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基于高通量靶向测序分析肿瘤突变负荷的方法

摘要

本公开涉及一种基于高通量靶向测序数据分析肿瘤突变负荷的方法和系统,所述方法包括以下步骤:通过高通量靶向测序对肿瘤样本和配对对照样本中的靶基因的选定外显子和上下游区域的序列进行测序;通过将从所述肿瘤样本和配对对照样本获得的序列数据与人类参考基因组序列进行比对,计算肿瘤样本中所述靶基因的选定外显子和上下游区域的序列中体细胞突变的数量;以及将所述靶基因的选定外显子和上下游区域中的突变数量相加以获得总突变数量,并将所述靶基因的选定外显子和上下游区域的长度相加以获得总区域长度(Mb),通过以下公式计算TMB:TMB=总突变数目/总区域长度。

著录项

  • 公开/公告号CN110343748B

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2020-05-26

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 广州燃石医学检验所有限公司;

    申请/专利号CN201910728941.X

  • 申请日2019-08-08

  • 分类号

  • 代理机构北京市柳沈律师事务所;

  • 代理人张晓飞

  • 地址 510320 广东省广州市广州国际生物岛螺旋四路7号3栋第六层601房

  • 入库时间 2022-08-23 10:59:48

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2020-05-26

    授权

    授权

  • 2019-11-12

    实质审查的生效 IPC(主分类):C12Q1/6858 申请日:20190808

    实质审查的生效

  • 2019-10-18

    公开

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