DNA链

摘要： 近日,美国博伊西州立大学核酸记忆研究所开发出一种存储数据的方法,利用DNA制成“钉子”和“钉子板”,采用相距约10纳米的DNA链模式存储数据,并利用显微镜检索数据。这是一种分子版本的“彩灯盒”。彩灯盒是一种把许多彩灯插在木制盒子上排列出图案的玩具,通电后彩灯会被点亮。

摘要： 构思及基本图形的设计众所周知,DNA分子是由两条反向平行的脱氧核苜酸长链盘旋而成的。对于这样的“链条”,我们先制作一个最基本的“DNA链”,然后通过复制粘贴,“拼装”成完整的DNA分子,并为其添加相应的动画特效。具体说来,“DNA链”的制作,我们需要执行以下操作。

摘要： McGill大学的研究人员用DNA链对聚合物微粒进行化学成型一这种技术可能推动新材料从生物医学到“软机器人”领域的应用。

摘要： 中国邮递员问题是求邮递员从邮局出发,走遍他所管辖的每条街道,将信件送到后返回回邮局的最短路线,将邮递员问题用图论的语言描述,本文采用把数学问题转换到DNA链上的算法,对给定图G中的每条边进行编码,并编码出连接DNA链,生成问题的解的DNA链,及相应的生物操作把最终链分离,本文给出的一种DNA编码方法,并设计一种用6个顶点求解的中国邮递员问题的算法,证明提出的DNA计算方式的算法有效可行.

摘要： 据荷兰国家新闻台报道,荷兰代尔夫特理工大学的一个国际研究团队解开了一个生物谜题:我们的基因是如何被包裹装在细胞中的?人体有数十亿个细胞,如果将人类每个细胞中DNA链完全展开,大约有2米长。之前科学家已经知道是凝聚蛋白将DNA包装成了微型包裹,而今荷兰专家却可以解释并亲眼看到凝聚蛋白质是如何做到这一点的,它们是通过将DNA扣合在一起成环状而保持在一起。

摘要： 中国邮递员问题是求邮递员从邮局出发,走遍他所管辖的每条街道,将信件送到后返回回邮局的最短路线,将邮递员问题用图论的语言描述,本文采用把数学问题转换到DNA链上的算法,对给定图G中的每条边进行编码,并编码出连接DNA链,生成问题的解的DNA链,及相应的生物操作把最终链分离,本文给出的一种DNA编码方法,并设计一种用6个顶点求解的中国邮递员问题的算法,证明提出的DNA计算方式的算法有效可行。

摘要： Nature封面：一幅利用DNA自组装技术创造出来的8704像素的《蒙娜丽莎》画像.Nature杂志第7683期封面文章报道了使用二维DNA纳米结构产生具有纳米精度的表面图案新进展.钱璐璐等在一个多级加工过程中递归应用简单的组装规则,就可以利用一小组特别的DNA链创造出最大达0.5平方微米的2D阵列.

摘要： 日前，美国加州理工大学研发出一款新型机器人．其由单个DNA链组成，可自动提取分子并将其移动到特定的位置，其递送物质的成功率为80％。研发团队对该DNA机器人进行了测试，他们设计出一个长宽均为58nm的平坦场地，场地中间有上百个DNA“石柱”，用于机器人在其间跳行。

摘要： 化疗的目的是为了杀死癌细胞，而不是让患者掉光头发。加拿大科学家日前创建出的一种分子交付新系统，可确保化疗药物抵达目标的同时，尽量减少附带损害。

摘要： 以色列巴伊兰大学研究人员成功地用DNA链造出了一种纳米机器人，它们能在活动物体内按照编制的程序执行逻辑操作，就像一种纳米机器人计算机。物理学家组织网近日报道了这一研究成果。研究人员把这些“机器人”注射到蟑螂体内，观察它们是怎样瞄准一个细胞来“工作”的。相关论文发表在最近出版的《自然·纳米技术》上。

摘要： 辐射粒子对人体造成的辐射生物学效应，归根结底是由于低能电子损伤DNA引起的，因此低能电子致DNA损伤具有非常重要的研究价值。为了模拟计算低能电子对DNA造成的链断裂损伤情况，本文开发了一个包含物理模块，前化学模块，化学模块以及DNA损伤分析模块的纳剂量蒙特卡罗模拟程序。采用本文计算的电子与液态水的反应截面替换Geant4-DNA中的截面库，采用其物理模块计算出获取低能电子在无限大水体中的径迹信息。随后通过前化学模块、化学模块以及DNA损伤判断模块的计算统计分析，统计得出低能电子对该DNA的脱氧核糖核糖核苷酸造成的断裂数量和位置，判断该DNA链的断裂类型。将模拟结果与国际上已发表的实验数据进行比对，二者符合良好。

摘要： 辐射粒子对人体造成的辐射生物学效应，归根结底是由于低能电子损伤DNA引起的，因此低能电子致DNA损伤具有非常重要的研究价值。为了模拟计算低能电子对DNA造成的链断裂损伤情况，本文开发了一个包含物理模块，前化学模块，化学模块以及DNA损伤分析模块的纳剂量蒙特卡罗模拟程序。采用本文计算的电子与液态水的反应截面替换Geant4-DNA中的截面库，采用其物理模块计算出获取低能电子在无限大水体中的径迹信息。随后通过前化学模块、化学模块以及DNA损伤判断模块的计算统计分析，统计得出低能电子对该DNA的脱氧核糖核糖核苷酸造成的断裂数量和位置，判断该DNA链的断裂类型。将模拟结果与国际上已发表的实验数据进行比对，二者符合良好。

摘要： 辐射粒子对人体造成的辐射生物学效应，归根结底是由于低能电子损伤DNA引起的，因此低能电子致DNA损伤具有非常重要的研究价值。为了模拟计算低能电子对DNA造成的链断裂损伤情况，本文开发了一个包含物理模块，前化学模块，化学模块以及DNA损伤分析模块的纳剂量蒙特卡罗模拟程序。采用本文计算的电子与液态水的反应截面替换Geant4-DNA中的截面库，采用其物理模块计算出获取低能电子在无限大水体中的径迹信息。随后通过前化学模块、化学模块以及DNA损伤判断模块的计算统计分析，统计得出低能电子对该DNA的脱氧核糖核糖核苷酸造成的断裂数量和位置，判断该DNA链的断裂类型。将模拟结果与国际上已发表的实验数据进行比对，二者符合良好。

摘要： 辐射粒子对人体造成的辐射生物学效应，归根结底是由于低能电子损伤DNA引起的，因此低能电子致DNA损伤具有非常重要的研究价值。为了模拟计算低能电子对DNA造成的链断裂损伤情况，本文开发了一个包含物理模块，前化学模块，化学模块以及DNA损伤分析模块的纳剂量蒙特卡罗模拟程序。采用本文计算的电子与液态水的反应截面替换Geant4-DNA中的截面库，采用其物理模块计算出获取低能电子在无限大水体中的径迹信息。随后通过前化学模块、化学模块以及DNA损伤判断模块的计算统计分析，统计得出低能电子对该DNA的脱氧核糖核糖核苷酸造成的断裂数量和位置，判断该DNA链的断裂类型。将模拟结果与国际上已发表的实验数据进行比对，二者符合良好。

摘要： 辐射粒子对人体造成的辐射生物学效应，归根结底是由于低能电子损伤DNA引起的，因此低能电子致DNA损伤具有非常重要的研究价值。为了模拟计算低能电子对DNA造成的链断裂损伤情况，本文开发了一个包含物理模块，前化学模块，化学模块以及DNA损伤分析模块的纳剂量蒙特卡罗模拟程序。采用本文计算的电子与液态水的反应截面替换Geant4-DNA中的截面库，采用其物理模块计算出获取低能电子在无限大水体中的径迹信息。随后通过前化学模块、化学模块以及DNA损伤判断模块的计算统计分析，统计得出低能电子对该DNA的脱氧核糖核糖核苷酸造成的断裂数量和位置，判断该DNA链的断裂类型。将模拟结果与国际上已发表的实验数据进行比对，二者符合良好。

摘要： 本文进行了DNA链(5'-AGC TCAGCAACGATG-3')吸附在粗糙金电极和化学合成金纳米粒子上拉曼光谱的研究.对该DNA链的SERS谱峰进行了指认.结果表明粗糙金电极和金纳米粒子上的SERS谱有较大的差别.这主要是由于在两种SERS基底上DNA链的吸附构型不同.在12 nm金纳米粒子上,金纳米粒子与DNA链的碱基接触有利,而在金电极上DNA链主要以5'端A碱基吸附.这两种不同吸附方式导致SERS谱有较大的不同.

摘要： 本文进行了DNA链(5'-AGC TCAGCAACGATG-3')吸附在粗糙金电极和化学合成金纳米粒子上拉曼光谱的研究.对该DNA链的SERS谱峰进行了指认.结果表明粗糙金电极和金纳米粒子上的SERS谱有较大的差别.这主要是由于在两种SERS基底上DNA链的吸附构型不同.在12 nm金纳米粒子上,金纳米粒子与DNA链的碱基接触有利,而在金电极上DNA链主要以5'端A碱基吸附.这两种不同吸附方式导致SERS谱有较大的不同.

摘要： 本文进行了DNA链(5'-AGC TCAGCAACGATG-3')吸附在粗糙金电极和化学合成金纳米粒子上拉曼光谱的研究.对该DNA链的SERS谱峰进行了指认.结果表明粗糙金电极和金纳米粒子上的SERS谱有较大的差别.这主要是由于在两种SERS基底上DNA链的吸附构型不同.在12 nm金纳米粒子上,金纳米粒子与DNA链的碱基接触有利,而在金电极上DNA链主要以5'端A碱基吸附.这两种不同吸附方式导致SERS谱有较大的不同.

摘要： 本文进行了DNA链(5'-AGC TCAGCAACGATG-3')吸附在粗糙金电极和化学合成金纳米粒子上拉曼光谱的研究.对该DNA链的SERS谱峰进行了指认.结果表明粗糙金电极和金纳米粒子上的SERS谱有较大的差别.这主要是由于在两种SERS基底上DNA链的吸附构型不同.在12 nm金纳米粒子上,金纳米粒子与DNA链的碱基接触有利,而在金电极上DNA链主要以5'端A碱基吸附.这两种不同吸附方式导致SERS谱有较大的不同.

摘要： 操纵生物大分子以在纳米尺度上构造分子建筑，是当今分子操纵领域中很具吸引力的研究主题。

摘要： 一种合成双端修饰的长单链DNA的方法及所获得的长单链DNA，属于DNA合成技术领域，解决了现有长单链DNA的合成方法存在的成本高、成功率低、无法在单链DNA两端选择性修饰的问题。本发明的一种合成双端修饰的长单链DNA的方法，包括以下步骤：第一次滚环扩增反应：采用phi29 DNA聚合酶、带有官能团X的短链引物和环状模板合成一端带有官能团X的单链DNA；第二次滚环扩增反应：将上述获得的单链DNA作为引物，采用Therminator DNA聚合酶和带有官能团Y的dN*TPs合成双端带有官能团的长单链DNA。本发明的合成方法适用于合成长度能够达到500个碱基以上的、只在双端带有修饰基团的单链DNA。

摘要： 本发明属于分子生物学技术领域，提供一种等温解开双链DNA的方法以及基于该方法制备单链DNA的方法。等温解开双链DNA的技术方案为利用重组酶结合单链DNA探针形成复合物，复合物识别双链DNA中与单链DNA探针同源的序列并侵入双链DNA，从而实现双链DNA的等温开链，随后单链DNA探针和双链中一条链互补配对，而单链结合蛋白结合另一条链稳定开链结构。基于该方案及单链DNA探针3’‑末端可以被连接酶和聚合酶等酶识别的特性，本发明还提出了制备单链DNA的方案，并详细介绍了通过连接酶或延伸酶制备单链DNA的方案。以上技术方案均可在等温条件下完成，且无需ATP循环系统，甚至ATP可被dATP替代，所用酶来源广泛、易于获得，为等温技术以双链DNA作为研究对象提供了一个通用平台。

摘要： 本发明提供含有三链体结构，如那些由在HIV-1线性DNA基因组中心处HIV-1逆转录的中心起始和终止产生的三链体结构，的核酸、载体、病毒和重组细胞。这些三链体结构可充当HIV-1DNA向核输入的顺式决定因子，允许感染非分裂靶细胞。一方面，在HIV载体中存在DNA三链体序列强烈刺激在造血干细胞中的基因转移。本发明还提供使用这些三链体结构制备重组细胞的方法，以及使用这些重组细胞体内和体外表达目的蛋白的方法。

摘要： 本发明为一种引物，该引物用于核酸的扩增，具有下述式(1)所示的结构。(这里，B表示碱基，R1表示分解性保护基，R2表示氢或羟基。＊是指与相邻的核苷酸的糖的键。)。本发明还为一种双链DNA的制造装置，具备：具有式(1)所示的结构的正向引物和反向引物；PCR装置，以模板DNA为模板进行多个循环的PCR，生成3’末端凹陷的双链DNA；以及光照射设备，将R1脱保护以形成3’末端突出的粘附末端。

摘要： 本发明提供一种引物，该引物用于核酸的扩增，具有下述式(1)所示的结构。(这里，A1表示－S－、－S－S－或－Se－，B表示碱基，R1表示分解性保护基。＊是指与相邻的核苷酸的糖的键。)。本发明还提供一种双链DNA的制造装置，具备：具有式(1)所示的结构的正向引物和反向引物；PCR装置，以模板DNA为模板进行多个循环的PCR，生成3’末端凹陷的双链DNA；使3’末端成为平滑末端的克列诺片段；以及光照射设备，将R1脱保护以形成3’末端突出的粘附末端。

摘要： 本发明提供了一种用于核酸原位杂交信号放大的单链DNA制备方法，属于分子生物学技术领域。所述制备方法包括：以基因识别引物、第一磷酸化环化引物和DNA连接酶为原料，进行连接反应；连接反应完成后加入Bst DNA聚合酶和dNTP，进行滚环扩增反应，反应温度为45‑55°C，反应时间为1‑3h，获得用于核酸原位杂交信号放大的单链DNA；其中，所述第一磷酸化环化引物包含片段C，所述C的局部片段与第一荧光探针的核酸片段序列相同；或者，所述C的局部片段与二级放大单链DNA的局部片段核苷酸序列相同。该方法具有经济实用、步骤简单和灵敏度高的优点。本发明还提供一种用于核酸原位杂交信号二级放大的单链DNA制备方法。

摘要： 本发明涉及线性双链DNA，其在其非编码链的3'末端偶联到单个支持物或标签，以及制备所述线性双链DNA的方法。本发明还涉及所述线性双链DNA在RNA体外转录反应中的用途，并且还涉及体外制备RNA的方法。本发明还涉及用于RNA体外转录的生物反应器。

摘要： 本发明公开了一种单链分子标签接头及单链DNA建库方法及其在检测循环肿瘤DNA中应用，单链分子标签接头，包括：14个碱基配对形成的茎结构、测序引物序列、和8个随机核苷酸组成的分子标签序列，其中测序引物序列与茎结构序列之间插入了一位碱基“U”，该单链核酸序列经退火变性会形成茎环结构；本发明通过单链DNA建库，解决现有检测技术中对液态活检特别是ctDNA片段短、浓度低、碎片化、灵敏度低技术问题；实现准确辨别基因组坐标始末位点相同的测序reads是来自同一还是多个原始细胞释放出来的cfDNA，并将来源于同一个细胞的原始正负链的测序reads配对起来分析的目的，从而降低测序的重复劳动，提高对假阳性突变的分辨率。

摘要： 一种合成双端修饰的长单链DNA的方法及所获得的长单链DNA，属于DNA合成技术领域，解决了现有长单链DNA的合成方法存在的成本高、成功率低、无法在单链DNA两端选择性修饰的问题。本发明的一种合成双端修饰的长单链DNA的方法，包括以下步骤：第一次滚环扩增反应：采用phi29 DNA聚合酶、带有官能团X的短链引物和环状模板合成一端带有官能团X的单链DNA；第二次滚环扩增反应：将上述获得的单链DNA作为引物，采用Therminator DNA聚合酶和带有官能团Y的dN*TPs合成双端带有官能团的长单链DNA。本发明的合成方法适用于合成长度能够达到500个碱基以上的、只在双端带有修饰基团的单链DNA。

摘要： 本发明属于分子生物学技术领域，提供一种等温解开双链DNA的方法以及基于该方法制备单链DNA的方法。等温解开双链DNA的技术方案为利用重组酶结合单链DNA探针形成复合物，复合物识别双链DNA中与单链DNA探针同源的序列并侵入双链DNA，从而实现双链DNA的等温开链，随后单链DNA探针和双链中一条链互补配对，而单链结合蛋白结合另一条链稳定开链结构。基于该方案及单链DNA探针3’‑末端可以被连接酶和聚合酶等酶识别的特性，本发明还提出了制备单链DNA的方案，并详细介绍了通过连接酶或延伸酶制备单链DNA的方案。以上技术方案均可在等温条件下完成，且无需ATP循环系统，甚至ATP可被dATP替代，所用酶来源广泛、易于获得，为等温技术以双链DNA作为研究对象提供了一个通用平台。