古细菌

摘要： 在人体皮肤表面和体腔内,存在着大量相互作用的微生物,包括细菌、真菌、古细菌、噬菌体和真核病毒等[1]。其中绝大多数微生物都栖息于肠道内,被统称为肠道微生物群,它们的协同作用对人体健康和人类生活至关重要。早期针对人体肠道微生物来源的研究证实,肠道微生物最初是由母亲体内的微生物构建雏形,并随着出生、进食、与外界环境的接触而不断发展变化[2]。

摘要： 人是拥有10^(13)个微生物的“生态系统”现代人常常把自己称作孤岛,在生理学上,这句话是成立的--人体存在着数以亿计的微生物群落,涵盖了细菌、真菌、病毒,甚至还有少部分从远古洪荒穿越而来的古细菌。如果把人体比作地球,那皮肤、肠道、口腔、呼吸道就是微生物的非洲大草原,他们在这些地方同吃同住,既靠人体营养物质的滋养存活,也可以反过来作用于人体,影响身体机能,形成一个和谐的生态系统。

摘要： 美国科学家在加利福尼亚州的泥地发现了奇怪的DNA链,他们将其命为“博格人”(《星际迷航》中的夕卜星种族)。严格意义上讲,这些链不具有活性,而是由从微生物体内同化的基因组成的。作为迄今为止发现的最长的染色体外遗传物质,这些链很可能会进入单细胞古细菌体内,帮助它们分解甲烷。

摘要： 细菌遭遇强敌话说30多亿年前,地球上没有植物,也没有动物,一切看上去死气沉沉的,毫无生机。不过,在漆黑的海洋深处,正在上演着生死大战。那时,海洋里有两类结构非常简单的单细胞微生物——细菌和古细菌。细菌大家比较熟悉,地球的各个角落,包括人体中的某些地方,都有细菌繁衍生息。

摘要： 在大自然漫长进化过程中,适者生存,物竞天择.在与地球形成早期的环境特别相似的恶劣条件中,生存着一种最古老的生命——古细菌,本文拟从古细菌研究的必要性和重要性、古细菌耐受性分析、存在的地理位置、次生代谢的网络结构等方面进行阐述,期望通过对古细菌多层次探讨,能进一步了解其本源,以期更好地利用古细菌.

摘要： 人工培养噬菌体成功阻止“超级细菌”生长噬菌体是一种感染细菌和古细菌的病毒,其特点是以细菌为宿主,专门攻击特定的细菌,因此可以作为抗生素的替代品。随着抗生素的大量使用,一些细菌对抗生素产生了耐药性。噬菌体对引起疾病的细菌种类有针对性的作用。

摘要： 作为重大进化谜题,真核生物起源的研究对于解码真核基因组、阐释真核细胞内部结构之间的关系有重要启示作用.在1977年美国微生物学家Carl Woese发现古细菌并提出三域生命之树之后,大量研究显示古细菌与真核生物在进化上存在着密切联系.21世纪以来,系统发育分析方法不断改进,泉古菌门(Crenarchaeota)、广古菌门(Euryarchaeota)之外与真核生物更加相似的新古细菌门类也相继被发现,这些证据更加支持将真核生物与古细菌合并为一域,形成二域生命之树.目前,通过宏基因组技术发现的Asgard古细菌是与真核生物进化距离最近的原核生物.然而,真核生物祖先的身份以及线粒体起源的时间等核心问题仍是学术界争论的焦点.本文结合近年来国内外研究成果,从生命之树的形态变化与真核生物演变的具体机制两个角度梳理了目前对真核生物起源的认知过程、现有水平和研究前景,以期为揭示真核生物起源进程的后续研究提供参考与指引.

摘要： 本研究采用16S rDNA扩增限制性酶切片段多态性(ARDRA)和序列分析的方法,对生长在不同温度下的厚指海绵(Pachychalina sp.)体内的古菌多样性进行了研究.结果发现:同一种厚指海绵(Pachychalina sp.)在不同的温度条件下,其体内古细菌的群落结构有明显的差异.古细菌16S rDNAs的限制性酶切图谱揭示:16°C条件下,海绵体内各不同古细菌在数量组成上较为均衡;30°C条件下,海绵体内80％古细菌16S rDNAs酶切后产生相同的酶切结果,通过它所对应的古细菌16S rDNA的序列进行分析后发现它们属于嗜酸热原体,但与Thermoplasmales acidophilum clone SB95-72的16S rDNA间的同源率只有85.6％,因此,认为它们可能是一种新型嗜酸热原体古细菌.研究同时发现:16°C和30°C条件下,海绵体内的古细菌均属于Methanogenium organophilum、Archaeoglobus fulgidus、Methanoplanus petrolearius、Methanospirillum hungatei和Thermoplasmales acidophilum.该研究认为:温度可能只改变了海绵体内不同古细菌的数量,但没有改变古细菌的种类.

摘要： 信息离散性度量方法——FDOD方法是新发展的一种非比对距离方法,本文将其应用于微生物全蛋白质组的系统发育分析,所得进化树包括145个细菌、18个古细菌和5个真核生物,大部分低层分支与《伯杰氏系统细菌学手册》相一致,并且对高层分支关系给出了一些新的建议.

摘要： 细胞分裂周期蛋白Cdc45作为复制型解螺旋酶复合物CMG(Cdc45-MCM helicase-GINS)的核心亚基之一,对基因组DNA解链成单链DNA至关重要.在原核生物中并没有发现Cdc45的高度序列同源蛋白.关于Cdc45的进化来源一直是一个谜.最近人Cdc45蛋白结构的解析为进一步认识其功能、寻找其进化祖先提供了基础.

摘要： 细胞分裂周期蛋白Cdc45作为复制型解螺旋酶复合物CMG(Cdc45-MCM helicase-GINS)的核心亚基之一,对基因组DNA解链成单链DNA至关重要.在原核生物中并没有发现Cdc45的高度序列同源蛋白.关于Cdc45的进化来源一直是一个谜.最近人Cdc45蛋白结构的解析为进一步认识其功能、寻找其进化祖先提供了基础.

摘要： 细胞分裂周期蛋白Cdc45作为复制型解螺旋酶复合物CMG(Cdc45-MCM helicase-GINS)的核心亚基之一,对基因组DNA解链成单链DNA至关重要.在原核生物中并没有发现Cdc45的高度序列同源蛋白.关于Cdc45的进化来源一直是一个谜.最近人Cdc45蛋白结构的解析为进一步认识其功能、寻找其进化祖先提供了基础.

摘要： 细胞分裂周期蛋白Cdc45作为复制型解螺旋酶复合物CMG(Cdc45-MCM helicase-GINS)的核心亚基之一,对基因组DNA解链成单链DNA至关重要.在原核生物中并没有发现Cdc45的高度序列同源蛋白.关于Cdc45的进化来源一直是一个谜.最近人Cdc45蛋白结构的解析为进一步认识其功能、寻找其进化祖先提供了基础.

摘要： 细胞分裂周期蛋白Cdc45作为复制型解螺旋酶复合物CMG(Cdc45-MCM helicase-GINS)的核心亚基之一,对基因组DNA解链成单链DNA至关重要.在原核生物中并没有发现Cdc45的高度序列同源蛋白.关于Cdc45的进化来源一直是一个谜.最近人Cdc45蛋白结构的解析为进一步认识其功能、寻找其进化祖先提供了基础.通过序列比对与蛋白结构解析,发现古菌RecJ核酸酶在三维结构与保守motif层面都与人Cdc45高度相似,很可能是真核Cdc45蛋白的进化祖先.古菌RecJ核酸酶与真核细胞Cdc45蛋白都具有典型的DHH与DHHA1结构域,这一点与细菌RecJ核酸酶也非常相似.与细菌RecJ不同之处是二者都编码一个额外的结构域CID(CMG-Interaction-Domain).与Cdc45蛋白不同,RecJ具有典型的核酸酶活性,对单链DNA与单链RNA均有活性.因与GINS有相互作用,其活性还受GINS促进.

摘要： 细胞分裂周期蛋白Cdc45作为复制型解螺旋酶复合物CMG(Cdc45-MCM helicase-GINS)的核心亚基之一,对基因组DNA解链成单链DNA至关重要.在原核生物中并没有发现Cdc45的高度序列同源蛋白.关于Cdc45的进化来源一直是一个谜.最近人Cdc45蛋白结构的解析为进一步认识其功能、寻找其进化祖先提供了基础.通过序列比对与蛋白结构解析,发现古菌RecJ核酸酶在三维结构与保守motif层面都与人Cdc45高度相似,很可能是真核Cdc45蛋白的进化祖先.古菌RecJ核酸酶与真核细胞Cdc45蛋白都具有典型的DHH与DHHA1结构域,这一点与细菌RecJ核酸酶也非常相似.与细菌RecJ不同之处是二者都编码一个额外的结构域CID(CMG-Interaction-Domain).与Cdc45蛋白不同,RecJ具有典型的核酸酶活性,对单链DNA与单链RNA均有活性.因与GINS有相互作用,其活性还受GINS促进.

摘要： 细胞分裂周期蛋白Cdc45作为复制型解螺旋酶复合物CMG(Cdc45-MCM helicase-GINS)的核心亚基之一,对基因组DNA解链成单链DNA至关重要.在原核生物中并没有发现Cdc45的高度序列同源蛋白.关于Cdc45的进化来源一直是一个谜.最近人Cdc45蛋白结构的解析为进一步认识其功能、寻找其进化祖先提供了基础.通过序列比对与蛋白结构解析,发现古菌RecJ核酸酶在三维结构与保守motif层面都与人Cdc45高度相似,很可能是真核Cdc45蛋白的进化祖先.古菌RecJ核酸酶与真核细胞Cdc45蛋白都具有典型的DHH与DHHA1结构域,这一点与细菌RecJ核酸酶也非常相似.与细菌RecJ不同之处是二者都编码一个额外的结构域CID(CMG-Interaction-Domain).与Cdc45蛋白不同,RecJ具有典型的核酸酶活性,对单链DNA与单链RNA均有活性.因与GINS有相互作用,其活性还受GINS促进.

摘要： 细胞分裂周期蛋白Cdc45作为复制型解螺旋酶复合物CMG(Cdc45-MCM helicase-GINS)的核心亚基之一,对基因组DNA解链成单链DNA至关重要.在原核生物中并没有发现Cdc45的高度序列同源蛋白.关于Cdc45的进化来源一直是一个谜.最近人Cdc45蛋白结构的解析为进一步认识其功能、寻找其进化祖先提供了基础.通过序列比对与蛋白结构解析,发现古菌RecJ核酸酶在三维结构与保守motif层面都与人Cdc45高度相似,很可能是真核Cdc45蛋白的进化祖先.古菌RecJ核酸酶与真核细胞Cdc45蛋白都具有典型的DHH与DHHA1结构域,这一点与细菌RecJ核酸酶也非常相似.与细菌RecJ不同之处是二者都编码一个额外的结构域CID(CMG-Interaction-Domain).与Cdc45蛋白不同,RecJ具有典型的核酸酶活性,对单链DNA与单链RNA均有活性.因与GINS有相互作用,其活性还受GINS促进.

摘要： 本发明涉及用于真核细胞的有效正交翻译系统。具体地，本发明涉及真核细胞，其包含编码原核tRNA合成酶(pRS)的多核苷酸和包含原核tRNA(ptRNA)和一种或多于一种核酶(本文中称为“ptRNA‑核酶”)的RNA分子。本发明还涉及通过这样的真核细胞表达包含一个或多个非典型氨基酸(ncAA)残基的感兴趣的多肽(POI)的方法，以及用于这样的方法的试剂盒。本发明进一步涉及编码ptRNA‑核酶的多核苷酸。

摘要： 本发明涉及一种分离共生进化枝甲烷马赛球菌(Methanomassiliicoccales)目古菌的方法，包含埃格特菌(Eggerthella)属细菌的细菌培养物的无菌提取物的培养物和/或分离培养基用于分离和/或培养共生进化枝甲烷马赛球菌目古菌的用途，以及一种纯的分离的古菌Methanomethylophilus alvus Mx‑05。本发明还涉及共生进化枝甲烷马赛球菌目古菌的培养方法。

摘要： 适于低温微氧环境生长的古细菌培养装置，属于微生物学技术领域，由可调微氧培养盒（22）、恒温光照培养箱（19）和抽气泵（26）组成，其特征在于：所述的可调微氧培养盒（22）包括盛水盒（1）、控氧水（2）、调气管（3）、刻度限氧筒（4）、泡沫浮力块（5）、培养皿（6）、调气管皮堵（7）、盛水盒壁（8）、盛水盒腔（9）和微氧空间（10），盛水盒（1）中盛放控氧水（2），刻度限氧筒（4）开口朝下插入控氧水（2）中，在刻度限氧筒（4）底部形成微氧空间（10），粘附在泡沫浮力块（5）上的培养皿（6）悬浮在控氧水（2）的上表面。适于低温微氧环境生长的古细菌培养装置制作简单，可操作性强，成本低廉，效果明显。

摘要： 本发明属于分子生物学技术领域，具体提供一种来源于嗜热古细菌Geoglobus acetivorans的DNA连接酶高活性突变体，并通过将该DNA连接酶高活性突变体导入到大肠杆菌中，构建了重组表达该DNA连接酶高活性突变体的大肠杆菌工程菌。同野生型的Geoglobus acetivorans DNA连接酶相比，该DNA连接酶高活性突变体具有更高的活性，可以作为分子生物试剂，应用于分子克隆和二代测序建库技术等方面。

摘要： 本发明属于分子生物学技术领域，具体提供一种来源于不可培养微生物嗜盐古细菌SCGC‑AAA259I14的转座酶高活性突变体，并通过将该转座酶高活性突变体导入到大肠杆菌中，构建了重组表达该转座酶高活性突变体的大肠杆菌工程菌。所述大肠杆菌工程菌能够高效的表达转座酶高活性突变体。同大肠杆菌Tn5转座酶高活性突变体相比，重组转座酶高活性突变体具有更好的稳定性，能够显著降低纯化成本，可以作为分子生物试剂，应用于体外转座和二代测序建库技术等方面。

摘要： 本发明涉及一种食品补充剂，其包括用作动物饲料益生菌添加剂的古细菌尤其是产甲烷古细菌或由其组成。所述补充剂可以在标准饲料之余提供给例如养殖动物或者作为食品组合物。该补充剂尤其在水产养殖上有作用，且证明能够提高动物生长速率、降低动物对寄生虫感染的敏感性和/或改善动物粪便废物对环境的影响。本发明还包括制备包含所述生物活性食品补充剂的组合物的方法及其应用。

摘要： 本申请涉及使用CRISPR核酸来筛选细菌、古细菌、藻类和/或酵母中的必需基因和非必需基因以及可消耗基因组岛、来杀灭细菌、古细菌、藻类和/或酵母、来鉴定一种或多种基因的表型、和/或来筛选细菌、古细菌、藻类和/或酵母中的基因组大小减小和/或基因缺失。

摘要： 本发明涉及一种用于治疗或预防帕金森病症的产甲烷古细菌的含铁氢化酶抑制剂，其中所述古细菌存在于受试者的肠道中，其特征在于产生2‑羟基吡啶。此外，本发明涉及包含此类抑制剂的药物组合物和包含此类抑制剂的试剂盒。此外，本发明涉及筛选根据本发明所使用的抑制剂的方法和确定受试者是否对根据本发明所使用的抑制剂进行的治疗敏感的方法。

摘要： 本发明公开了一种由硫化叶菌细胞培养物生产包含古细菌脂质的组合物的方法，包括：(1)在75～85°C和0.025～0.035/h的生长速率的条件下培养硫化叶菌细胞培养物，并从古细菌培养物中提取古细菌脂质，以获得用于口服缓释疗法的组合物，或(2)在75～85°C和0.005～0.015/h的生长速率的条件下培养硫化叶菌细胞培养物，并从古细菌培养物中提取古细菌脂质，以获得用于口服急性疗法的组合物；以及通过这种方法获得的组合物。

摘要： 本公开提供免疫原性组合物，其包含：a)丙型肝炎病毒(HCV)E1E2异二聚体、HCV E2或HCV E1；和b)佐剂，其中所述佐剂是环状二核苷酸或古细菌脂质体。本公开提供在个体中诱导对HCV的免疫应答的方法，所述方法包括向个体施用本公开的有效量的免疫原性组合物。