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基于高通量测序技术的宿主中病毒来源sRNA数据分析方法

摘要

本发明提出了一种基于高通量测序技术的宿主中病毒来源sRNA数据分析方法,包括文件准备步骤、下机数据质控步骤、病毒参考基因组比对以及病毒sRNA注释步骤、病毒sRNA定量步骤、差异病毒sRNA分析步骤、宿主靶基因预测步骤、富集分析步骤、网页版报告整理步骤。本发明结果全面,包含涉及到的病毒sRNA分析内容以及其宿主靶基因预测,GO、KEGG富集分析以及对应的可视化展示;自动整理所有分析结果,每一步分析完成之后自动对结果进行汇总统计、可视化以及逻辑化归类整理,结果文件可直接用于生成网页版报告,所有操作步骤可以溯源,方便错误查询,如果分析有报错,会生成对应的报错日志信息。

著录项

  • 公开/公告号CN113066532A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2021-07-02

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 上海欧易生物医学科技有限公司;

    申请/专利号CN202110354949.1

  • 申请日2021-04-01

  • 分类号G16B20/30(20190101);G16B30/10(20190101);G16B45/00(20190101);

  • 代理机构31319 上海德禾翰通律师事务所;

  • 代理人夏思秋

  • 地址 201114 上海市闵行区浦江镇新骏环路138号5幢302室

  • 入库时间 2023-06-19 11:42:32

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2022-08-26

    授权

    发明专利权授予

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