IL-10基因显著富集.结论:CXCL9、CXCL11、CXCL13、CCR1、CD69、PTPRC、GPR183、MMP9和IL-10可能与SS的发生和进展有关.