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SNaPBceBcon: a Practical Tool for Identification and Genotyping of Burkholderia cepacia and Burkholderia contaminans

机译:SNaPBceBcon:鉴定洋葱伯克霍尔德氏菌和污染伯克霍尔德氏菌的实用工具

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摘要

We propose an optimized protocol for an extensive population analysis of Burkholderia cepacia and Burkholderia contaminans. Seven new polymorphisms were added to the recently proposed SNaPBcen assay, and a total of 18 markers ensured the clear identification and distinction of B. cepacia and B. contaminans isolates and high genotypic discrimination (Simpson index of 0.94) compared to those for multilocus sequence typing.
机译:我们提出了一种优化的方案,用于对洋葱伯克霍尔德菌和污染伯克霍尔德菌的广泛人群进行分析。与最近提出的SNaPBcen分析相比,新的七种多态性被添加到了一起,与多位点序列分型相比,总共有18种标记确保了对洋葱伯克霍尔德菌和污染毕赤酵母菌的分离物的清晰鉴定和高基因型歧视(辛普森指数为0.94)。 。

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