油桐β-酮脂酰-CoA合成酶(KCS)基因的克隆与序列分析

摘要

为给油桐β-酮脂酰-CoA合成酶基因(KCS)结构和功能的研究提供参考,以油桐种子为材料,根据油桐转录组测序分析结果设计引物,利用RT-PCR技术克隆KCS基因,并进行了序列分析.获得了1条KCS基因的全长cDNA,命名为Vf_CS.KCS基因的CDS长度为1 338 bp,编码446个氨基酸.该基因编码的蛋白质具有3个酶活性位点、6个产物结合位点、5个丙二酰-CoA结合位点和多个二聚体形成位点;Vf KCS有2个明显的跨膜螺旋拓扑结构和3个疑似跨膜螺旋拓扑结构;二级结构主要由α-螺旋、β-折叠和不规则卷曲构成,该蛋白为亲水性蛋白.Vf_KCS编码的氨基酸序列与其它物种的KCS氨基酸序列具有较高的相似性,其中与葡萄的KCS基因相似度最高达89.69％,与其它植物的KCS基因所编码的氨基酸同源性大多在80％以上.进化树分析结果表明,Vf KCS与拟南芥亲缘关系最为接近.预测分析结果表明,该酶有高度保守的催化区域.