油桐丙二酰单酰CoA:ACP转酰基酶的克隆与序列分析

摘要

为了深入了解油桐丙二酰单酰辅酶A酰基载体蛋白转酰基酶(Malonyl CoA:ACP transacylase,MCAT)在油脂合成代谢过程中的作用,利用RT-PCR技术克隆获得了油桐MCAT基因序列,且命名为VfMCAT,并利用相关生物软件对该基因序列及其相应蛋白质进行了生物信息学分析.结果表明:VfMCAT的CDS长为1 179bp,编码392个氨基酸;该蛋白与蓖麻和亚麻的MCAT同源性均达85％,存在“GXSXG”和“GQGXQ”两个高度保守的motif,在系统进化关系上,其与蓖麻和亚麻的亲缘关系最为接近;分析其氨基酸序列后发现,VfMCAT的分子量约为41.67 KDa,理论等电点pI为8.43,是一个含有一个跨膜结构域的可溶性稳定蛋白;对其二级和三级结构的预测结果表明,该蛋白主要以α-螺旋和无规则卷曲为主,且最有可能在线粒体中发挥其主要作用,文中由此推测,VfMCAT在叶绿体中参与了油桐脂肪酸合成代谢.