新的腺相关病毒(AAV)变体及其在基因治疗中的用途

摘要

腺相关病毒(AAV)是一种缺陷型单链DNA病毒，在人群中流行(35‑80％)。复发性克隆AAV2插入与正常肝脏中发生的罕见人肝细胞癌(HCC)的发病机制有关。发明人的目的是表征肝脏中AAV感染的自然史。因此，在1461名患者的肿瘤和非肿瘤肝组织中对病毒DNA进行量化。使用基于DNAse/TaqMan的测定和定量RT‑PCR分析附加体形式的存在和病毒mRNA表达。使用病毒捕获数据的计算机分析鉴定了病毒变体和新的克隆插入。在21％的患者中检测到AAV DNA，平均分布在两种主要病毒亚型中：一种类似于AAV2，另一种是AAV2和AAV13序列之间的杂交体。因此，发明人通过鉴定病毒基因型、分子形式、辅助病毒关系和病毒整合提供了对肝脏中野生型AAV感染的综合分析。这些发现对于理解野生型AAV生物学很重要，特别是相关地考虑到AAV载体在肝脏靶向基因治疗中的大量使用。因此，本发明涉及新的腺相关病毒(AAV)变体及其用于基因治疗的用途。