非小细胞肺癌患者外周血外泌体中差异表达的微小RNAs研究

摘要

背景目前,临床上尚缺乏早期、有效诊断非小细胞肺癌(NSCLC)的指标,来源于癌组织的外泌体及其内部物质因可反映亲本细胞性质而有望成为早期诊断肿瘤的生物学标志物。目的通过高通量测序技术筛选NSCLC患者外周血外泌体中差异表达的微小RNAs(miRNAs)。方法收集2018年1月-2019年1月于深圳市人民医院就诊的4例NSCLC患者的外周血样品,其中肺腺癌(LUAD)2例、肺鳞状细胞癌(LUSC)2例;另收集同期4例健康志愿者的外周血样品作为对照。采用HiSeq 2500高通量测序仪进行miRNAs测序,采用DESeq2软件筛选差异表达的miRNAs;在癌症基因组图谱(TCCGA)中选取并比较39对LUAD组织及其配对癌旁正常组织、45对LUSC组织及其配对癌旁正常组织miRNA-9-3p测序结果。结果(1)高通量测序结果显示,4例NSCLC患者外周血外泌体中平均检测到776种miRNAs,4例健康志愿者外周血外泌体中平均检测到238种miRNAs。(2)LUAD与LUSC患者外周血外泌体中差异表达最显著的10种miRNAs中有6种是重合的,分别为miRNA-1228-5p、miRNA-129-5p、miRNA-760、miRNA-885-3p、miRNA-9-3p、miRNA-95-3p。(3)LUSC-1、LUSC-2、LUAD-1及LUAD-2外周血外泌体中miRNA-9-3p表达量分别为71.51、15.61、13.99、16.11转录本数,4例健康志愿者外周血外泌体中miRNA-9-3p表达量均为0。TCCGA中LUAD组织和LUSC组织miRNA-9-3p表达量均高于其配对癌旁正常组织(P<0.01)。结论通过高通量测序技术发现miRNA-1228-5p、miRNA-129-5p、miRNA-760、miRNA-885-3p、miRNA-9-3p、miRNA-95-3p可能是NSCLC患者潜在的特异性miRNAs,其中miRNA-9-3p主要来源于NSCLC患者癌组织,这为后续通过外周血外泌体miRNAs测序而实现NSCLC的早期、无创诊断奠定了研究基础。