四川凉山苦荞种子携带细菌多样性

摘要

苦荞Fagopyrum tataricum是四川省凉山彝族自治州主要的粮食作物之一,作为近年来新兴的保健食品,其种子携带的细菌种群鲜有报道。本研究从凉山州7个县的苦荞主产区共采集了46份苦荞种子样品,通过分离培养法及基于16S rRNA基因的扩增子测序法,对苦荞种子携带的主要细菌类群进行了研究。结果显示:分离培养法从46份样品中共获得618株细菌分离物,隶属于10个属,其中泛菌属Pantoea和短小杆菌属Curtobacterium分离频率最高,分别为52.5%和20.7%,是种子携带的优势菌群。扩增子测序法从13份样品中共获得279个属的细菌,其中泛菌属为优势菌群。通过样本层级聚类分析,发现来自冕宁县的苦荞种子样品MNCQ-4携带的细菌丰富度与多样性最大,而来自昭觉县的样品ZJ-5最小。研究结果表明,同一个地区的不同样品,菌群多样性也存在差异。本研究丰富了荞麦种带细菌的研究,为种子处理、病害防治提供了依据。